Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09696
• Subject: XM_024454375.1
• Aligned Length: 1461
• Identities: 1427
• Gaps: 33

Alignment

Query    1  ATGGGTGTGATAGGTATACAGCTGGTTGTTACCATGGTGATGGCCAGTGTCATGCAGAAGATTATACCTCACTA  74
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------ATGGTGATGGCCAGTGTCATGCAGAAGATTATACCTCACTA  41

Query   75  TTCTCTTGCTCGATGGCTACTCTGTAATGGCAGTTTGAGGTGGTATCAACATCCTACAGAAGAAGAATTAAGAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   42  TTCTCTTGCTCGATGGCTACTCTGTAATGGCAGTTTGAGGTGGTATCAACATCCTACAGAAGAAGAATTAAGAA  115

Query  149  TTCTTGCAGGGAAACAACAAAAAGGGAAAACCAAAAAAGATAGGAAATATAATGGTCACATTGAAAGTAAGCCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  116  TTCTTGCAGGGAAACAACAAAAAGGGAAAACCAAAAAAGATAGGAAATATAATGGTCACATTGAAAGTAAGCCA  189

Query  223  TTAACCATTCCAAAGGATATTGACCTTCATCTAGAAACAAAGTCAGTTACAGAAGTGGATACTTTAGCATTGCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  190  TTAACCATTCCAAAGGATATTGACCTTCATCTAGAAACAAAGTCAGTTACAGAAGTGGATACTTTAGCATTGCA  263

Query  297  TTACTTTCCAGAATACCAGTGGCTGGTGGATTTCACAGTGGCTGCTACAGTTGTGTATCTAGTAACTGAAGTCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  264  TTACTTTCCAGAATACCAGTGGCTGGTGGATTTCACAGTGGCTGCTACAGTTGTGTATCTAGTAACTGAAGTCT  337

Query  371  ACTACAATTTTATGAAGCCTACACAGGAAATGAATATCAGCTTAGTCTGGTGCCTACTTGTTTTGTCTTTTGCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  338  ACTACAATTTTATGAAGCCTACACAGGAAATGAATATCAGCTTAGTCTGGTGCCTACTTGTTTTGTCTTTTGCA  411

Query  445  ATCAAAGTTCTATTTTCATTAACTACACACTATTTTAAAGTAGAAGATGGTGGTGAAAGATCTGTTTGTGTCAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  412  ATCAAAGTTCTATTTTCATTAACTACACACTATTTTAAAGTAGAAGATGGTGGTGAAAGATCTGTTTGTGTCAC  485

Query  519  CTTTGGATTTTTTTTCTTTGTCAAAGCAATGGCAGTGTTGATTGTAACAGAAAATTATCTGGAATTTGGACTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  486  CTTTGGATTTTTTTTCTTTGTCAAAGCAATGGCAGTGTTGATTGTAACAGAAAATTATCTGGAATTTGGACTTG  559

Query  593  AAACAGGGTTTACAAATTTTTCAGACAGTGCGATGCAGTTTCTTGAAAAGCAAGGTTTAGAATCTCAGAGTCCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  560  AAACAGGGTTTACAAATTTTTCAGACAGTGCGATGCAGTTTCTTGAAAAGCAAGGTTTAGAATCTCAGAGTCCT  633

Query  667  GTTTCAAAACTTACTTTCAAATTTTTCCTGGCTATTTTCTGTTCATTCATTGGGGCTTTTTTGACATTTCCTGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  634  GTTTCAAAACTTACTTTCAAATTTTTCCTGGCTATTTTCTGTTCATTCATTGGGGCTTTTTTGACATTTCCTGG  707

Query  741  ATTACGACTGGCTCAAATGCATCTGGATGCCCTGAATTTGGCAACAGAAAAAATTACACAAACTTTACTTCATA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  708  ATTACGACTGGCTCAAATGCATCTGGATGCCCTGAATTTGGCAACAGAAAAAATTACACAAACTTTACTTCATA  781

Query  815  TCAACTTCTTGGCACCTTTATTTATGGTTTTGCTCTGGGTAAAACCAATCACCAAAGACTACATTATGAACCCA  888
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  782  TCAACTTCTTGGCACCTTTATTTATGGTTCTGCTCTGGGTAAAACCAATCACCAAAGACTACATTATGAACCCA  855

Query  889  CCACTGGGCAAAGAAAGTATCCCTTTAATGACAGAAGCCACATTCGATACTCTGCGACTCTGGTTAATAATCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  856  CCACTGGGCAAAGAAAGTATCCCTTTAATGACAGAAGCCACATTCGATACTCTGCGACTCTGGTTAATAATCCT  929

Query  963  GCTGTGTGCTTTGCGGTTGGCCATGATGCGTAGTCACCTGCAAGCTTATTTAAATTTAGCCCAAAAATGTGTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  930  GCTGTGTGCTTTGCGGTTGGCCATGATGCGTAGTCACCTGCAAGCTTATTTAAATTTAGCCCAAAAATGTGTGG  1003

Query 1037  ATCAGATGAAGAAAGAAGCGGGGCGAATAAGCACGGTTGAGCTACAGAAAATGGTGGCTCGAGTCTTTTATTAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1004  ATCAGATGAAGAAAGAAGCGGGGCGAATAAGCACGGTTGAGCTACAGAAAATGGTGGCTCGAGTCTTTTATTAT  1077

Query 1111  CTTTGTGTCATTGCACTGCAGTATGTGGCGCCTCTGGTAATGCTGCTTCACACAACTCTGCTTTTGAAAACACT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078  CTTTGTGTCATTGCACTGCAGTATGTGGCGCCTCTGGTAATGCTGCTTCACACAACTCTGCTTTTGAAAACACT  1151

Query 1185  AGGTAATCATTCCTGGGGTATTTATCCAGAATCTATCTCTACCTTACCAGTGGATAATAGTCTACTGTCCAATT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1152  AGGTAATCATTCCTGGGGTATTTATCCAGAATCTATCTCTACCTTACCAGTGGATAATAGTCTACTGTCCAATT  1225

Query 1259  CTGTTTACTCTGAATTACCATCAGCTGAAGGGAAAATGAAGGTAACTGTTACACAAATAACAGTGGCACTGAGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1226  CTGTTTACTCTGAATTACCATCAGCTGAAGGGAAAATGAAGGTAACTGTTACACAAATAACAGTGGCACTGAGC  1299

Query 1333  AGCTTAAAAAATATTTTTACTCCTCTTCTTTTTCGAGGACTTCTGTCTTTTCTGACCTGGTGGATTGCTGCTTG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1300  AGCTTAAAAAATATTTTTACTCCTCTTCTTTTTCGAGGACTTCTGTCTTTTCTGACCTGGTGGATTGCTGCTTG  1373

Query 1407  CCTCTTTTCTACAAGCCTTTTTGGGCTTTTCTATCACCAGTATCTGACTGTGGCA  1461
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1374  CCTCTTTTCTACAAGCCTTTTTGGGCTTTTCTATCACCAGTATCTGACTGTGGCA  1428