Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09680
• Subject: XM_006712331.3
• Aligned Length: 1872
• Identities: 1867
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGAGCCACCCCAAGAGACAAATAGGCCTTTCAGCACACTTGATAACCGCAGCGGGCAGGTCCAAGTCCTGTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCCACCCCAAGAGACAAATAGGCCTTTCAGCACACTTGATAACCGCAGCGGGCAGGTCCAAGTCCTGTC  74

Query   75  CGCCACCCCGCTATTGCAGAGGAATCCCTACAGCAGCCCGGATATCATGCACATTAAAGGGTCGGAGGCTTCTT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGCCACCCCGCTATTGCAGAGGAATCCCTACAGCAGCCCGGATATCATGCACATTAAAGGGTCGGAGGCTTCTT  148

Query  149  CGGTCCCTTACGCCCTGAACCAGGGCACGACGGCCCTGCCTAAGAACAAGAACCAGGAGGGCACCGGGCACCGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGGTCCCTTACGCCCTGAACCAGGGCACGACGGCCCTGCCTAAGAACAAGAACCAGGAGGGCACCGGGCACCGG  222

Query  223  CTGCTGAACATGCTGAGAAAAACTCTTAAAGAGTCTGATAGTGAAGAACTGGAAATAACACAGGAGACACCAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  CTGCTGAACATGCTGAGAAAAACTCTTAAAGAGTCTGATAGTGAAGAACTGGAAATAACACAGGAGACGCCAAA  296

Query  297  TTTGGTGCCATTTGGGGATGTGGTTGGCTGCCTGGGCATTCATATAAAGAACTGCAGACATTTTATGCCTAAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTTGGTGCCATTTGGGGATGTGGTTGGCTGCCTGGGCATTCATATAAAGAACTGCAGACATTTTATGCCTAAGA  370

Query  371  TCAGTTTACAACATTATGCTAATTTATTCATTCGCATCTCTATAAACAAAGCTGTGAAATGTACAAAAATGTGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAGTTTACAACATTATGCTAATTTATTCATTCGCATCTCTATAAACAAAGCTGTGAAATGTACAAAAATGTGT  444

Query  445  AGCTTGCTATCCAAAAACGATGAGAAGAACACTGTAATTAAGTTCGATGAAGTGAAGTATTTTTCTGTACAGGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGCTTGCTATCCAAAAACGATGAGAAGAACACTGTAATTAAGTTCGATGAAGTGAAGTATTTTTCTGTACAGGT  518

Query  519  TCCCAGACGTTATGATGATAAGCGGAATAATATTTTATTGGAACTCATACAATATGACAATAGAGAAAAACGTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCCAGACGTTATGATGATAAGCGGAATAATATTTTATTGGAACTCATACAATATGACAATAGAGAAAAACGTG  592

Query  593  CTTTCTTGTTAGGGAGTGTTCAGATACATCTTTATGAGGTAATTCAGAAAGGGTGCTTCATTGAAGAGGTCCAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTTTCTTGTTAGGGAGTGTTCAGATACATCTTTATGAGGTAATTCAGAAAGGGTGCTTCATTGAAGAGGTCCAA  666

Query  667  GTGTTGCATGGAAACATATTTGTCTGCAGGCTGGAGGTGGAATTTATGTTCTCCTATGGAAACTTTGGTTATGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGTTGCATGGAAACATATTTGTCTGCAGGCTGGAGGTGGAATTTATGTTCTCCTATGGAAACTTTGGTTATGG  740

Query  741  ATTTTCACATCAGTTAAAACCTCTTCAGAAAATTACTGAGCCATCCATGTTTATGAATCTTGCACCACCTCCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATTTTCACATCAGTTAAAACCTCTTCAGAAAATTACTGAGCCATCCATGTTTATGAATCTTGCACCACCTCCAG  814

Query  815  AAAGAACAGATCCCGTGACAAAAGTTATTACACCACAGACAGTAGAATATCCAGCATTCTTATCCCCAGACCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAAGAACAGATCCCGTGACAAAAGTTATTACACCACAGACAGTAGAATATCCAGCATTCTTATCCCCAGACCTG  888

Query  889  AATGTTACTGTTGGGACTCCAGCTGTGCAATCCTCCAACCAGCCATCTGTAGTGCGACTTGAAAAACTTCAGCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AATGTTACTGTTGGGACTCCAGCTGTGCAATCCTCCAACCAGCCATCTGTAGTGCGACTTGAAAAACTTCAGCA  962

Query  963  ACAACCCCGGGAAAGGCTGGAAAAGATGAAAAAAGAATATAGAAATCTGAATACATGGATAGATAAAGCTAACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACAACCCCGGGAAAGGCTGGAAAAGATGAAAAAAGAATATAGAAATCTGAATACATGGATAGATAAAGCTAACT  1036

Query 1037  ATTTAGAAAGCATTCTAATGCCAAAATTGGAACATAAGGATTCTGAGGAAACTAATATAGATGAGGCATCTGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATTTAGAAAGCATTCTAATGCCAAAATTGGAACATAAGGATTCTGAGGAAACTAATATAGATGAGGCATCTGAA  1110

Query 1111  AACACGAAAAGTAATCAACCTGAAGAGGAGCTTGAAAATATTGTAGGAGT---AGATATCCCTCTTGTAAATGA  1181
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACACGAAAAGTAATCATCCTGAAGAGGAGCTTGAAAATATTGTAGGAGTAGCAGATATCCCTCTTGTAAATGA  1184

Query 1182  GGAAGCTGAAACTACTGCAAATGAGTTACTGGATAATGATTCTGAGAAAGGCCTGACTATACCAACTTTGAACC  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAAGCTGAAACTACTGCAAATGAGTTACTGGATAATGATTCTGAGAAAGGCCTGACTATACCAACTTTGAACC  1258

Query 1256  AATCGGACCAAGATAATTCAACTGCTGATGCTTCTAAAAATGATGAATCAACACCTTCACCCACAGAAGTGCAC  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AATCGGACCAAGATAATTCAACTGCTGATGCTTCTAAAAATGATGAATCAACACCTTCACCCACAGAAGTGCAC  1332

Query 1330  TCATTGTGCACTATTTCTAACCAGGAAACAATAAAAGCAGGCAGAATACCACCTTTAGGTGAACGTCAATCAGA  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCATTGTGCACTATTTCTAACCAGGAAACAATAAAAGCAGGCAGAATACCACCTTTAGGTGAACGTCAATCAGA  1406

Query 1404  AAGCATGCCAGACAGAAAAATGAAAAATGTATTTTTTCCATTAGAAGTAAAATTAAAAGATAACTATCCAAGCA  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AAGCATGCCAGACAGAAAAATGAAAAATGTATTTTTTCCATTAGAAGTAAAATTAAAAGATAACTATCCAAGCA  1480

Query 1478  TTTTAAAAGCAGACTCATCTCTATCAGAGGTGGCTTTTTCACCAAAAGAATATAATTCACCATCTTTCAGACCA  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTTTAAAAGCAGACTCATCTCTATCAGAGGTGGCTTTTTCACCAAAAGAATATAATTCACCATCTTTCAGACCA  1554

Query 1552  GAATATATAGAATTCAAACCAAAATTTCAGGATTGTTCAGATAAATTTGAGGATTTACATGACATGACCTCATT  1625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAATATATAGAATTCAAACCAAAATTTCAGGATTGTTCAGATAAATTTGAGGATTTACATGACATGACCTCATT  1628

Query 1626  TACACACCTTAAAAAAGTAAAATCAAGATCAAGGCTTTTAGGAAAAAGCTCAGATGATATCCATAACCATGCCA  1699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TACACACCTTAAAAAAGTAAAATCAAGATCAAGGCTTTTAGGAAAAAGCTCAGATGATATCCATAACCATGCCA  1702

Query 1700  GACACTCTGCAAGACCATATACTGCTCCGGAGGTTAACAAGCAACGAGAAAGCTACAGTGGAAAGTTTACAAGT  1773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GACACTCTGCAAGACCATATACTGCTCCGGAGGTTAACAAGCAACGAGAAAGCTACAGTGGAAAGTTTACAAGT  1776

Query 1774  CGTCGAATGGTTTCATCAGGCTTAGTTCATATAAATGATAAAACATCAGATTATGAAATGCATAAAATGCGGCC  1847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CGTCGAATGGTTTCATCAGGCTTAGTTCATATAAATGATAAAACATCAGATTATGAAATGCATAAAATGCGGCC  1850

Query 1848  AAAAAAAATTAAAAGAGGATAT  1869
            ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AAAAAAAATTAAAAGAGGATAT  1872