Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09680
• Subject: XM_024452728.1
• Aligned Length: 1869
• Identities: 1792
• Gaps: 75

Alignment

Query    1  ATGGAGCCACCCCAAGAGACAAATAGGCCTTTCAGCACACTTGATAACCGCAGCGGGCAGGTCCAAGTCCTGTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCCACCCCAAGAGACAAATAGGCCTTTCAGCACACTTGATAACCGCAGCGGGCAGGTCCAAGTCCTGTC  74

Query   75  CGCCACCCCGCTATTGCAGAGGAATCCCTACAGCAGCCCGGATATCATGCACATTAAAGGGTCGGAGGCTTCTT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGCCACCCCGCTATTGCAGAGGAATCCCTACAGCAGCCCGGATATCATGCACATTAAAGGGTCGGAGGCTTCTT  148

Query  149  CGGTCCCTTACGCCCTGAACCAGGGCACGACGGCCCTGCCTAAGAACAAGAACCAGGAGGGCACCGGGCACCGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGGTCCCTTACGCCCTGAACCAGGGCACGACGGCCCTGCCTAAGAACAAGAACCAGGAGGGCACCGGGCACCGG  222

Query  223  CTGCTGAACATGCTGAGAAAAACTCTTAAAGAGTCTGATAGTGAAGAACTGGAAATAACACAGGAGACACCAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  CTGCTGAACATGCTGAGAAAAACTCTTAAAGAGTCTGATAGTGAAGAACTGGAAATAACACAGGAGACGCCAAA  296

Query  297  TTTGGTGCCATTTGGGGATGTGGTTGGCTGCCTGGGCATTCATATAAAGAACTGCAGACATTTTATGCCTAAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTTGGTGCCATTTGGGGATGTGGTTGGCTGCCTGGGCATTCATATAAAGAACTGCAGACATTTTATGCCTAAGA  370

Query  371  TCAGTTTACAACATTATGCTAATTTATTCATTCGCATCTCTATAAACAAAGCTGTGAAATGTACAAAAATGTGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAGTTTACAACATTATGCTAATTTATTCATTCGCATCTCTATAAACAAAGCTGTGAAATGTACAAAAATGTGT  444

Query  445  AGCTTGCTATCCAAAAACGATGAGAAGAACACTGTAATTAAGTTCGATGAAGTGAAGTATTTTTCTGTACAGGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGCTTGCTATCCAAAAACGATGAGAAGAACACTGTAATTAAGTTCGATGAAGTGAAGTATTTTTCTGTACAGGT  518

Query  519  TCCCAGACGTTATGATGATAAGCGGAATAATATTTTATTGGAACTCATACAATATGACAATAGAGAAAAACGTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCCAGACGTTATGATGATAAGCGGAATAATATTTTATTGGAACTCATACAATATGACAATAGAGAAAAACGTG  592

Query  593  CTTTCTTGTTAGGGAGTGTTCAGATACATCTTTATGAGGTAATTCAGAAAGGGTGCTTCATTGAAGAGGTCCAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTTTCTTGTTAGGGAGTGTTCAGATACATCTTTATGAGGTAATTCAGAAAGGGTGCTTCATTGAAGAGGTCCAA  666

Query  667  GTGTTGCATGGAAACATATTTGTCTGCAGGCTGGAGGTGGAATTTATGTTCTCCTATGGAAACTTTGGTTATGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGTTGCATGGAAACATATTTGTCTGCAGGCTGGAGGTGGAATTTATGTTCTCCTATGGAAACTTTGGTTATGG  740

Query  741  ATTTTCACATCAGTTAAAACCTCTTCAGAAAATTACTGAGCCATCCATGTTTATGAATCTTGCACCACCTCCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATTTTCACATCAGTTAAAACCTCTTCAGAAAATTACTGAGCCATCCATGTTTATGAATCTTGCACCACCTCCAG  814

Query  815  AAAGAACAGATCCCGTGACAAAAGTTATTACACCACAGACAGTAGAATATCCAGCATTCTTATCCCCAGACCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAAGAACAGATCCCGTGACAAAAGTTATTACACCACAGACAGTAGAATATCCAGCATTCTTATCCCCAGACCTG  888

Query  889  AATGTTACTGTTGGGACTCCAGCTGTGCAATCCTCCAACCAGCCATCTGTAGTGCGACTTGAAAAACTTCAGCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AATGTTACTGTTGGGACTCCAGCTGTGCAATCCTCCAACCAGCCATCTGTAGTGCGACTTGAAAAACTTCAGCA  962

Query  963  ACAACCCCGGGAAAGGCTGGAAAAGATGAAAAAAGAATATAGAAATCTGAATACATGGATAGATAAAGCTAACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACAACCCCGGGAAAGGCTGGAAAAGATGAAAAAAGAATATAGAAATCTGAATACATGGATAGATAAAGCTAACT  1036

Query 1037  ATTTAGAAAGCATTCTAATGCCAAAATTGGAACATAAGGATTCTGAGGAAACTAATATAGATGAGGCATCTGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATTTAGAAAGCATTCTAATGCCAAAATTGGAACATAAGGATTCTGAGGAAACTAATATAGATGAGGCATCTGAA  1110

Query 1111  AACACGAAAAGTAATCAACCTGAAGAGGAGCTTGAAAATATTGTAGGAGTAGATATCCCTCTTGTAAATGAGGA  1184
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACACGAAAAGTAATCATCCTGAAGAGGAGCTTGAAAATATTGTAGGAGTAGATATCCCTCTTGTAAATGAGGA  1184

Query 1185  AGCTGAAACTACTGCAAATGAGTTACTGGATAATGATTCTGAGAAAGGCCTGACTATACCAACTTTGAACCAAT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGCTGAAACTACTGCAAATGAGTTACTGGATAATGATTCTGAGAAAGGCCTGACTATACCAACTTTGAACCAAT  1258

Query 1259  CGGACCAAGATAATTCAACTGCTGATGCTTCTAAAAATGATGAATCAACACCTTCACCCACAGAAGTGCACTCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGGACCAAGATAATTCAACTGCTGATGCTTCTAAAAATGATGAATCAACACCTTCACCCACAGAAGTGCACTCA  1332

Query 1333  TTGTGCACTATTTCTAACCAGGAAACAATAAAAGCAGGCAGAATACCACCTTTAGGTGAACGTCAATCAGAAAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTGTGCACTATTTCTAACCAGGAAACAATAAAAGCAGGCAGAATACCACCTTTAGGTGAACGTCAATCAGAAAG  1406

Query 1407  CATGCCAGACAGAAAAATGAAAAATGTATTTTTTCCATTAGAAGTAAAATTAAAAGATAACTATCCAAGCATTT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CATGCCAGACAGAAAAATGAAAAATGTATTTTTTCCATTAGAAGTAAAATTAAAAGATAACTATCCAAGCATTT  1480

Query 1481  TAAAAGCAGACTCATCTCTATCAGAGGTGGCTTTTTCACCAAAAGAATATAATTCACCATCTTTCAGACCAGAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||                                                  
Sbjct 1481  TAAAAGCAGACTCATCTCTATCAG--------------------------------------------------  1504

Query 1555  TATATAGAATTCAAACCAAAATTTCAGGATTGTTCAGATAAATTTGAGGATTTACATGACATGACCTCATTTAC  1628
                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1505  -------------------------AGGATTGTTCAGATAAATTTGAGGATTTACATGACATGACCTCATTTAC  1553

Query 1629  ACACCTTAAAAAAGTAAAATCAAGATCAAGGCTTTTAGGAAAAAGCTCAGATGATATCCATAACCATGCCAGAC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554  ACACCTTAAAAAAGTAAAATCAAGATCAAGGCTTTTAGGAAAAAGCTCAGATGATATCCATAACCATGCCAGAC  1627

Query 1703  ACTCTGCAAGACCATATACTGCTCCGGAGGTTAACAAGCAACGAGAAAGCTACAGTGGAAAGTTTACAAGTCGT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628  ACTCTGCAAGACCATATACTGCTCCGGAGGTTAACAAGCAACGAGAAAGCTACAGTGGAAAGTTTACAAGTCGT  1701

Query 1777  CGAATGGTTTCATCAGGCTTAGTTCATATAAATGATAAAACATCAGATTATGAAATGCATAAAATGCGGCCAAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702  CGAATGGTTTCATCAGGCTTAGTTCATATAAATGATAAAACATCAGATTATGAAATGCATAAAATGCGGCCAAA  1775

Query 1851  AAAAATTAAAAGAGGATAT  1869
            |||||||||||||||||||
Sbjct 1776  AAAAATTAAAAGAGGATAT  1794