Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09861
- Subject:
- XM_006717702.3
- Aligned Length:
- 1755
- Identities:
- 1506
- Gaps:
- 249
Alignment
Query 1 ATGTTTTCTTGTTTCTGTTTCAGCCTTCAGGATAATTCCTTCAGCAGCACCACTGTAACAGAGTGTGACGAAGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TCCAGTCTCTCTACATGAAGACCAGACTGATTGCTCCAGTCTCAGAGATGAAAACAATAAAGAGAACTACCCCG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ACGCAGGGGCTCTGGTAGAAGAGCACGCGCCGCCCTCTTGGGAGCCGCAGCAGCAGAATGTAGAGGCGACCGTG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CTGGTGGACAGCGTATTGCGACACAGCATGGGCAACTTCAAGTCCAGGAAGCCCAAGTCCATCTTCAAAGCGGA 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------ATGGGCAACTTCAAGTCCAGGAAGCCCAAGTCCATCTTCAAAGCGGA 47
Query 297 GAGCGGGAGGAGCCACGGAGAAAGTCAGGAGACAGAGCATGTGGTATCCAGCCAGTCAGAGTGTCAGGTGAGAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 48 GAGCGGGAGGAGCCACGGAGAAAGTCAGGAGACAGAGCATGTGGTATCCAGCCAGTCAGAGTGTCAGGTGAGAG 121
Query 371 CAGGAACACCAGCTCATGAGAGTCCACAAAACAATGCCTTCAAGTGCCAAGAAACAGTGCGACTTCAACCAAGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 122 CAGGAACACCAGCTCATGAGAGTCCACAAAACAATGCCTTCAAGTGCCAAGAAACAGTGCGACTTCAACCAAGA 195
Query 445 ATAGACCAGAGGACTGCCATTTCGCCAAAGGATGCTTTTGAAACTCGGCAGGACTTAAATGAGGAAGAAGCTGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 196 ATAGACCAGAGGACTGCCATTTCGCCAAAGGATGCTTTTGAAACTCGGCAGGACTTAAATGAGGAAGAAGCTGC 269
Query 519 TCAGGTGCATGGAGTCAAGGACCCGGCGCCAGCATCAACCCAGAGCGTGCTTGCCGATGGGACAGATTCTGCAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 270 TCAGGTGCATGGAGTCAAGGACCCGGCGCCAGCATCAACCCAGAGCGTGCTTGCCGATGGGACAGATTCTGCAG 343
Query 593 ACCCCTCACCAGTCCACAAAGATGGGCAGAATGAGGCCGACAGTGCACCAGAAGACCTCCACTCTGTGGGGACC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 344 ACCCCTCACCAGTCCACAAAGATGGGCAGAATGAGGCCGACAGTGCACCAGAAGACCTCCACTCTGTGGGGACC 417
Query 667 AGCAGGCTGCTCTATCACATCACTGATGGTGATAACCCACTGCTGTCGCCACGATGCTCCATCTTCAGCCAAAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 418 AGCAGGCTGCTCTATCACATCACTGATGGTGATAACCCACTGCTGTCGCCACGATGCTCCATCTTCAGCCAAAG 491
Query 741 CCAGAGATTCAACTTAGACCCCGAGTCAGCCCCATCTCCACCCAGCACTCAGCAGTTTATGATGCCGCGGAGTT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 492 CCAGAGATTCAACTTAGACCCCGAGTCAGCCCCATCTCCACCCAGCACTCAGCAGTTTATGATGCCGCGGAGTT 565
Query 815 CTTCACGCTGCAGCTGTGGAGATGGCAAGGAGCCACAGACCATCACCCAGCTCACCAAGCACATCCAGAGCCTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 566 CTTCACGCTGCAGCTGTGGAGATGGCAAGGAGCCACAGACCATCACCCAGCTCACCAAGCACATCCAGAGCCTC 639
Query 889 AAGCGGAAAATTCGGAAATTTGAAGAAAAATTTGAACAAGAAAAGAAATACCGGCCTTCACATGGTGACAAGAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 640 AAGCGGAAAATTCGGAAATTTGAAGAAAAATTTGAACAAGAAAAGAAATACCGGCCTTCACATGGTGACAAGAC 713
Query 963 TTCTAATCCTGAAGTCCTGAAATGGATGAATGATTTGGCTAAAGGTCGTAAACAGCTCAAAGAACTAAAGCTAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 714 TTCTAATCCTGAAGTCCTGAAATGGATGAATGATTTGGCTAAAGGTCGTAAACAGCTCAAAGAACTAAAGCTAA 787
Query 1037 AGCTGTCAGAAGAACAAGGGAGTGCTCCCAAAGGTCCACCTAGAAACCTGTTGTGTGAGCAACCCACAGTCCCC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 788 AGCTGTCAGAAGAACAAGGGAGTGCTCCCAAAGGTCCACCTAGAAACCTGTTGTGTGAGCAACCCACAGTCCCC 861
Query 1111 AGAGAAAATGGGAAACCGGAAGCTGCGGGCCCGGAGCCAAGCTCCTCTGGAGAAGAGACTCCAGATGCTGCCTT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 862 AGAGAAAATGGGAAACCGGAAGCTGCGGGCCCGGAGCCAAGCTCCTCTGGAGAAGAGACTCCAGATGCTGCCTT 935
Query 1185 GACATGCCTGAAGGAGAGAAGAGAGCAACTTCCTCCCCAGGAGGATTCTAAGGTAACTAAGCAAGACAAGAACC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 936 GACATGCCTGAAGGAGAGAAGAGAGCAACTTCCTCCCCAGGAGGATTCTAAGGTAACTAAGCAAGACAAGAACC 1009
Query 1259 TCATAAAGCCGCTTTATGACCGATACAGAATTATCAAGCAAATCTTGTCAACACCTTCCCTTATTCCAACAATT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010 TCATAAAGCCGCTTTATGACCGATACAGAATTATCAAGCAAATCTTGTCAACACCTTCCCTTATTCCAACAATT 1083
Query 1333 CAGGAGGAAGAGGACTCTGATGAAGACCGTCCACAGGGAAGCCAACAACCTTCTTTGGCAGATCCAGCATCTCA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1084 CAGGAGGAAGAGGACTCTGATGAAGACCGTCCACAGGGAAGCCAACAACCTTCTTTGGCAGATCCAGCATCTCA 1157
Query 1407 CCTTCCTGTTGGTGACCACCTCACCTACTCTAATGAGACTGAGCCTGTTAGGGCCCTTTTACCAGATGAAAAGA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158 CCTTCCTGTTGGTGACCACCTCACCTACTCTAATGAGACTGAGCCTGTTAGGGCCCTTTTACCAGATGAAAAGA 1231
Query 1481 AAGAAGTAAAACCACCAGCTCTCTCCATGTCTAATTTACATGAGGCTACCATGCCTGTACTTCTTGACCATCTC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1232 AAGAAGTAAAACCACCAGCTCTCTCCATGTCTAATTTACATGAGGCTACCATGCCTGTACTTCTTGACCATCTC 1305
Query 1555 CGAGAAACTAGGGCTGACAAGAAGAGACTGCGGAAAGCCTTAAGAGAATTTGAAGAACAGTTTTTTAAACAAAC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1306 CGAGAAACTAGGGCTGACAAGAAGAGACTGCGGAAAGCCTTAAGAGAATTTGAAGAACAGTTTTTTAAACAAAC 1379
Query 1629 AGGAAGAAGTCCACAAAAGGAAGATAGGATACCAATGGCAGATGAGTATTATGAATATAAGCACATAAAAGCCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 AGGAAGAAGTCCACAAAAGGAAGATAGGATACCAATGGCAGATGAGTATTATGAATATAAGCACATAAAAGCCA 1453
Query 1703 AACTGAGACTATTAGAGGTCCTCATCAGCAAGCAAGATGTGGCCAAAACTATT 1755
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1454 AACTGAGACTATTAGAGGTCCTCATCAGCAAGCAAGATGTGGCCAAAACTATT 1506