Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09814
• Subject: XM_017024334.2
• Aligned Length: 1005
• Identities: 852
• Gaps: 150

Alignment

Query    1  ATGCTCCAAGGCCACAGCTCTGTGTTCCAGGCCTTGCTGGGGACCTTCTTCACCTGGGGGATGACAGCAGCTGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTCCAAGGCCACAGCTCTGTGTTCCAGGCCTTGCTGGGGACCTTCTTCACCTGGGGGATGACAGCAGCTGG  74

Query   75  GGCAGCTCTCGTGTTCGTATTCTCTAGTGGACAGAGGCGGATCTTAGATGGAAGTCTTGGCTTTGCTGCAGGGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCAGCTCTCGTGTTCGTATTCTCTAGTGGACAGAGGCGGATCTTAGATGGAAGTCTTGGCTTTGCTGCAGGGG  148

Query  149  TCATGTTGGCAGCTTCCTATTGGTCTCTTCTGGCCCCAGCAGTTGAGATGGCCACGTCCTCTGGGGGCTTCGGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCATGTTGGCAGCTTCCTATTGGTCTCTTCTGGCCCCAGCAGTTGAGATGGCCACGTCCTCTGGGGGCTTCGGT  222

Query  223  GCCTTTGCCTTCTTCCCTGTGGCTGTTGGCTTCACCCTTGGAGCGGCTTTTGTCTACTTGGCTGACCTCCTGAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCTTTGCCTTCTTCCCTGTGGCTGTTGGCTTCACCCTTGGAGCGGCTTTTGTCTACTTGGCTGACCTCCTGAT  296

Query  297  GCCTCACTTGGGTGCAGCAGAAGACCCCCAGACGGCCCTGGCACTGAACTTCGGCTCTACGTTGATGAAGAAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCCTCACTTGGGTGCAGCAGAAGACCCCCAGACGACCCTGGCACTGAACTTCGGCTCTACGTTGATGAAGAAGA  370

Query  371  AGTCTGATCCTGAGGGTCCCGCGCTGCTCTTCCCTGAGAGTGAACTTTCCATCCGGATAGACAAGAGTGAGAAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||      
Sbjct  371  AGTCTGATCCTGAGGGTCCCGCGCTGCTCTTCCCTGAGAGTGAACTTTCCATCCGGATAG------GT------  432

Query  445  GGTGAGGCATATCAGAGAAAGAAGGCGGCAGCCACTGGCCTTCCAGAGGGTCCTGCTGTCCCTGTGCCTTCTCG  518
                         ||||                 ||||.||||                               
Sbjct  433  -------------AGAG-----------------CTGGGCTTC-------------------------------  445

Query  519  AGGGAATCTGGCACAGCCCGGCGGCAGCAGCTGGAGGAGGATCGCACTGCTCATCTTGGCCATCACTATACACA  592
                                                                                      
Sbjct  446  --------------------------------------------------------------------------  445

Query  593  ACGTTCCAGAGGGTCTCGCTGTTGGAGTTGGATTTGGGGCTATAGAAAAGACGGCATCTGCTACCTTTGAGAGT  666
               ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  446  ---TTTCAGAGGGTCTCGCTGTTGGAGTTGGATTTGGGGCTATAGAAAAGACGGCATCTGCTACCTTTGAGAGT  516

Query  667  GCCAGGAATTTGGCCATTGGAATCGGGATCCAGAATTTCCCCGAGGGCCTGGCTGTCAGCCTTCCCTTGCGAGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  GCCAGGAATTTGGCCATTGGAATCGGGATCCAGAATTTCCCCGAGGGCCTGGCTGTCAGCCTTCCCTTGCGAGG  590

Query  741  GGCAGGCTTCTCCACCTGGAGAGCTTTCTGGTATGGGCAGCTGAGCGGCATGGTGGAGCCCCTGGCCGGGGTCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  GGCAGGCTTCTCCACCTGGAGAGCTTTCTGGTATGGGCAGCTGAGCGGCATGGTGGAGCCCCTGGCCGGGGTCT  664

Query  815  TTGGTGCCTTTGCCGTGGTGCTGGCTGAGCCCATCCTGCCCTACGCTCTGGCCTTTGCTGCCGGTGCCATGGTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  TTGGTGCCTTTGCCGTGGTGCTGGCTGAGCCCATCCTGCCCTACGCTCTGGCCTTTGCTGCCGGTGCCATGGTC  738

Query  889  TACGTGGTCATGGACGACATCATCCCCGAAGCCCAGATCAGTGGTAATGGGAAACTGGCATCCTGGGCCTCCAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  TACGTGGTCATGGACGACATCATCCCCGAAGCCCAGATCAGTGGTAATGGGAAACTGGCATCCTGGGCCTCCAT  812

Query  963  CCTGGGATTTGTAGTGATGATGTCACTGGACGTTGGCCTGGGC  1005
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  CCTGGGATTTGTAGTGATGATGTCACTGGACGTTGGCCTGGGC  855