Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09804
- Subject:
- XM_006502152.1
- Aligned Length:
- 2082
- Identities:
- 1814
- Gaps:
- 78
Alignment
Query 1 ATGGCGACGTCGGGGGCGAACGGGCCTGGTTCGGCCACGGCCTCGGCTTCCAATCCGCGCAAATTTAGTGAGAA 74
|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGACGTCAGGGGCGAACGGGCCGGGTTCCGCCACAGCCTCAGCGTCCAATCCACGCAAGTTTAGTGAGAA 74
Query 75 GATTGCGCTGCAGAAGCAGCGTCAGGCCGAGGAGACGGCGGCCTTCGAGGAGGTGATGATGGACATCGGCTCCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GATTGCGCTGCAGAAGCAGCGTCAGGCCGAGGAGACGGCGGCCTTCGAGGAGGTGATGATGGACATCGGCTCCA 148
Query 149 CCCGGTTACAGGCCCAAAAACTGCGACTGGCATACACAAGGAGCTCTCATTATGGTGGGTCTCTGCCCAATGTT 222
|.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 149 CACGGTTACAGGCCCAAAAACTGCGACTGGCTTATACAAGGAGCTCCCATTATGGTGGTTCTCTGCCCAATGTT 222
Query 223 AACCAGATTGGCTCTGGCCTGGCCGAGTTCCAGAGCCCCCTCCACTCACCTTTGGATTCATCTCGGAGCACTCG 296
|||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AACCAGATTGGCTGTGGCCTGGCTGAGTTCCAGAGCCCCCTTCACTCACCTTTGGATTCATCTCGGAGCACTCG 296
Query 297 GCACCATGGGCTGGTGGAACGGGTGCAGCGAGATCCTCGAAGAATGGTGTCCCCACTTCGCCGATACACCCGCC 370
||||||||||.|||||||||||||.||.||||||.|.||.|||||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 297 GCACCATGGGTTGGTGGAACGGGTACAACGAGATGCCCGCAGAATGGTGTCCCCACTCCGCCGATACCCCCGCC 370
Query 371 ACATTGACAGCTCTCCCTATAGTCCTGCCTACTTATCTCCTCCCCCAGAGTCTAGCTGGCGAAGGACGATGGCC 444
||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 371 ACATTGACAGTTCTCCATATAGCCCTGCCTATTTATCTCCTCCCCCAGAGTCTGGCTGGCGA------------ 432
Query 445 TGGGGCAATTTCCCTGCAGAGAAGGGGCAGTTGTTTCGACTACCATCTGCACTTAACAGGACAAGCTCTGACTC 518
|||||||||||||||||
Sbjct 433 ---------------------------------------------------------AGGACAAGCTCTGACTC 449
Query 519 TGCCCTTCATACAAGTGTGATGAACCCCAGTCCCCAGGATACCTACCCAGGCCCCACACCTCCCAGCATCCTGC 592
|||.|||||.|||||||||||||||||.|..|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||..||||||
Sbjct 450 TGCTCTTCACACAAGTGTGATGAACCCTAACCCCCAAGACACTTATCCAGGCCCCACACCTCCCAGTGTCCTGC 523
Query 593 CCA---GCCGACGTGGGGGTATTCTGGATGGTGAAATGGACCCCAAAGTACCTGCTATTGAGGAGAACTTGCTA 663
||| |||||.|.||.|||.|||||||||||||.|||||..|.|||||.||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 524 CCAGCCGCCGAGGAGGAGGTTTTCTGGATGGTGAGATGGATGCTAAAGTCCCTGCTATTGAGGAGAACGTGGTA 597
Query 664 GATGACAAGCATTTGCTGAAGCCATGGGATGCTAAGAAGCTATCCTCATCCTCTTCCCGACCTCGGTCCTGTGA 737
||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 598 GATGACAAGCATCTGCTGAAACCTTGGGATGCTAAGAAGCTGTCCTCATCTTCCTCTCGACCTCGATCCTGTGA 671
Query 738 AGTCCCTGGAATTAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCCAATGTGCCTGTCCTCCCACCTGCCATGAACA 811
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 672 AGTCCCTGGAATCAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCTAATGTGCCTGTCCTCCCACCTGCCATGAACA 745
Query 812 CGGGGGGCTCCCTACCTGACCTCACCAACCTGCACTTTCCCCCACCACTGCCCACCCCCCTGGACCCTGAAGAG 885
|.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 746 CAGGAGGCTCCCTACCTGACCTCACCAACCTACACTTCCCTCCTCCACTGCCCACACCCCTGGACCCTGAGGAG 819
Query 886 ACAGCCTACCCTAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCTCCAATTTGACCCACACCATGACTCACCTGGGCATCAG 959
||||.|||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||.||..||||||||||
Sbjct 820 ACAGTCTATCCCAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCACCAATTTGACCCATACTATGACCCATTTGGGCATCAG 893
Query 960 CAGGGGCATGGGCCTGGGCCCAGGCTATGATGCACCAGGACTTCATTCACCTCTCAGCCACCCATCCCTGCAGT 1033
..|.||..|||||.|||||||..|||||||||.||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 894 TGGAGGTCTGGGCTTGGGCCCCAGCTATGATGTACCAGGACTTCACTCACCTCTTAGCCACCCATCCCTGCAGT 967
Query 1034 CCTCCCTAAGCAATCCCAACCTCCAGGCTTCCCTGAGCAGTCCTCAGCCCCAGCTTCAGGGCTCCCACAGCCAC 1107
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 968 CCTCCCTAAGCAATCCCAACCTCCAGGCTTCCCTAAGTAGTCCTCAACCCCAGCTCCAGGGCTCCCATAGTCAC 1041
Query 1108 CCCTCTCTGCCTGCCTCCTCCTTGGCCCGCCATGTACTGCCCACCACCTCCCTGGGCCACCCCTCACTCAGTGC 1181
||.||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1042 CCATCACTGCCTGCCTCCTCCTTGGCCCACCATGCACTGCCCACCACCTCCCTGGGCCACCCGTCACTTAGTGC 1115
Query 1182 TCCGGCTCTTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCACTTCATCTCCTGTTTTGGGCGCCCCCTCTTACCCTGCTT 1255
.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||..||.|.||.|||.|||||||.||||
Sbjct 1116 CCCAGCCCTTTCCTCCTCCTCTTCCTCTTCGTCCACTTCATCTCCTGTCCTGAGTGCTCCCCCTTACCCAGCTT 1189
Query 1256 CTACCCCTGGGGCCTCCCCCCACCACCGCCGTGTGCCCCTCAGCCCCCTGAGTTTGCTCGCGGGCCCAGCCGAC 1329
||||.|||||||||||.||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||
Sbjct 1190 CTACTCCTGGGGCCTCTCCCCGCCACCGTCGTGTGCCCCTCAGCCCCCTGAGCTTGCCCGCGGGCCCAGCCGAC 1263
Query 1330 GCCAGAAGGTCCCAACAGCAGCTGCCCAAACAGTTTTCGCCAACAATGTCACCCACCTTGTCTTCCATCACTCA 1403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1264 GCCAGAAGGTCCCAACAGCAGCTGCCCAAACAGTTTTCGCCAACAATGTCACCCACCTTGTCTTCCATCACTCA 1337
Query 1404 GGGCGTCCCCCTGGATACCAGTAAACTGTCCACTGACCAGCGGTTACCCCCATACCCATACAGCTCCCCAAGTC 1477
||||||.|||.||||||||||||||.||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.|||||||||
Sbjct 1338 GGGCGTTCCCTTGGATACCAGTAAATTGCCTACTGACCAGCGATTGCCCCCATACCCATATAGCCCCCCAAGTC 1411
Query 1478 TGGTTCTGCCTACCCAGCCCCACACCCCAAAGTCTCTACAGCAGCCAGGGCTGCCCTCTCAGTCTTGTTCAGTG 1551
|.|||.|.||.|||||.||.|.||||||||||||||||||||| |.|||||||||||.|.||.|.||||
Sbjct 1412 TAGTTATACCCACCCATCCACCCACCCCAAAGTCTCTACAGCA------GTTGCCCTCTCAGGCCTGCTTAGTG 1479
Query 1552 CAGTCCTCAGGTGGGCAGCCCCCAGGCAGGCAGTCTCATTATGGGACACCGTACCCACCTGGGCCCAGTGGGCA 1625
|||.||||||||||.|||||.||||||||||||.|.|||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||.||
Sbjct 1480 CAGCCCTCAGGTGGACAGCCTCCAGGCAGGCAGCCACATTATGGGGCACTGTACCCACCTGGGTCCAGTGGACA 1553
Query 1626 TGGGCAACAGTCTTACCACCGGCCAATGAGTGACTTCAACCTGGGGAATCTGGAGCAGTTCAGCATGGAGAGCC 1699
||||||||||.||||||||||.|||||.|.||||||||.|.||||||||||||||||.||||.|||||||||||
Sbjct 1554 TGGGCAACAGCCTTACCACCGCCCAATAAATGACTTCAGCTTGGGGAATCTGGAGCAATTCAACATGGAGAGCC 1627
Query 1700 CATCAGCCAGCCTGGTGCTGGATCCCCCTGGCTTTTCTGAAGGGCCTGGATTTTTAGGGGGTGAGGGGCCAATG 1773
|||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||..|||||
Sbjct 1628 CATCAACCAGCCTGGTGCTGGATCCCCCTGCCTTTTCTGAAGGTCCTGGATTTTTAGGGAGTGAGGGATCAATG 1701
Query 1774 GGTGGCCCCCAGGATCCCCACACCTTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGGCTCAGGGCCTAA 1847
.|||||||||||||.||.|||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1702 AGTGGCCCCCAGGACCCTCACGTCCTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGGCTCAGGACCTAA 1775
Query 1848 CATCATCCTCACAGGGGACTCCTCTCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCCGGAGTGCCTGGCT 1921
.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1776 TATCATACTCACAGGAGACTCTTCCCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCTGGAGTGCCTGGCT 1849
Query 1922 TTGAGGTGTCAGCAGCTGGATTGGAGCTAGGGCTTGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAGCCACTGGGCCTG 1995
||||||||||||||.||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850 TTGAGGTGTCAGCATCTGGGTTGGAGCTGGGCCTGGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAGCCACTGGGCCTG 1923
Query 1996 GAAGGGCTAAACATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGATCCTGCTGTGGAGGAGTCATTCCGCAGTGA 2069
|||||.||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1924 GAAGGACTAACTATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGACCCTGCTGTGGAGGACTCATTCCGTAGTGA 1997
Query 2070 CCGGCTCCAA 2079
.|||||.||.
Sbjct 1998 TCGGCTACAG 2007