Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_09833
Subject:
NM_001308045.1
Aligned Length:
755
Identities:
708
Gaps:
46

Alignment

Query   1  MKKQRKILWRKGIHLAFSEKWNTGFGGFKKFYFHQHLCILKAKLGRPVTWNRQLRHFQGRKKALQIQKTWIKDE  74
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Sbjct   1  MKKQRKILWRKGIHLAFSEKWNTGFGGFKKFYFHQHLCILKAKLGRPVTWNRQLRHFQGRKKALQIQKTWIKDE  74

Query  75  HLCAKTKFNVATQNVSTLSSKVKRKDAKHFISSSKTLLRLQAEKLLSSAKNSDHEYCREKNLLKAVTDFPSNSA  148
           .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  PLCAKTKFNVATQNVSTLSSKVKRKDAKHFISSSKTLLRLQAEKLLSSAKNSDHEYCREKNLLKAVTDFPSNSA  148

Query 149  LGQANGHRPRTDPQPSDFPMKFNGESQSPGESGTIVVTLNNHKRKGFCYGCCQGPEHHRNGGPLIPKKFQLNQH  222
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Sbjct 149  LGQANGHRPRTDPQPSDFPMKFNGESQSPGESGTIVVTLNNHKRKGFCYGCCQGPEHHRNGGPLIPKKFQLNQH  222

Query 223  RRIKLSPLMMYEKLSMIRFRYRILRSQHFRTKSKVCKLRKAQRSWVQKVTGDHQETRRENGEGGSCSPFPSPEP  296
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Sbjct 223  RRIKLSPLMMYEKLSMIRFRYRILRSQHFRTKSKVCKLRKAQRSWVQKVTGDHQETRRENGEGGSCSPFPSPEP  296

Query 297  KDPSCRHQPYFPDMDSSAVVKGTNSHVPDCHTKGSSFLGKELSLDEAFPDQQNGSATNAWDQSSCSSPKWECTE  370
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Sbjct 297  KDPSCRHQPYFPDMDSSAVVKGTNSHVPDCHTKGSSFLGKELSLDEAFPDQQNGSATNAWDQSSCSSPKWECTE  370

Query 371  LIHDIPLPEHRSNTMFISETEREIMTLGQENQTSSVSDDRVKLSVSGADTSVSSVDGPVSQKAVQNENSYQMEE  444
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Sbjct 371  LIHDIPLPEHRSNTMFISETEREIMTLGQENQTSSVSDDRVKLSVSGADTSVSSVDGPVSQKAVQNENSYQMEE  444

Query 445  DGSLKQSILSSELLDHPYCKSPLEAPLVCSGLKLENQVGGGKNSQKASPVDDEQLSVCLSGFLDEVMKKYGSLV  518
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Sbjct 445  DGSLKQSILSSELLDHPYCKSPLEAPLVCSGLKLENQVGGGKNSQKASPVDDEQLSVCLSGFLDEVMKKYGSLV  518

Query 519  PLSEKEVLGRLKDVFNEDFSNRKPFINREITNYRARHQKCNFRIFYNKHMLDMDDLATLDGQNWLNDQVINMYG  592
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Sbjct 519  PLSEKEVLGRLKDVFNEDFSNRKPFINREITNYRARHQKCNFRIFYNKHMLDMDDLATLDGQNWLNDQVINMYG  592

Query 593  ELIMDAVPDKVHFFNSFFHRQLVTKGYNGVKRWTKKVDLFKKSLLLIPIHLEVHWSLITVTLSNRIISFYDSQG  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                      
Sbjct 593  ELIMDAVPDKVHFFNSFFHRQLVTKGYNGVKRWTKK--------------------------------------  628

Query 667  IHFKFCVENIRKYLLTEAREKNRPEFLQGWQTAVTKCIPQQKNDSDCGVFVLQYCKCLALEQPFQFSQEDMPRV  740
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Sbjct 629  --------NIRKYLLTEAREKNRPEFLQGWQTAVTKCIPQQKNDSDCGVFVLQYCKCLALEQPFQFSQEDMPRV  694

Query 741  RKRIYKELCECRLMD  755
           |||||||||||||||
Sbjct 695  RKRIYKELCECRLMD  709