Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09804
• Subject: XM_017000575.1
• Aligned Length: 2094
• Identities: 1841
• Gaps: 249

Alignment

Query    1  ATGGCGACGTCGGGGGCGAACGGGCCTGGTTCGGCCACGGCCTCGGCTTCCAATCCGCGCAAATTTAGTGAGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GATTGCGCTGCAGAAGCAGCGTCAGGCCGAGGAGACGGCGGCCTTCGAGGAGGTGATGATGGACATCGGCTCCA  148
             ||         |||     |||.|||.||||              .||||                       
Sbjct    1  -AT---------GAA-----GTCCGGCGGAGG--------------TAGGA-----------------------  22

Query  149  CCCGGTTACAGGCCCAAAAACTGCGACTGGCATACACAAGGAGCTCTCATTATGGTGGGTCTCTGCCCAATGTT  222
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   23  ----GTTACAGGCCCAAAAACTGCGACTGGCATACACAAGGAGCTCTCATTATGGTGGGTCTCTGCCCAATGTT  92

Query  223  AACCAGATTGGCTCTGGCCTGGCCGAGTTCCAGAGCCCCCTCCACTCACCTTTGGATTCATCTCGGAGCACTCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   93  AACCAGATTGGCTCTGGCCTGGCCGAGTTCCAGAGCCCCCTCCACTCACCTTTGGATTCATCTCGGAGCACTCG  166

Query  297  GCACCATGGGCTGGTGGAACGGGTGCAGCGAGATCCTCGAAGAATGGTGTCCCCACTTCGCCGATACACCCGCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  167  GCACCATGGGCTGGTGGAACGGGTGCAGCGAGATCCTCGAAGAATGGTGTCCCCACTTCGCCGATACACCCGCC  240

Query  371  ACATTGACAGCTCTCCCTATAGTCCTGCCTACTTATCTCCTCCCCCAGAGTCTAGCTGGCGAAGGACGATGGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  ACATTGACAGCTCTCCCTATAGTCCTGCCTACTTATCTCCTCCCCCAGAGTCTAGCTGGCGAAGGACGATGGCC  314

Query  445  TGGGGCAATTTCCCTGCAGAGAAGGGGCAGTTGTTTCGACTACCATCTGCACTTAACAGGACAAGCTCTGACTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct  315  TGGGGCAATTTCCCTGCAGAGAAGGGGCAGTTGTTTCGACTACCATCTGCACTTAACA----------------  372

Query  519  TGCCCTTCATACAAGTGTGATGAACCCCAGTCCCCAGGATACCTACCCAGGCCCCACACCTCCCAGCATCCTGC  592
                                                                                      
Sbjct  373  --------------------------------------------------------------------------  372

Query  593  CCAGCCGACGTGGGGGTATTCTGGATGGTGAAATGGACCCCA---------------AAGTACCTGCTATTGAG  651
                          ||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||
Sbjct  373  --------------GGTATTCTGGATGGTGAAATGGACCCCAAAGTCTTTCTCTTTCAAGTACCTGCTATTGAG  432

Query  652  GAGAACTTGCTAGATGACAAGCATTTGCTGAAGCCATGGGATGCTAAGAAGCTATCCTCATCCTCTTCCCGACC  725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  433  GAGAACTTGCTAGATGACAAGCATTTGCTGAAGCCATGGGATGCTAAGAAGCTATCCTCATCCTCTTCCCGACC  506

Query  726  TCGGTCCTGTGAAGTCCCTGGAATTAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCCAATGTGCCTGTCCTCCCAC  799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  507  TCGGTCCTGTGAAGTCCCTGGAATTAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCCAATGTGCCTGTCCTCCCAC  580

Query  800  CTGCCATGAACACGGGGGGCTCCCTACCTGACCTCACCAACCTGCACTTTCCCCCACCACTGCCCACCCCCCTG  873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  581  CTGCCATGAACACGGGGGGCTCCCTACCTGACCTCACCAACCTGCACTTTCCCCCACCACTGCCCACCCCCCTG  654

Query  874  GACCCTGAAGAGACAGCCTACCCTAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCTCCAATTTGACCCACACCATGACTCA  947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  655  GACCCTGAAGAGACAGCCTACCCTAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCTCCAATTTGACCCACACCATGACTCA  728

Query  948  CCTGGGCATCAGCAGGGGCATGGGCCTGGGCCCAGGCTATGATGCACCAGGACTTCATTCACCTCTCAGCCACC  1021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  729  CCTGGGCATCAGCAGGGGCATGGGCCTGGGCCCAGGCTATGATGCACCAGGACTTCATTCACCTCTCAGCCACC  802

Query 1022  CATCCCTGCAGTCCTCCCTAAGCAATCCCAACCTCCAGGCTTCCCTGAGCAGTCCTCAGCCCCAGCTTCAGGGC  1095
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  803  CATCCCTGCAGTCCTCCCTAAGCAATCCCAACCTCCAGGCTTCCCTGAGCAGTCCTCAGCCCCAGCTTCAGGGC  876

Query 1096  TCCCACAGCCACCCCTCTCTGCCTGCCTCCTCCTTGGCCCGCCATGTACTGCCCACCACCTCCCTGGGCCACCC  1169
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  877  TCCCACAGCCACCCCTCTCTGCCTGCCTCCTCCTTGGCCCGCCATGTACTGCCCACCACCTCCCTGGGCCACCC  950

Query 1170  CTCACTCAGTGCTCCGGCTCTTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCACTTCATCTCCTGTTTTGGGCGCCCCCT  1243
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  951  CTCACTCAGTGCTCCGGCTCTCTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCACTTCATCTCCTGTTTTGGGCGCCCCCT  1024

Query 1244  CTTACCCTGCTTCTACCCCTGGGGCCTCCCCCCACCACCGCCGTGTGCCCCTCAGCCCCCTGAGTTTGCTCGCG  1317
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025  CTTACCCTGCTTCTACCCCTGGGGCCTCCCCCCACCACCGCCGTGTGCCCCTCAGCCCCCTGAGTTTGCTCGCG  1098

Query 1318  GGCCCAGCCGACGCCAGAAGGTCCCAACAGCAGCTGCCCAAACAGTTTTCGCCAACAATGTCACCCACCTTGTC  1391
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099  GGCCCAGCCGACGCCAGAAGGTCCCAACAGCAGCTGCCCAAACAGTTTTCGCCAACAATGTCACCCACCTTGTC  1172

Query 1392  TTCCATCACTCAGGGCGTCCCCCTGGATACCAGTAAACTGTCCACTGACCAGCGGTTACCCCCATACCCATACA  1465
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173  TTCCATCACTCAGGGCGTCCCCCTGGATACCAGTAAACTGTCCACTGACCAGCGGTTACCCCCATACCCATACA  1246

Query 1466  GCTCCCCAAGTCTGGTTCTGCCTACCCAGCCCCACACCCCAAAGTCTCTACAGCAGCCAGGGCTGCCCTCTCAG  1539
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1247  GCTCCCCAAGTCTGGTTCTGCCTACCCAGCCCCACACCCCAAAGTCTCTACAGCAGCCAGGGCTGCCCTCTCAG  1320

Query 1540  TCTTGTTCAGTGCAGTCCTCAGGTGGGCAGCCCCCAGGCAGGCAGTCTCATTATGGGACACCGTACCCACCTGG  1613
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321  TCTTGTTCAGTGCAGTCCTCAGGTGGGCAGCCCCCAGGCAGGCAGTCTCATTATGGGACACCGTACCCACCTGG  1394

Query 1614  GCCCAGTGGGCATGGGCAACAGTCTTACCACCGGCCAATGAGTGACTTCAACCTGGGGAATCTGGAGCAGTTCA  1687
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1395  GCCCAGTGGGCATGGGCAACAGTCTTACCACCGGCCAATGAGTGACTTCAACCTGGGGAATCTGGAGCAGTTCA  1468

Query 1688  GCATGGAGAGCCCATCAGCCAGCCTGGTGCTGGATCCCCCTGGCTTTTCTGAAGGGCCTGGATTTTTAGGGGGT  1761
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1469  GCATGGAGAGCCCATCAGCCAGCCTGGTGCTGGATCCCCCTGGCTTTTCTGAAGGGCCTGGATTTTTAGGGGGT  1542

Query 1762  GAGGGGCCAATGGGTGGCCCCCAGGATCCCCACACCTTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGG  1835
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1543  GAGGGGCCAATGGGTGGCCCCCAGGATCCCCACACCTTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGG  1616

Query 1836  CTCAGGGCCTAACATCATCCTCACAGGGGACTCCTCTCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCCG  1909
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1617  CTCAGGGCCTAACATCATCCTCACAGGGGACTCCTCTCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCCG  1690

Query 1910  GAGTGCCTGGCTTTGAGGTGTCAGCAGCTGGATTGGAGCTAGGGCTTGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAG  1983
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1691  GAGTGCCTGGCTTTGAGGTGTCAGCAGCTGGATTGGAGCTAGGGCTTGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAG  1764

Query 1984  CCACTGGGCCTGGAAGGGCTAAACATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGATCCTGCTGTGGAGGAGTC  2057
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1765  CCACTGGGCCTGGAAGGGCTAAACATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGATCCTGCTGTGGAGGAGTC  1838

Query 2058  ATTCCGCAGTGACCGGCTCCAA  2079
            ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1839  ATTCCGCAGTGACCGGCTCCAA  1860