Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09864
- Subject:
- NM_001282733.1
- Aligned Length:
- 2073
- Identities:
- 2069
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ATGTGCTTCCGGACAAAGCTCTCAGTATCCTGGGTGCCATTGTTTCTTCTACTCAGCCGTGTTTTTTCTACTGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTGCTTCCGGACAAAGCTCTCAGTATCCTGGGTGCCATTGTTTCTTCTACTCAGCCGTGTTTTTTCTACTGA 74
Query 75 GACAGACAAACCCTCAGCCCAGGACAGCAGAAGCCGTGGGAGTTCAGGCCAACCGGCAGACCTGCTACAGGTTC 148
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GACAGACAAACCCTCAGCCCAGGATAGCAGAAGCCGTGGGAGTTCAGGCCAACCGGCAGACCTGCTACAGGTTC 148
Query 149 TCTCTGCTGGTGACCACCCACCCCACAACCACTCAAGAAGCCTCATCAAAACATTGTTGGAGAAAACTGGGTGC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCTCTGCTGGTGACCACCCACCCCACAACCACTCAAGAAGCCTCATCAAAACATTGTTGGAGAAAACTGGGTGC 222
Query 223 CCACGGAGGAGAAACGGAATGCAAGGAGATTGCAATCTGTGCTTTGAACCAGATGCACTATTACTAATAGCTGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCACGGAGGAGAAACGGAATGCAAGGAGATTGCAATCTGTGCTTTGAACCAGATGCACTATTACTAATAGCTGG 296
Query 297 AGGAAATTTTGAAGATCAGCTTAGAGAAGAAGTGGTCCAGAGAGTTTCTCTTCTCCTTCTCTATTACATTATTC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGGAAATTTTGAAGATCAGCTTAGAGAAGAAGTGGTCCAGAGAGTTTCTCTTCTCCTTCTCTATTACATTATTC 370
Query 371 ATCAGGAAGAGATCTGTTCTTCAAAGCTCAACATGAGTAATAAAGAGTATAAATTTTACCTACACAGCCTACTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATCAGGAAGAGATCTGTTCTTCAAAGCTCAACATGAGTAATAAAGAGTATAAATTTTACCTACACAGCCTACTG 444
Query 445 AGCCTCAGGCAGGATGAAGATTCCTCTTTCCTTTCACAGAATGAGACAGAAGATATCTTGGCTTTCACCAGGCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGCCTCAGGCAGGATGAAGATTCCTCTTTCCTTTCACAGAATGAGACAGAAGATATCTTGGCTTTCACCAGGCA 518
Query 519 GTACTTTGACACTTCTCAAAGCCAGTGTATGGAAACCAAAACGCTGCAGAAAAAATCTGGAATAGTGAGCAGTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTACTTTGACACTTCTCAAAGCCAGTGTATGGAAACCAAAACGCTGCAGAAAAAATCTGGAATAGTGAGCAGTG 592
Query 593 AAGGTGCTAATGAAAGTACGCTTCCTCAGTTGGCAGCCATGATCATTACTTTGTCCCTCCAGGGTGTTTGTCTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAGGTGCTAATGAAAGTACGCTTCCTCAGTTGGCAGCCATGATCATTACTTTGTCCCTCCAGGGTGTTTGTCTG 666
Query 667 GGACAAGGAAACTTGCCTTCCCCAGACTACTTTACAGAATATATTTTCAGTTCCTTGAATCGTACGAATACCCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGACAAGGAAACTTGCCTTCCCCAGACTACTTTACAGAATATATTTTCAGTTCCTTGAATCGTACGAATACCCT 740
Query 741 CCGCCTATCAGAACTAGACCAACTCCTCAACACTCTCTGGACCAGAAGTACTTGTATCAAAAATGAGAAAATCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCGCCTATCAGAACTAGACCAACTCCTCAACACTCTCTGGACCAGAAGTACTTGTATCAAAAATGAGAAAATCC 814
Query 815 ATCAATTTCAAAGGAAACAAAACAACATAATAACCCATGATCAGGACTATTCTAATTTCTCTTCATCCATGGAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATCAATTTCAAAGGAAACAAAACAACATAATAACCCATGATCAGGACTATTCTAATTTCTCTTCATCCATGGAA 888
Query 889 AAAGAGTCTGAGGATGGTCCAGTTTCCTGGGATCAGACCTGCTTCTCTGCTAGGCAGCTGGTGGAGATATTTCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAAGAGTCTGAGGATGGTCCAGTTTCCTGGGATCAGACCTGCTTCTCTGCTAGGCAGCTGGTGGAGATATTTCT 962
Query 963 ACAGAAGGGCCTCTCACTCATTTCTAAGGAGGACTTTAAGCAAATGAGTCCAGGGATCATCCAGCAGCTCCTCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACAGAAGGGCCTCTCACTCATTTCTAAGGAGGACTTTAAGCAAATGAGTCCAGGGATCATCCAGCAGCTCCTCA 1036
Query 1037 GCTGCTCCTGCCACTTACCCAAGGACCAACAAGCAAAGCTGCCACCTACCACTCTGGAGAAATACGGCTACAGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCTGCTCCTGCCACTTACCCAAGGACCAACAAGCAAAGCTGCCACCTACCACTCTGGAGAAATACGGCTACAGC 1110
Query 1111 ACGGTGGCTGTCACCCTTCTCACACTGGGCTCCATGCTGGGGACAGCGCTGGTCCTTTTCCATAGCTGTGAGGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACGGTGGCTGTCACCCTTCTCACACTGGGCTCCATGCTGGGGACAGCGCTGGTCCTTTTCCATAGCTGTGAGGA 1184
Query 1185 GAACTACAGGCTTATCTTACAGCTGTTTGTGGGCTTGGCCGTCGGGACACTGTCTGGGGACGCTCTGCTCCACC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GAACTACAGGCTTATCTTACAGCTGTTTGTGGGCTTGGCCGTCGGGACACTGTCTGGGGACGCTCTGCTCCACC 1258
Query 1259 TTATCCCTCAGGTTCTTGGTTTACATAAGCAGGAAGCCCCAGAATTTGGGCATTTCCATGAAAGCAAAGGTCAT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TTATCCCTCAGGTTCTTGGTTTACATAAGCAGGAAGCCCCAGAATTTGGGCATTTCCATGAAAGCAAAGGTCAT 1332
Query 1333 ATTTGGAAACTGATGGGATTAATTGGAGGCATCCATGGATTTTTCTTGATAGAAAAATGTTTTATTCTTCTTGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATTTGGAAACTGATGGGATTAATTGGAGGCATCCATGGATTTTTCTTGATAGAAAAATGTTTTATTCTTCTTGT 1406
Query 1407 ATCACCAAATGACAAGCAGGGCCTGTCATTGGTTAATGGGCACGTGGGTCATTCCCACCATCTTGCACTCAACT 1480
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ATCACCAAATGACA---AGGGCCTGTCATTGGTTAATGGGCACGTGGGTCATTCCCACCATCTTGCACTCAACT 1477
Query 1481 CTGAATTAAGTGACCAGGCAGGCAGAGGCAAATCTGCTTCAACTATCCAGTTGAAAAGCCCAGAAGATTCACAG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478 CTGAATTAAGTGACCAGGCAGGCAGAGGCAAATCTGCTTCAACTATCCAGTTGAAAAGCCCAGAAGATTCACAG 1551
Query 1555 GCAGCTGAAATGCCTATAGGCAGTATGACAGCCTCCAACAGAAAATGTAAAGCCATTAGCTTGTTAGCAATCAT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 GCAGCTGAAATGCCTATAGGCAGTATGACAGCCTCCAACAGAAAATGTAAAGCCATTAGCTTGTTAGCAATCAT 1625
Query 1629 GATTCTGGTTGGGGACAGCCTGCATAATTTTGCAGATGGCCTAGCCATAGGAGCAGCCTTCTCATCATCATCCG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 GATTCTGGTTGGGGACAGCCTGCATAATTTTGCAGATGGCCTAGCCATAGGAGCAGCCTTCTCATCATCATCCG 1699
Query 1703 AGTCAGGAGTGACCACTACGATTGCTATCTTGTGTCATGAAATCCCACATGAAATGGGAGACTTTGCCGTGCTC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700 AGTCAGGAGTGACCACTACGATTGCTATCTTGTGTCATGAAATCCCACATGAAATGGGAGACTTTGCCGTGCTC 1773
Query 1777 TTAAGCTCTGGACTTTCTATGAAGACTGCCATCCTGATGAATTTTATAAGCTCCCTAACTGCCTTCATGGGATT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 TTAAGCTCTGGACTTTCTATGAAGACTGCCATCCTGATGAATTTTATAAGCTCCCTAACTGCCTTCATGGGATT 1847
Query 1851 ATACATTGGCCTTTCCGTGTCAGCTGATCCATGTGTTCAAGACTGGATCTTCACAGTCACTGCTGGGATGTTCT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 ATACATTGGCCTTTCCGTGTCAGCTGATCCATGTGTTCAAGACTGGATCTTCACAGTCACTGCTGGGATGTTCT 1921
Query 1925 TATATTTATCCTTGGTTGAAATGCTTCCTGAAATGACTCATGTTCAAACACAACGACCCTGGATGATGTTTCTC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922 TATATTTATCCTTGGTTGAAATGCTTCCTGAAATGACTCATGTTCAAACACAACGACCCTGGATGATGTTTCTC 1995
Query 1999 CTGCAAAACTTTGGATTGATCCTAGGTTGGCTTTCTCTCCTGCTCTTGGCTATATATGAGCAAAATATTAAAAT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996 CTGCAAAACTTTGGATTGATCCTAGGTTGGCTTTCTCTCCTGCTCTTGGCTATATATGAGCAAAATATTAAAAT 2069
Query 2073 A 2073
|
Sbjct 2070 A 2070