Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09804
- Subject:
- XR_001737031.2
- Aligned Length:
- 2671
- Identities:
- 1672
- Gaps:
- 999
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 AACAGGTCAGGGCTAGGCTGGGGCCGGGTTCGCGGTGCTCGCTGAGGCGGCGGTGGCTACGGCTGGAGGAGCCG 74
Query 1 ------------------------------------------------------------------ATGGCGAC 8
||||||||
Sbjct 75 GGCCGAGGCCGCGGCGGAGGCCGCGGCTGGTACTGGGAGGGTGGCAGGGAGGGACGGGGAAGGAAGATGGCGAC 148
Query 9 GTCGGGGGCGAACGGGCCTGGTTCGGCCACGGCCTCGGCTTCCAATCCGCGCAAATTTAGTGAGAAGATTGCGC 82
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GTCGGGGGCGAACGGGCCTGGTTCGGCCACGGCCTCGGCTTCCAATCCGCGCAAATTTAGTGAGAAGATTGCGC 222
Query 83 TGCAGAAGCAGCGTCAGGCCGAGGAGACGGCGGCCTTCGAGGAGGTGATGATGGACATCGGCTCCACCCGGTTA 156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TGCAGAAGCAGCGTCAGGCCGAGGAGACGGCGGCCTTCGAGGAGGTGATGATGGACATCGGCTCCACCCGGTTA 296
Query 157 CAGGCCCAAAAACTGCGACTGGCATACACAAGGAGCTCTCATTATGGTGGGTCTCTGCCCAATGTTAACCAGAT 230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAGGCCCAAAAACTGCGACTGGCATACACAAGGAGCTCTCATTATGGTGGGTCTCTGCCCAATGTTAACCAGAT 370
Query 231 TGGCTCTGGCCTGGCCGAGTTCCAGAGCCCCCTCCACTCACCTTTGGATTCATCTCGGAGCACTCGGCACCATG 304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGGCTCTGGCCTGGCCGAGTTCCAGAGCCCCCTCCACTCACCTTTGGATTCATCTCGGAGCACTCGGCACCATG 444
Query 305 GGCTGGTGGAACGGGTGCAGCGAGATCCTCGAAGAATGGTGTCCCCACTTCGCCGATACACCCGCCACATTGAC 378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGCTGGTGGAACGGGTGCAGCGAGATCCTCGAAGAATGGTGTCCCCACTTCGCCGATACACCCGCCACATTGAC 518
Query 379 AGCTCTCCCTATAGTCCTGCCTACTTATCTCCTCCCCCAGAGTCTAGCTGGCGAAGGACGATGGCCTGGGGCAA 452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGCTCTCCCTATAGTCCTGCCTACTTATCTCCTCCCCCAGAGTCTAGCTGGCGAAGGACGATGGCCTGGGGCAA 592
Query 453 TTTCCCTGCAGAGAAGGGGCAGTTGTTTCGACTACCATCTGCACTTAACAGGACAAGCTCTGACTCTGCCCTTC 526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTTCCCTGCAGAGAAGGGGCAGTTGTTTCGACTACCATCTGCACTTAACAGGACAAGCTCTGACTCTGCCCTTC 666
Query 527 ATACAAGTGTGATGAACCCCAGTCCCCAGGATACCTACCCAGGCCCCACACCTCCCAGCATCCTGCCCAGCCGA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATACAAGTGTGATGAACCCCAGTCCCCAGGATACCTACCCAGGCCCCACACCTCCCAGCATCCTGCCCAGCCGA 740
Query 601 CGTGGGGGTATTCTGGATGGTGAAATGGACCCCA---------------AAGTACCTGCTATTGAGGAGAACTT 659
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CGTGGGGGTATTCTGGATGGTGAAATGGACCCCAAAGTCTTTCTCTTTCAAGTACCTGCTATTGAGGAGAACTT 814
Query 660 GCTAGATGACAAGCATTTGCTGAAGCCATGGGATGCTAAGAAGCTATCCTCATCCTCTTCCCGACCTCGGTCCT 733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCTAGATGACAAGCATTTGCTGAAGCCATGGGATGCTAAGAAGCTATCCTCATCCTCTTCCCGACCTCGGTCCT 888
Query 734 GTGAAGTCCCTGGAATTAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCCAATGTGCCTGTCCTCCCACCTGCCATG 807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTGAAGTCCCTGGAATTAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCCAATGTGCCTGTCCTCCCACCTGCCATG 962
Query 808 AACACGGGGGGCTCCCTACCTGACCTCACCAACCTGCACTTTCCCCCACCACTGCCCACCCCCCTGGACCCTGA 881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AACACGGGGGGCTCCCTACCTGACCTCACCAACCTGCACTTTCCCCCACCACTGCCCACCCCCCTGGACCCTGA 1036
Query 882 AGAGACAGCCTACCCTAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCTCCAATTTGACCCACACCATGACTCACCTGGGCA 955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGAGACAGCCTACCCTAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCTCCAATTTGACCCACACCATGACTCACCTGGGCA 1110
Query 956 TCAGCAGGGGCATGGGCCTGGGCCCAGGCTATGATGCACCAGGACTTCATTCACCTCTCAGCCACCCATCCCTG 1029
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCAGCAGGGGCATGGGCCTGGGCCCAGGCTATGATGCAC----------------------------------- 1149
Query 1030 CAGTCCTCCCTAAGCAATCCCAACCTCCAGGCTTCCCTGAGCAGTCCTCAGCCCCAGCTTCAGGGCTCCCACAG 1103
Sbjct 1150 -------------------------------------------------------------------------- 1149
Query 1104 CCACCCCTCTCTGCCTGCCTCCTCCTTGGCCCGCCATGTACTGCCCACCACCTCCCTGGGCCACCCCTCACTCA 1177
Sbjct 1150 -------------------------------------------------------------------------- 1149
Query 1178 GTGCTCCGGCTCTTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCACTTCATCTCCTGTTTTGGGCGCCCCCTCTTACCCT 1251
Sbjct 1150 -------------------------------------------------------------------------- 1149
Query 1252 GCTTCTACCCCTGGGGCCTCCCCCCACCACCGCCGTGTGCCCCTCAGCCCCCTGAGTTTGCTCGCGGGCCCAGC 1325
Sbjct 1150 -------------------------------------------------------------------------- 1149
Query 1326 CGACGCCAGAAGGTCCCAACAGCAGCTGCCCAAACAGTTTTCGCCAACAATGTCACCCACCTTGTCTTCCATCA 1399
Sbjct 1150 -------------------------------------------------------------------------- 1149
Query 1400 CTCAGGGCGTCCCCCTGGATACCAGTAAACTGTCCACTGACCAGCGGTTACCCCCATACCCATACAGCTCCCCA 1473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1150 --CAGGGCGTCCCCCTGGATACCAGTAAACTGTCCACTGACCAGCGGTTACCCCCATACCCATACAGCTCCCCA 1221
Query 1474 AGTCTGGTTCTGCCTACCCAGCCCCACACCCCAAAGTCTCTACAGCAGCCAGGGCTGCCCTCTCAGTCTTGTTC 1547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1222 AGTCTGGTTCTGCCTACCCAGCCCCACACCCCAAAGTCTCTACAGCAGCCAGGGCTGCCCTCTCAGTCTTGTTC 1295
Query 1548 AGTGCAGTCCTCAGGTGGGCAGCCCCCAGGCAGGCAGTCTCATTATGGGACACCGTACCCACCTGGGCCCAGTG 1621
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1296 AGTGCAGTCCTCAGGTGGGCAGCCCCCAGGCAGGCAGTCTCATTATGGGACACCGTACCCACCTGGGCCCAGTG 1369
Query 1622 GGCATGGGCAACAGTCTTACCACCGGCCAATGAGTGACTTCAACCTGGGGAATCTGGAGCAGTTCAGCATGGAG 1695
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1370 GGCATGGGCAACAGTCTTACCACCGGCCAATGAGTGACTTCAACCTGGGGAATCTGGAGCAGTTCAGCATGGAG 1443
Query 1696 AGCCCATCAGCCAGCCTGGTGCTGGATCCCCCTGGCTTTTCTGAAGGGCCTGGATTTTTAGGGGGTGAGGGGCC 1769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1444 AGCCCATCAGCCAGCCTGGTGCTGGATCCCCCTGGCTTTTCTGAAGGGCCTGGATTTTTAGGGGGTGAGGGGCC 1517
Query 1770 AATGGGTGGCCCCCAGGATCCCCACACCTTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGGCTCAGGGC 1843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1518 AATGGGTGGCCCCCAGGATCCCCACACCTTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGGCTCAGGGC 1591
Query 1844 CTAACATCATCCTCACAGGGGACTCCTCTCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCCGGAGTGCCT 1917
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1592 CTAACATCATCCTCACAGGGGACTCCTCTCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCCGGAGTGCCT 1665
Query 1918 GGCTTTGAGGTGTCAGCAGCTGGATTGGAGCTAGGGCTTGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAGCCACTGGG 1991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1666 GGCTTTGAGGTGTCAGCAGCTGGATTGGAGCTAGGGCTTGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAGCCACTGGG 1739
Query 1992 CCTGGAAGGGCTAAACATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGATCCTGCTGTGGAGGAGTCATTCCGCA 2065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740 CCTGGAAGGGCTAAACATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGATCCTGCTGTGGAGGAGTCATTCCGCA 1813
Query 2066 GTGACCGGCTCCAA------------------------------------------------------------ 2079
||||||||||||||
Sbjct 1814 GTGACCGGCTCCAATGAGGGCACCTCATCACCATCCCTCTTCTTGGCCCCATCCCCCACCACCATTCCTTTCCT 1887
Query 2080 -------------------------------------------------------------------------- 2079
Sbjct 1888 CCCTTCCCCCTGGCAGGTAGAGACTCTACTCTCTGTCCCCAGATCCTCTTTCTAGCATGAATGAAGGATGCCAA 1961
Query 2080 -------------------------------------------------------------------------- 2079
Sbjct 1962 GAATGAGAAAAAGCAAGGGGTTTGTCCAGGTGGCCCCTGAATTCTGCGCAAGGGATGGGCCTGGGGGAACTCAA 2035
Query 2080 -------------------------------------------------------------------------- 2079
Sbjct 2036 GGGAGGGCCTAAAGCACTTGTAACTTTGAACCGTCTGTCTGGAGGTCAGAGCCTGTTGGAAAGCAGGGGTAGAG 2109
Query 2080 -------------------------------------------------------------------------- 2079
Sbjct 2110 GGGAGCCCTGGAAGCAGGGCTTTTCCGGATGCCTAGGGGTGGGCAGTGCCAGCCCCTCCTCACCACTCTTCCCC 2183
Query 2080 -------------------------------------------------------------------------- 2079
Sbjct 2184 TTGCAGTGGAGGAGAGAGCCAGAGTGGATACTATTTTTTATTAAATATATTATTATATGTTAATAAAAAAATCA 2257
Query 2080 ------- 2079
Sbjct 2258 TATCAAA 2264