Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09680
- Subject:
- XM_006712333.3
- Aligned Length:
- 1872
- Identities:
- 1408
- Gaps:
- 462
Alignment
Query 1 ATGGAGCCACCCCAAGAGACAAATAGGCCTTTCAGCACACTTGATAACCGCAGCGGGCAGGTCCAAGTCCTGTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGCCACCCCAAGAGACAAATAGGCCTTTCAGCACACTTGATAACCGCAGCGGGCAGGTCCAAGTCCTGTC 74
Query 75 CGCCACCCCGCTATTGCAGAGGAATCCCTACAGCAGCCCGGATATCATGCACATTAAAGGGTCGGAGGCTTCTT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGCCACCCCGCTATTGCAGAGGAATCCCTACAGCAGCCCGGATATCATGCACATTAAAGGGTCGGAGGCTTCTT 148
Query 149 CGGTCCCTTACGCCCTGAACCAGGGCACGACGGCCCTGCCTAAGAACAAGAACCAGGAGGGCACCGGGCACCGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CGGTCCCTTACGCCCTGAACCAGGGCACGACGGCCCTGCCTAAGAACAAGAACCAGGAGGGCACCGGGCACCGG 222
Query 223 CTGCTGAACATGCTGAGAAAAACTCTTAAAGAGTCTGATAGTGAAGAACTGGAAATAACACAGGAGACACCAAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 223 CTGCTGAACATGCTGAGAAAAACTCTTAAAGAGTCTGATAGTGAAGAACTGGAAATAACACAGGAGACGCCAAA 296
Query 297 TTTGGTGCCATTTGGGGATGTGGTTGGCTGCCTGGGCATTCATATAAAGAACTGCAGACATTTTATGCCTAAGA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTTGGTGCCATTTGGGGATGTGGTTGGCTGCCTGGGCATTCATATAAAGAACTGCAGACATTTTATGCCTAAGA 370
Query 371 TCAGTTTACAACATTATGCTAATTTATTCATTCGCATCTCTATAAACAAAGCTGTGAAATGTACAAAAATGTGT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCAGTTTACAACATTATGCTAATTTATTCATTCGCATCTCTATAAACAAAGCTGTGAAATGTACAAAAATGTGT 444
Query 445 AGCTTGCTATCCAAAAACGATGAGAAGAACACTGTAATTAAGTTCGATGAAGTGAAGTATTTTTCTGTACAGGT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGCTTGCTATCCAAAAACGATGAGAAGAACACTGTAATTAAGTTCGATGAAGTGAAGTATTTTTCTGTACAGGT 518
Query 519 TCCCAGACGTTATGATGATAAGCGGAATAATATTTTATTGGAACTCATACAATATGACAATAGAGAAAAACGTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCCCAGACGTTATGATGATAAGCGGAATAATATTTTATTGGAACTCATACAATATGACAATAGAGAAAAACGTG 592
Query 593 CTTTCTTGTTAGGGAGTGTTCAGATACATCTTTATGAGGTAATTCAGAAAGGGTGCTTCATTGAAGAGGTCCAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTTTCTTGTTAGGGAGTGTTCAGATACATCTTTATGAGGTAATTCAGAAAGGGTGCTTCATTGAAGAGGTCCAA 666
Query 667 GTGTTGCATGGAAACATATTTGTCTGCAGGCTGGAGGTGGAATTTATGTTCTCCTATGGAAACTTTGGTTATGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTGTTGCATGGAAACATATTTGTCTGCAGGCTGGAGGTGGAATTTATGTTCTCCTATGGAAACTTTGGTTATGG 740
Query 741 ATTTTCACATCAGTTAAAACCTCTTCAGAAAATTACTGAGCCATCCATGTTTATGAATCTTGCACCACCTCCAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATTTTCACATCAGTTAAAACCTCTTCAGAAAATTACTGAGCCATCCATGTTTATGAATCTTGCACCACCTCCAG 814
Query 815 AAAGAACAGATCCCGTGACAAAAGTTATTACACCACAGACAGTAGAATATCCAGCATTCTTATCCCCAGACCTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAAGAACAGATCCCGTGACAAAAGTTATTACACCACAGACAGTAGAATATCCAGCATTCTTATCCCCAGACCTG 888
Query 889 AATGTTACTGTTGGGACTCCAGCTGTGCAATCCTCCAACCAGCCATCTGTAGTGCGACTTGAAAAACTTCAGCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AATGTTACTGTTGGGACTCCAGCTGTGCAATCCTCCAACCAGCCATCTGTAGTGCGACTTGAAAAACTTCAGCA 962
Query 963 ACAACCCCGGGAAAGGCTGGAAAAGATGAAAAAAGAATATAGAAATCTGAATACATGGATAGATAAAGCTAACT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACAACCCCGGGAAAGGCTGGAAAAGATGAAAAAAGAATATAGAAATCTGAATACATGGATAGATAAAGCTAACT 1036
Query 1037 ATTTAGAAAGCATTCTAATGCCAAAATTGGAACATAAGGATTCTGAGGAAACTAATATAGATGAGGCATCTGAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATTTAGAAAGCATTCTAATGCCAAAATTGGAACATAAGGATTCTGAGGAAACTAATATAGATGAGGCATCTGAA 1110
Query 1111 AACACGAAAAGTAATCAACCTGAAGAGGAGCTTGAAAATATTGTAGGAGT---AGATATCCCTCTTGTAAATGA 1181
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AACACGAAAAGTAATCATCCTGAAGAGGAGCTTGAAAATATTGTAGGAGTAGCAGATATCCCTCTTGTAAATGA 1184
Query 1182 GGAAGCTGAAACTACTGCAAATGAGTTACTGGATAATGATTCTGAGAAAGGCCTGACTATACCAACTTTGAACC 1255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGAAGCTGAAACTACTGCAAATGAGTTACTGGATAATGATTCTGAGAAAGGCCTGACTATACCAACTTTGAACC 1258
Query 1256 AATCGGACCAAGATAATTCAACTGCTGATGCTTCTAAAAATGATGAATCAACACCTTCACCCACAGAAGTGCAC 1329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AATCGGACCAAGATAATTCAACTGCTGATGCTTCTAAAAATGATGAATCAACACCTTCACCCACAGAAGTGCAC 1332
Query 1330 TCATTGTGCACTATTTCTAACCAGGAAACAATAAAAGCAGGCAGAATACCACCTTTAGGTGAACGTCAATCAGA 1403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TCATTGTGCACTATTTCTAACCAGGAAACAATAAAAGCAGGCAGAATACCACCTTT------------------ 1388
Query 1404 AAGCATGCCAGACAGAAAAATGAAAAATGTATTTTTTCCATTAGAAGTAAAATTAAAAGATAACTATCCAAGCA 1477
Sbjct 1389 -------------------------------------------------------------------------- 1388
Query 1478 TTTTAAAAGCAGACTCATCTCTATCAGAGGTGGCTTTTTCACCAAAAGAATATAATTCACCATCTTTCAGACCA 1551
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1389 ---------------------------AGGTGGCTTTTTCACCAAAAGAATA---------------------- 1413
Query 1552 GAATATATAGAATTCAAACCAAAATTTCAGGATTGTTCAGATAAATTTGAGGATTTACATGACATGACCTCATT 1625
Sbjct 1414 -------------------------------------------------------------------------- 1413
Query 1626 TACACACCTTAAAAAAGTAAAATCAAGATCAAGGCTTTTAGGAAAAAGCTCAGATGATATCCATAACCATGCCA 1699
Sbjct 1414 -------------------------------------------------------------------------- 1413
Query 1700 GACACTCTGCAAGACCATATACTGCTCCGGAGGTTAACAAGCAACGAGAAAGCTACAGTGGAAAGTTTACAAGT 1773
Sbjct 1414 -------------------------------------------------------------------------- 1413
Query 1774 CGTCGAATGGTTTCATCAGGCTTAGTTCATATAAATGATAAAACATCAGATTATGAAATGCATAAAATGCGGCC 1847
Sbjct 1414 -------------------------------------------------------------------------- 1413
Query 1848 AAAAAAAATTAAAAGAGGATAT 1869
Sbjct 1414 ---------------------- 1413