Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09696
- Subject:
- XM_006517402.1
- Aligned Length:
- 1513
- Identities:
- 1295
- Gaps:
- 68
Alignment
Query 1 ATGGGTGTGATAGGTATAC------AGCTGGTTG---TTACCAT----GGT---GATGGC-CAGTGTCATGCAG 57
|||.| |..|||..|.| |||.||..| ||.||.| ||| ||..|| |.||.| |||||
Sbjct 1 ATGCG---GGCAGGACTTCCGGCCGAGCCGGAAGACCTTTCCCTTCGCGGTTTCGAGAGCTCCGTTT--TGCAG 69
Query 58 A-----------AGATTAT--AC-----------CTC---ACTATTCTCTTGCTCGA--------TGGCTACTC 96
| |||||.| || ||| ||| .|||.|..|.||| ||||
Sbjct 70 AACCTGAAGGGGAGATTCTGGACGGTCCCGGGGACTCTAGACT-GTCTGTCCCACGACCTGTTCTTGGC----- 137
Query 97 TGTAATGGCAGTTTGAGGTGGTATCAACATCCTACAGAAGAAGAATTAAGAATTCTTGCAGGGAAACAACAAAA 170
||.|| |||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 138 -GTTAT----GTTTGAGATGGTATCAACATCCTTCCGAAGAAGAATTAAGAATCCTTGCAGGGAAGCAGCAGAA 206
Query 171 AGGGAAAACCAAAAAAGATAGGAAATATAATGGTCACATTGAAAGTAAGCCATTAACCATTCCAAAGGATATTG 244
|||.||||..||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||||.|||||||.|||||||||||||.||.||||
Sbjct 207 AGGAAAAAGTAAAAAAGACAGAAAATACAATGGCCATATTGAAAATAAGCCACTAACCATTCCAAAAGACATTG 280
Query 245 ACCTTCATCTAGAAACAAAGTCAGTTACAGAAGTGGATACTTTAGCATTGCATTACTTTCCAGAATACCAGTGG 318
||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 281 ACCTTCATCTAGAAACCAAGTCTGTTACAGAAGTGGACACTTTAGCACTGCATTACTTCCCAGAATACCAGTGG 354
Query 319 CTGGTGGATTTCACAGTGGCTGCTACAGTTGTGTATCTAGTAACTGAAGTCTACTACAATTTTATGAAGCCTAC 392
||||||||.|||||.|||||||||||..||||.|||.||||||||||.|||||.||||..||.|||||||||||
Sbjct 355 CTGGTGGACTTCACGGTGGCTGCTACCATTGTCTATTTAGTAACTGAGGTCTATTACAGCTTCATGAAGCCTAC 428
Query 393 ACAGGAAATGAATATCAGCTTAGTCTGGTGCCTACTTGTTTTGTCTTTTGCAATCAAAGTTCTATTTTCATTAA 466
||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 429 ACAGGAAATGAATATCAGCTTAGTTTGGTGCCTCCTGGTTTTGTCTTTTGCAATCAAAGTTCTATTTTCATTAA 502
Query 467 CTACACACTATTTTAAAGTAGAAGATGGTGGTGAAAGATCTGTTTGTGTCACCTTTGGATTTTTTTTCTTTGTC 540
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 503 CTACACACTATTTTAAAGTAGAAGATGGAGGTGAAAGGTCAGTTTGTGTCACCTTTGGATTTTTTTTCTTCGTT 576
Query 541 AAAGCAATGGCAGTGTTGATTGTAACAGAAAATTATCTGGAATTTGGACTTGAAACAGGGTTTACAAATTTTTC 614
||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 577 AAAGCAATGGCAGTTTTGATCGTAACAGAGAACTACCTGGAGTTTGGCCTTGAAACAGGGTTTACAAATTTTTC 650
Query 615 AGACAGTGCGATGCAGTTTCTTGAAAAGCAAGGTTTAGAATCTCAGAGTCCTGTTTCAAAACTTACTTTCAAAT 688
|||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 651 AGACAGTGCAATGCAGTTTCTTGAAAAGCAGGGTTTAGAATCTCAGGGCCCTGTTTCAAAACTTACTTTCAAAT 724
Query 689 TTTTCCTGGCTATTTTCTGTTCATTCATTGGGGCTTTTTTGACATTTCCTGGATTACGACTGGCTCAAATGCAT 762
|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 725 TTTTCCTGGCTGTTTTCTGTTCACTCATTGGGGCTTTTTTGACATTTCCTGGATTACGGCTGGCTCAAATGCAT 798
Query 763 CTGGATGCCCTGAATTTGGCAACAGAAAAAATTACACAAACTTTACTTCATATCAACTTCTTGGCACCTTTATT 836
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 799 CTGGATGCCCTGAATATGGCAACAGAAAAAATTACACAAACATTACTTCATATCAACTTCTTGGCACCTTTATT 872
Query 837 TATGGTTTTGCTCTGGGTAAAACCAATCACCAAAGACTACATTATGAACCCACCACTGGGCAAAGAAAGTATCC 910
|||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||..||||.|.|||.|||.|||
Sbjct 873 TATGGTTCTGCTCTGGGTGAAACCAATCACCAAAGACTATATCATGAACCCACCGTTGGGTAGAGAGAGTGTCC 946
Query 911 CTTTAATGACAGAAGCCACATTCGATACTCTGCGACTCTGGTTAATAATCCTGCTGTGTGCTTTGCGGTTGGCC 984
||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||
Sbjct 947 CTCTAATGACAGAAGCCACATTTGATACTCTTCGACTCTGGTTAATAATCCTGCTCTGTGTTTTGCGGTTGGCC 1020
Query 985 ATGATGCGTAGTCACCTGCAAGCTTATTTAAATTTAGCCCAAAAATGTGTGGATCAGATGAAGAAAGAAGCGGG 1058
||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1021 ATGATGCGAAGTCACCTGCAAGCATATTTAAATTTGGCCCAGAAATGTGTGGATCAAATGAAGAAAGAAGCTGG 1094
Query 1059 GCGAATAAGCACGGTTGAGCTACAGAAAATGGTGGCTCGAGTCTTTTATTATCTTTGTGTCATTGCACTGCAGT 1132
.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1095 CCGAATAAGTACAGTTGAGCTACAGAAAATGGTGGCGCGAGTCTTTTACTACCTGTGTGTCATTGCCCTGCAGT 1168
Query 1133 ATGTGGCGCCTCTGGTAATGCTGCTTCACACAACTCTGCTTTTGAAAACACTAGGTAATCATTCCTGGGGTATT 1206
|||||||.||||||||||||||||||||.|..|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1169 ATGTGGCACCTCTGGTAATGCTGCTTCATATGACTCTGCTTCTGAAAACACTAGGTAATCATTCCTGGGGAATT 1242
Query 1207 TATCCAGAATCTATCTCTACCTTACCAGTGGATAATAGTCTACTGTCCAATTCTGTTTACTCTGAATTACCATC 1280
|||||||||.|...||.|.||||.|||||||||||||.|||.|...||||.||.|.||||.|||||.|||||||
Sbjct 1243 TATCCAGAAGCCGCCTTTCCCTTGCCAGTGGATAATAATCTCCCCGCCAACTCGGCTTACCCTGAACTACCATC 1316
Query 1281 AGCTGAAGGGAAAATGAAGGTAACTGTTACACAAATAACAGTGGCACTGAGCAGCTTAAAAAATATTTTTACTC 1354
|.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|
Sbjct 1317 ACCTGATGGGAAGATGAAGGTAACTGTTACACAAATCACAGTGGCCCTGAGCAGCTTAAAAAACATCTTCACGC 1390
Query 1355 CTCTTCTTTTTCGAGGACTTCTGTCTTTTCTGACCTGGTGGATTGCTGCTTGCCTCTTTTCTACAAGCCTTTTT 1428
||||.||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391 CTCTCCTTTTTCGAGGACTTCTGTCATTTTTGACATGGTGGATTGCAGCTTGCCTCTTTTCTACAAGCCTTTTT 1464
Query 1429 GGGCTTTTCTATCACCAGTATCTGACTGTGGCA 1461
||||||||||||||.||||||.||||.||||||
Sbjct 1465 GGGCTTTTCTATCATCAGTATTTGACAGTGGCA 1497