Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09833
- Subject:
- NM_001308045.1
- Aligned Length:
- 2265
- Identities:
- 2126
- Gaps:
- 138
Alignment
Query 1 ATGAAAAAACAGAGGAAAATTCTATGGAGGAAAGGAATCCACTTAGCCTTTTCTGAGAAATGGAATACTGGGTT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAAAAACAGAGGAAAATTCTATGGAGGAAAGGAATCCACTTAGCCTTTTCTGAGAAATGGAATACTGGGTT 74
Query 75 TGGAGGCTTTAAGAAGTTTTATTTTCACCAACACTTGTGCATTCTGAAAGCTAAGCTGGGAAGGCCAGTTACTT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGGAGGCTTTAAGAAGTTTTATTTTCACCAACACTTGTGCATTCTGAAAGCTAAGCTGGGAAGGCCAGTTACTT 148
Query 149 GGAATAGACAGTTGAGACATTTCCAGGGTAGAAAGAAAGCTCTTCAAATCCAGAAAACGTGGATCAAGGATGAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GGAATAGACAGTTGAGACATTTCCAGGGTAGAAAGAAAGCTCTTCAAATCCAGAAAACGTGGATCAAGGATGAA 222
Query 223 CACCTTTGTGCTAAGACCAAGTTCAATGTGGCTACTCAAAATGTTAGTACTTTGTCCTCTAAAGTGAAAAGAAA 296
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCCCTTTGTGCTAAGACCAAGTTCAATGTGGCTACTCAAAATGTTAGTACTTTGTCCTCTAAAGTGAAAAGAAA 296
Query 297 GGACGCTAAACACTTCATTTCCTCCTCAAAGACTCTCCTGAGACTCCAAGCAGAGAAGCTGTTGTCATCAGCAA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGACGCTAAACACTTCATTTCCTCCTCAAAGACTCTCCTGAGACTCCAAGCAGAGAAGCTGTTGTCATCAGCAA 370
Query 371 AGAATTCTGACCATGAATACTGCAGAGAGAAAAATCTCTTGAAGGCAGTTACTGACTTTCCATCAAATAGTGCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGAATTCTGACCATGAATACTGCAGAGAGAAAAATCTCTTGAAGGCAGTTACTGACTTTCCATCAAATAGTGCT 444
Query 445 TTAGGTCAGGCCAATGGTCACAGACCTAGGACAGACCCACAACCTTCTGACTTTCCCATGAAGTTCAATGGGGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTAGGTCAGGCCAATGGTCACAGACCTAGGACAGACCCACAACCTTCTGACTTTCCCATGAAGTTCAATGGGGA 518
Query 519 GAGCCAAAGTCCAGGTGAGAGTGGCACGATTGTGGTCACCTTGAACAACCATAAGAGAAAGGGCTTTTGTTACG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAGCCAAAGTCCAGGTGAGAGTGGCACGATTGTGGTCACCTTGAACAACCATAAGAGAAAGGGCTTTTGTTACG 592
Query 593 GCTGCTGCCAAGGGCCGGAGCACCACAGGAATGGGGGACCCTTGATTCCAAAAAAGTTCCAACTTAACCAACAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCTGCTGCCAAGGGCCGGAGCACCACAGGAATGGGGGACCCTTGATTCCAAAAAAGTTCCAACTTAACCAACAT 666
Query 667 AGAAGGATAAAATTATCTCCTCTTATGATGTATGAGAAATTATCCATGATTAGATTTCGGTACAGGATTCTCAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGAAGGATAAAATTATCTCCTCTTATGATGTATGAGAAATTATCCATGATTAGATTTCGGTACAGGATTCTCAG 740
Query 741 ATCCCAGCACTTCAGAACCAAAAGCAAGGTTTGCAAGCTAAGAAAAGCCCAGCGAAGCTGGGTACAGAAAGTCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATCCCAGCACTTCAGAACCAAAAGCAAGGTTTGCAAGCTAAGAAAAGCCCAGCGAAGCTGGGTACAGAAAGTCA 814
Query 815 CTGGGGACCATCAAGAGACCCGTAGGGAGAACGGTGAGGGTGGCAGTTGCAGCCCATTTCCTTCCCCAGAACCT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTGGGGACCATCAAGAGACCCGTAGGGAGAACGGTGAGGGTGGCAGTTGCAGCCCATTTCCTTCCCCAGAACCT 888
Query 889 AAAGACCCTTCTTGTCGGCATCAGCCGTACTTTCCAGATATGGACAGCAGTGCTGTGGTGAAGGGGACGAACTC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAAGACCCTTCTTGTCGGCATCAGCCGTACTTTCCAGATATGGACAGCAGTGCTGTGGTGAAGGGGACGAACTC 962
Query 963 TCATGTGCCTGATTGCCACACTAAAGGAAGCTCTTTCTTGGGCAAGGAGCTTAGTTTAGACGAAGCATTCCCTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TCATGTGCCTGATTGCCACACTAAAGGAAGCTCTTTCTTGGGCAAGGAGCTTAGTTTAGACGAAGCATTCCCTG 1036
Query 1037 ACCAACAGAATGGCAGTGCCACAAACGCCTGGGACCAGTCATCCTGTTCTTCTCCTAAGTGGGAGTGTACAGAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACCAACAGAATGGCAGTGCCACAAACGCCTGGGACCAGTCATCCTGTTCTTCTCCTAAGTGGGAGTGTACAGAG 1110
Query 1111 CTGATTCATGACATCCCCTTACCAGAACATCGTTCTAATACCATGTTCATTTCAGAAACTGAAAGAGAAATTAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTGATTCATGACATCCCCTTACCAGAACATCGTTCTAATACCATGTTCATTTCAGAAACTGAAAGAGAAATTAT 1184
Query 1185 GACTCTGGGTCAGGAAAATCAGACAAGTTCTGTCAGTGATGACAGAGTAAAACTGTCAGTGTCTGGAGCAGATA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GACTCTGGGTCAGGAAAATCAGACAAGTTCTGTCAGTGATGACAGAGTAAAACTGTCAGTGTCTGGAGCAGATA 1258
Query 1259 CATCTGTGAGTAGCGTAGATGGGCCTGTGTCCCAAAAGGCTGTTCAAAATGAGAACTCATACCAGATGGAGGAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CATCTGTGAGTAGCGTAGATGGGCCTGTGTCCCAAAAGGCTGTTCAAAATGAGAACTCATACCAGATGGAGGAG 1332
Query 1333 GATGGATCTCTCAAGCAGAGCATTCTTAGTTCTGAGTTGCTGGACCACCCTTACTGTAAAAGTCCACTGGAGGC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GATGGATCTCTCAAGCAGAGCATTCTTAGTTCTGAGTTGCTGGACCACCCTTACTGTAAAAGTCCACTGGAGGC 1406
Query 1407 TCCCTTGGTGTGCAGTGGACTCAAACTAGAAAATCAAGTAGGAGGTGGAAAGAACAGTCAGAAAGCCTCTCCAG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TCCCTTGGTGTGCAGTGGACTCAAACTAGAAAATCAAGTAGGAGGTGGAAAGAACAGTCAGAAAGCCTCTCCAG 1480
Query 1481 TGGATGATGAACAGCTGTCAGTCTGTCTTTCTGGATTCCTAGATGAGGTTATGAAGAAGTATGGCAGTTTGGTT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGGATGATGAACAGCTGTCAGTCTGTCTTTCTGGATTCCTAGATGAGGTTATGAAGAAGTATGGCAGTTTGGTT 1554
Query 1555 CCACTCAGTGAAAAAGAAGTCCTTGGAAGATTAAAAGATGTCTTTAATGAAGACTTTTCTAATAGAAAACCATT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CCACTCAGTGAAAAAGAAGTCCTTGGAAGATTAAAAGATGTCTTTAATGAAGACTTTTCTAATAGAAAACCATT 1628
Query 1629 TATCAATAGGGAAATAACAAACTATCGGGCCAGACATCAAAAATGTAACTTCCGTATCTTCTATAATAAACACA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TATCAATAGGGAAATAACAAACTATCGGGCCAGACATCAAAAATGTAACTTCCGTATCTTCTATAATAAACACA 1702
Query 1703 TGCTGGATATGGACGACCTGGCGACTCTGGATGGTCAGAACTGGCTGAATGACCAGGTCATTAATATGTATGGT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TGCTGGATATGGACGACCTGGCGACTCTGGATGGTCAGAACTGGCTGAATGACCAGGTCATTAATATGTATGGT 1776
Query 1777 GAGCTGATAATGGATGCAGTCCCAGACAAAGTTCACTTCTTCAACAGCTTTTTTCATAGACAGCTGGTAACCAA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GAGCTGATAATGGATGCAGTCCCAGACAAAGTTCACTTCTTCAACAGCTTTTTTCATAGACAGCTGGTAACCAA 1850
Query 1851 AGGATATAATGGAGTAAAAAGATGGACTAAAAAGGTGGATTTGTTTAAAAAGAGTCTTCTGTTGATTCCTATTC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AGGATATAATGGAGTAAAAAGATGGACTAAAA------------------------------------------ 1882
Query 1925 ACCTGGAAGTCCACTGGTCTCTCATTACTGTGACACTCTCTAATCGAATTATTTCATTTTATGATTCCCAAGGC 1998
Sbjct 1883 -------------------------------------------------------------------------- 1882
Query 1999 ATTCATTTTAAGTTTTGTGTAGAGAATATAAGAAAGTATTTGCTGACTGAAGCCAGAGAAAAAAATAGACCTGA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1883 ----------------------AGAATATAAGAAAGTATTTGCTGACTGAAGCCAGAGAAAAAAATAGACCTGA 1934
Query 2073 ATTTCTTCAGGGTTGGCAGACTGCTGTTACGAAGTGTATTCCACAACAGAAAAACGACAGTGACTGTGGAGTCT 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1935 ATTTCTTCAGGGTTGGCAGACTGCTGTTACGAAGTGTATTCCACAACAGAAAAACGACAGTGACTGTGGAGTCT 2008
Query 2147 TTGTGCTCCAGTACTGCAAGTGCCTCGCCTTAGAGCAGCCTTTCCAGTTTTCACAAGAAGACATGCCCCGAGTG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2009 TTGTGCTCCAGTACTGCAAGTGCCTCGCCTTAGAGCAGCCTTTCCAGTTTTCACAAGAAGACATGCCCCGAGTG 2082
Query 2221 CGGAAGAGGATTTACAAGGAGCTATGTGAGTGCCGGCTCATGGAC 2265
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2083 CGGAAGAGGATTTACAAGGAGCTATGTGAGTGCCGGCTCATGGAC 2127