Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09696
- Subject:
- NM_175187.5
- Aligned Length:
- 1461
- Identities:
- 1333
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGGTGTGATAGGTATACAGCTGGTTGTTACCATGGTGATGGCCAGTGTCATGCAGAAGATTATACCTCACTA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGTGTGATAGGTATACAGCTGGTTGTTACCATGGTGATGGCCAGTGTCATGCAGAAGATTATACCTCACTA 74
Query 75 TTCTCTTGCTCGATGGCTACTCTGTAATGGCAGTTTGAGGTGGTATCAACATCCTACAGAAGAAGAATTAAGAA 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||
Sbjct 75 TTCTCTTGCTCGATGGCTACTCTGTAATGGCAGTTTGAGATGGTATCAACATCCTTCCGAAGAAGAATTAAGAA 148
Query 149 TTCTTGCAGGGAAACAACAAAAAGGGAAAACCAAAAAAGATAGGAAATATAATGGTCACATTGAAAGTAAGCCA 222
|.|||||||||||.||.||.|||||.||||..||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||||.|||||||
Sbjct 149 TCCTTGCAGGGAAGCAGCAGAAAGGAAAAAGTAAAAAAGACAGAAAATACAATGGCCATATTGAAAATAAGCCA 222
Query 223 TTAACCATTCCAAAGGATATTGACCTTCATCTAGAAACAAAGTCAGTTACAGAAGTGGATACTTTAGCATTGCA 296
.|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct 223 CTAACCATTCCAAAAGACATTGACCTTCATCTAGAAACCAAGTCTGTTACAGAAGTGGACACTTTAGCACTGCA 296
Query 297 TTACTTTCCAGAATACCAGTGGCTGGTGGATTTCACAGTGGCTGCTACAGTTGTGTATCTAGTAACTGAAGTCT 370
||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..||||.|||.||||||||||.||||
Sbjct 297 TTACTTCCCAGAATACCAGTGGCTGGTGGACTTCACGGTGGCTGCTACCATTGTCTATTTAGTAACTGAGGTCT 370
Query 371 ACTACAATTTTATGAAGCCTACACAGGAAATGAATATCAGCTTAGTCTGGTGCCTACTTGTTTTGTCTTTTGCA 444
|.||||..||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 371 ATTACAGCTTCATGAAGCCTACACAGGAAATGAATATCAGCTTAGTTTGGTGCCTCCTGGTTTTGTCTTTTGCA 444
Query 445 ATCAAAGTTCTATTTTCATTAACTACACACTATTTTAAAGTAGAAGATGGTGGTGAAAGATCTGTTTGTGTCAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 445 ATCAAAGTTCTATTTTCATTAACTACACACTATTTTAAAGTAGAAGATGGAGGTGAAAGGTCAGTTTGTGTCAC 518
Query 519 CTTTGGATTTTTTTTCTTTGTCAAAGCAATGGCAGTGTTGATTGTAACAGAAAATTATCTGGAATTTGGACTTG 592
||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||||
Sbjct 519 CTTTGGATTTTTTTTCTTCGTTAAAGCAATGGCAGTTTTGATCGTAACAGAGAACTACCTGGAGTTTGGCCTTG 592
Query 593 AAACAGGGTTTACAAATTTTTCAGACAGTGCGATGCAGTTTCTTGAAAAGCAAGGTTTAGAATCTCAGAGTCCT 666
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||
Sbjct 593 AAACAGGGTTTACAAATTTTTCAGACAGTGCAATGCAGTTTCTTGAAAAGCAGGGTTTAGAATCTCAGGGCCCT 666
Query 667 GTTTCAAAACTTACTTTCAAATTTTTCCTGGCTATTTTCTGTTCATTCATTGGGGCTTTTTTGACATTTCCTGG 740
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTTTCAAAACTTACTTTCAAATTTTTCCTGGCTGTTTTCTGTTCACTCATTGGGGCTTTTTTGACATTTCCTGG 740
Query 741 ATTACGACTGGCTCAAATGCATCTGGATGCCCTGAATTTGGCAACAGAAAAAATTACACAAACTTTACTTCATA 814
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 741 ATTACGGCTGGCTCAAATGCATCTGGATGCCCTGAATATGGCAACAGAAAAAATTACACAAACATTACTTCATA 814
Query 815 TCAACTTCTTGGCACCTTTATTTATGGTTTTGCTCTGGGTAAAACCAATCACCAAAGACTACATTATGAACCCA 888
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 815 TCAACTTCTTGGCACCTTTATTTATGGTTCTGCTCTGGGTGAAACCAATCACCAAAGACTATATCATGAACCCA 888
Query 889 CCACTGGGCAAAGAAAGTATCCCTTTAATGACAGAAGCCACATTCGATACTCTGCGACTCTGGTTAATAATCCT 962
||..||||.|.|||.|||.|||||.|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCGTTGGGTAGAGAGAGTGTCCCTCTAATGACAGAAGCCACATTTGATACTCTTCGACTCTGGTTAATAATCCT 962
Query 963 GCTGTGTGCTTTGCGGTTGGCCATGATGCGTAGTCACCTGCAAGCTTATTTAAATTTAGCCCAAAAATGTGTGG 1036
|||.||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 963 GCTCTGTGTTTTGCGGTTGGCCATGATGCGAAGTCACCTGCAAGCATATTTAAATTTGGCCCAGAAATGTGTGG 1036
Query 1037 ATCAGATGAAGAAAGAAGCGGGGCGAATAAGCACGGTTGAGCTACAGAAAATGGTGGCTCGAGTCTTTTATTAT 1110
||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1037 ATCAAATGAAGAAAGAAGCTGGCCGAATAAGTACAGTTGAGCTACAGAAAATGGTGGCGCGAGTCTTTTACTAC 1110
Query 1111 CTTTGTGTCATTGCACTGCAGTATGTGGCGCCTCTGGTAATGCTGCTTCACACAACTCTGCTTTTGAAAACACT 1184
||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|..|||||||||.||||||||||
Sbjct 1111 CTGTGTGTCATTGCCCTGCAGTATGTGGCACCTCTGGTAATGCTGCTTCATATGACTCTGCTTCTGAAAACACT 1184
Query 1185 AGGTAATCATTCCTGGGGTATTTATCCAGAATCTATCTCTACCTTACCAGTGGATAATAGTCTACTGTCCAATT 1258
||||||||||||||||||.||||||||||||.|...||.|.||||.|||||||||||||.|||.|...||||.|
Sbjct 1185 AGGTAATCATTCCTGGGGAATTTATCCAGAAGCCGCCTTTCCCTTGCCAGTGGATAATAATCTCCCCGCCAACT 1258
Query 1259 CTGTTTACTCTGAATTACCATCAGCTGAAGGGAAAATGAAGGTAACTGTTACACAAATAACAGTGGCACTGAGC 1332
|.|.||||.|||||.||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1259 CGGCTTACCCTGAACTACCATCACCTGATGGGAAGATGAAGGTAACTGTTACACAAATCACAGTGGCCCTGAGC 1332
Query 1333 AGCTTAAAAAATATTTTTACTCCTCTTCTTTTTCGAGGACTTCTGTCTTTTCTGACCTGGTGGATTGCTGCTTG 1406
|||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1333 AGCTTAAAAAACATCTTCACGCCTCTCCTTTTTCGAGGACTTCTGTCATTTTTGACATGGTGGATTGCAGCTTG 1406
Query 1407 CCTCTTTTCTACAAGCCTTTTTGGGCTTTTCTATCACCAGTATCTGACTGTGGCA 1461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.||||||
Sbjct 1407 CCTCTTTTCTACAAGCCTTTTTGGGCTTTTCTATCATCAGTATTTGACAGTGGCA 1461