Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09688
• Subject: XM_017007786.2
• Aligned Length: 2054
• Identities: 1652
• Gaps: 379

Alignment

Query    1  ATGAGCGCCTCGGGCGTACTGTCCTTTACCCAGCAAGGATGGGAGCAGGTGCTGGCCAAAGTGAAACGGGCTGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCGCCTCGGGCGTACTGTCCTTTACCCAGCAAGGATGGGAGCAGGTGCTGGCCAAAGTGAAACGGGCTGT  74

Query   75  GGTTTACCTGGACGCCGCCTGCGCCGAGAGCCTGCACTGGGGCTGCGGATCCACCCGTCTCCTGGAGGCGGTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGTTTACCTGGACGCCGCCTGCGCCGAGAGCCTGCACTGGGGCTGCGGATCCACCCGTCTCCTGGAGGCGGTGG  148

Query  149  GGGGTCCTGACTGTCACCTGCGAGAGTTCGAGCCCGACGCAATTGGTGGTGGAGCCAAGCAGCCCAAGGCAGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGGTCCTGACTGTCACCTGCGAGAGTTCGAGCCCGACGCAATTGGTGGTGGAGCCAAGCAGCCCAAGGCAGTG  222

Query  223  TTTGTGCTGAGCTGCCTGCTGAAAGGCCGGACCGTGGAGATCCTACGGGACATCATCTGCCGCAGTCACTTCCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTTGTGCTGAGCTGCCTGCTGAAAGGCCGGACCGTGGAGATCCTACGGGACATCATCTGCCGCAGTCACTTCCA  296

Query  297  GTATTGTGTGGTGGTCACAACCGTGAGCCACGCTGTCCACCTCACAGCTAATCATGTCCCAGCGGCGGCAGCGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTATTGTGTGGTGGTCACAACCGTGAGCCACGCTGTCCACCTCACAGCTAATCATGTCCCAGCGGCGGCAGCGG  370

Query  371  CCGAGATGGAGGGGCAGCAGCCGGTGTTCGAGCAGCTGGAGGAGAAGCTGTGTGAATGGATGGGCAACATGAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCGAGATGGAGGGGCAGCAGCCGGTGTTCGAGCAGCTGGAGGAGAAGCTGTGTGAATGGATGGGCAACATGAAC  444

Query  445  TACACGGCCGAGGTGTTCCATGTCCCGTTATTGCTTGCCCCTGTTGCTCCCCACTTTGCCTTGACTCCAGCTTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TACACGGCCGAGGTGTTCCATGTCCCGTTATTGCTTGCCCCTGTTGCTCCCCACTTTGCCTTGACTCCAGCTTT  518

Query  519  TGCATCCCTTTTCCCACTGCTACCCCAGGATGTGCACCTCCTTAATAGCGCCCGACCGGACAAGAGGAAGCTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCATCCCTTTTCCCACTGCTACCCCAGGATGTGCACCTCCTTAATAGCGCCCGACCGGACAAGAGGAAGCTGG  592

Query  593  GAAGCCTGGGTGATGTGGACTCCACTACGCTAACCCCAGAGCTGCTGCTGCAGATCAGATGCCTAGTGTCAGGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAAGCCTGGGTGATGTGGACTCCACTACGCTAACCCCAGAGCTGCTGCTGCAGATCAGATGCCTAGTGTCAGGC  666

Query  667  CTCAGTTCTCTGTGTGAACATTTAGGAGTACGGGAGGAGTGTTTTGCTGTAGGTTCCTTAAGTCAGGTCATCGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCAGTTCTCTGTGTGAACATTTAGGAGTACGGGAGGAGTGTTTTGCTGTAGGTTCCTTAAGTCAGGTCATCGC  740

Query  741  TGCGGATCTGGCCAATTATGCCCCTGCAAAGAACAGGAAGAAGACTGCTGCAGGCAGGGCATCAGTGGTTTTTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCGGATCTGGCCAATTATGCCCCTGCAAAGAACAGGAAGAAGACTGCTGCAGGCAGGGCATCAGTGGTTTTTG  814

Query  815  TGGACAGAACCCTGGATCTCACAGGAGCAGTTGGACATCATGGAGACAACTTAGTAGAGAAGATCATTTCAGCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGACAGAACCCTGGATCTCACAGGAGCAGTTGGACATCATGGAGACAACTTAGTAGAGAAGATCATTTCAGCA  888

Query  889  CTTCCCCAGCTCCCAGGCCACACAAATGATGTGATGGTTAACATGATAGCGCTCACTGCACTCCATACTGAGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTCCCCAGCTCCCAGGCCACACAAATGATGTGATGGTTAACATGATAGCGCTCACTGCACTCCATACTGAGGA  962

Query  963  GGAAAATTATAATGTGGTTGCACCAGGCTGTCTTTCACAATCCAGTGACACCACAGCCAAAGCCCTATGGGAAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAAAATTATAATGTGGTTGCACCAGGCTGTCTTTCACAATCCAGTGACACCACAGCCAAAGCCCTATGGGAAG  1036

Query 1037  CTTTACTGAACACTAAGCACAAAGAGGCAGTGATGGAAGTTCGGAGACATCTAGTGGAAGCGGCAAGCAGAGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTTTACTGAACACTAAGCACAAAGAGGCAGTGATGGAAGTTCGGAGACATCTAGTGGAAGCGGCAAGCAGAGAA  1110

Query 1111  AACCTGCCAATCAAGATGAGTATGGGGAGAGTCACACCGGGACAGCTCATGTCCTATATTCAGCTCTTCAAGAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACCTGCCAATCAAGATGAGTATGGGGAGAGTCACACCGGGACAGCTCATGTCCTATATTCAGCTCTTCAAGAA  1184

Query 1185  CAACCTCAAAGCTCTAATGAATCATTGTGGCCTCCTCCAGCTTGGACTGGCCACAGCTCAAACGTTGAAACACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAACCTCAAAGCTCTAATGAATCATTGTGGCCTCCTCCAGCTTGGACTGGCCACAGCTCAAACGTTGAAACACC  1258

Query 1259  CACAGACTGCCAAGTGGGACAACTTTCTGGCTTTTGAAAGGCTCCTTCTTCAGAGCATTGGGGAGTCAGCAATG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CACAGACTGCCAAGTGGGACAACTTTCTGGCTTTTGAAAGGCTCCTTCTTCAGAGCATTGGGGAGTCAGCAATG  1332

Query 1333  TCCGTTGTGTTAAATCAGCTGCTGCCCATGATTAAGCCTGTAACCCAGAGAACCAACGAGGACTACAGCCCTGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCCGTTGTGTTAAATCAGCTGCTGCCCATGATTAAGCCTGTAACCCAGAGAACCAACGAGGACTACAGCCCTGA  1406

Query 1407  GGAACTGCTGATCCTTCTCATATATATTTATTCTGTCACTGGAGAGCTCACAGTAGACAAAGACCTGTGTGAAG  1480
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGAACTGCTGATCCTTCTCATATATATTTATTCTGTCACTGGAGAGCTCACGGTAGACAAAGACCTGTGTGAAG  1480

Query 1481  CAGAAGAAAAAGTCAAGAAAGCATTGGCTCAGGTCTTCTGTGAGGAATCTGGATTGTCACCTTTGCTGCAAAAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CAGAAGAAAAAGTCAAGAAAGCATTGGCTCAGGTCTTCTGTGAGGAATCTGGATTGTCACCTTTGCTGCAAAAA  1554

Query 1555  ATTACGGACTGGGACTCTTCAATTAATCTGACATTTCACAA--ATCCAAAATTGCCGTGGATGAACTCTTTACT  1626
            ||||||||            .||.||.|  |.||..||..|  |||..||.||    |||.|||    .||||.
Sbjct 1555  ATTACGGA------------TATAAAAC--AGATAGCAGCAGCATCAGAACTT----TGGGTGA----GTTACC  1606

Query 1627  TCACTTCGGGATATTGCTGGAGCTCGGAGTCTCCTGAAACAGTTTAAGTCTGTATATGTTCCTGGAAATCATAC  1700
            ||||       ||||                   |.|.||||  |||||.|                 ||||  
Sbjct 1607  TCAC-------TATT-------------------TCACACAG--TAAGTTT-----------------TCAT--  1633

Query 1701  CCACCAGGCATCTTATAAGCCATTGTTGAAGCAAGTTGTGGAGGAAATATTTCATCCCGAGAGGCCAGATTCCG  1774
                        ||                  ||.||||          |||                      
Sbjct 1634  ------------TT------------------AACTTGT----------TTT----------------------  1645

Query 1775  TTGATATTGAACACATGTCTTCAGGCCTCACTGATCTCCTTAAAACTGGATTTAGCATGTTCATGAAGGTGAGC  1848
                ||||.|       ||||     |||     |||||||        .|||..|||    |||         
Sbjct 1646  ----TATTCA-------TCTT-----CTC-----TCTCCTT--------GTTTTTCAT----ATG---------  1677

Query 1849  CGGCCTCATCCTAGTGACTACCCCCTCCTGATCCTCTTTGTGGTAGGTGGGGTCACAGTCTCTGAAGTGAAAAT  1922
                                                                                      
Sbjct 1678  --------------------------------------------------------------------------  1677

Query 1923  GGTCAAAGATCTTGTGGCATCGTTGAAGCCAGGAACCCAGGTAATCGTGCTGTCCACACGACTCCTGAAGCCAC  1996
                                                                                      
Sbjct 1678  --------------------------------------------------------------------------  1677

Query 1997  TTAACATTCCTGAGCTGTTATTTGCAACTGACCGACTGCATCCAGACCTTGGCTTC  2052
                                                                    
Sbjct 1678  --------------------------------------------------------  1677