Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_09814
Subject:
XM_011524493.1
Aligned Length:
1026
Identities:
1004
Gaps:
21

Alignment

Query    1  ATGCTCCAAGGCCACAGCTCTGTGTTCCAGGCCTTGCTGGGGACCTTCTTCACCTGGGGGATGACAGCAGCTGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTCCAAGGCCACAGCTCTGTGTTCCAGGCCTTGCTGGGGACCTTCTTCACCTGGGGGATGACAGCAGCTGG  74

Query   75  GGCAGCTCTCGTGTTCGTATTCTCTAGTGGACAGAGGCGGATCTTAGATGGAAGTCTTGGCTTTGCTGCAGGGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCAGCTCTCGTGTTCGTATTCTCTAGTGGACAGAGGCGGATCTTAGATGGAAGTCTTGGCTTTGCTGCAGGGG  148

Query  149  TCATGTTGGCAGCTTCCTATTGGTCTCTTCTGGCCCCAGCAGTTGAGATGGCCACGTCCTCTGGGGGCTTCGGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCATGTTGGCAGCTTCCTATTGGTCTCTTCTGGCCCCAGCAGTTGAGATGGCCACGTCCTCTGGGGGCTTCGGT  222

Query  223  GCCTTTGCCTTCTTCCCTGTGGCTGTTGGCTTCACCCTTGGAGCGGCTTTTGTCTACTTGGCTGACCTCCTGAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCTTTGCCTTCTTCCCTGTGGCTGTTGGCTTCACCCTTGGAGCGGCTTTTGTCTACTTGGCTGACCTCCTGAT  296

Query  297  GCCTCACTTGGGTGCAGCAGAAGACCCCCAGACGGCCCTGGCACTGAACTTCGGCTCTACGTTGATGAAGAAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCCTCACTTGGGTGCAGCAGAAGACCCCCAGACGACCCTGGCACTGAACTTCGGCTCTACGTTGATGAAGAAGA  370

Query  371  AGTCTGATCCTGAGGGTCCCGCGCTGCTCTTCCCTGAGAGTGAACTTTCCATCCGGAT----------------  428
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct  371  AGTCTGATCCTGAGGGTCCCGCGCTGCTCTTCCCTGAGAGTGAACTTTCCATCCGGATAGGTAGAGCTGGGCTT  444

Query  429  -----AGACAAGAGTGAGAATGGTGAGGCATATCAGAGAAAGAAGGCGGCAGCCACTGGCCTTCCAGAGGGTCC  497
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTTTCAGACAAGAGTGAGAATGGTGAGGCATATCAGAGAAAGAAGGCGGCAGCCACTGGCCTTCCAGAGGGTCC  518

Query  498  TGCTGTCCCTGTGCCTTCTCGAGGGAATCTGGCACAGCCCGGCGGCAGCAGCTGGAGGAGGATCGCACTGCTCA  571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCTGTCCCTGTGCCTTCTCGAGGGAATCTGGCACAGCCCGGCGGCAGCAGCTGGAGGAGGATCGCACTGCTCA  592

Query  572  TCTTGGCCATCACTATACACAACGTTCCAGAGGGTCTCGCTGTTGGAGTTGGATTTGGGGCTATAGAAAAGACG  645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTTGGCCATCACTATACACAACGTTCCAGAGGGTCTCGCTGTTGGAGTTGGATTTGGGGCTATAGAAAAGACG  666

Query  646  GCATCTGCTACCTTTGAGAGTGCCAGGAATTTGGCCATTGGAATCGGGATCCAGAATTTCCCCGAGGGCCTGGC  719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCATCTGCTACCTTTGAGAGTGCCAGGAATTTGGCCATTGGAATCGGGATCCAGAATTTCCCCGAGGGCCTGGC  740

Query  720  TGTCAGCCTTCCCTTGCGAGGGGCAGGCTTCTCCACCTGGAGAGCTTTCTGGTATGGGCAGCTGAGCGGCATGG  793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTCAGCCTTCCCTTGCGAGGGGCAGGCTTCTCCACCTGGAGAGCTTTCTGGTATGGGCAGCTGAGCGGCATGG  814

Query  794  TGGAGCCCCTGGCCGGGGTCTTTGGTGCCTTTGCCGTGGTGCTGGCTGAGCCCATCCTGCCCTACGCTCTGGCC  867
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGAGCCCCTGGCCGGGGTCTTTGGTGCCTTTGCCGTGGTGCTGGCTGAGCCCATCCTGCCCTACGCTCTGGCC  888

Query  868  TTTGCTGCCGGTGCCATGGTCTACGTGGTCATGGACGACATCATCCCCGAAGCCCAGATCAGTGGTAATGGGAA  941
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTGCTGCCGGTGCCATGGTCTACGTGGTCATGGACGACATCATCCCCGAAGCCCAGATCAGTGGTAATGGGAA  962

Query  942  ACTGGCATCCTGGGCCTCCATCCTGGGATTTGTAGTGATGATGTCACTGGACGTTGGCCTGGGC  1005
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACTGGCATCCTGGGCCTCCATCCTGGGATTTGTAGTGATGATGTCACTGGACGTTGGCCTGGGC  1026