Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09905
• Subject: NM_152769.3
• Aligned Length: 1359
• Identities: 1339
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ------------------ATGGCCACAGCCGCCACCACCACCACCACCACCACTGCCACAGTAGCCCTGACGAC  56
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAGCCCACAGCCACCATGGCCACAGCCGCCACCACCACCACCACCACCACTGCCACAGTAGCCCTGACGAC  74

Query   57  GTCGTGGGACAATGCCACTGGACGCCCCACGGCAGAGCCAGACCCCATCCTGGACAACTACGTGCTGCTGGTGG  130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTCGTGGGACAATGCCACTGGACGCCCCACGGCAGAGCCAGACCCCATCCTGGACAACTACGTGCTGCTGGTGG  148

Query  131  TGGTGATGTCGCTGTTCGTGGGGGGCACGCTGGTGGTGTTGTCTGGCGTCCTGCTCCTCTGCAAGCGCTGCTGG  204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGTGATGTCGCTGTTCGTGGGGGGCACGCTGGTGGTGTTGTCTGGCGTCCTGCTCCTCTGCAAGCGCTGCTGG  222

Query  205  GACGTCCACCAGCGCCTCAACAGGGCCATGGAGGAAGCGGAGAAGACCACCACCACCTACCTGGACAACGGCAC  278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACGTCCACCAGCGCCTCAACAGGGCCATGGAGGAAGCGGAGAAGACCACCACCACCTACCTGGACAACGGCAC  296

Query  279  CCACCCAGCCCAAGACCCCGACTTCCGGGGAGAGGACCCCGAGTGCCAGGATGCGGAGACCGAACGCTTCCTGT  352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCACCCAGCCCAAGACCCCGACTTCCGGGGAGAGGACCCCGAGTGCCAGGATGCGGAGACCGAACGCTTCCTGT  370

Query  353  CCACCAGCTCCACGGGCCGCCGGGTCTCCTTCAATGAGGCGGCGCTGTTTGAGCAGAGCCGCAAGACGCAGGAC  426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCACCAGCTCCACGGGCCGCCGGGTCTCCTTCAATGAGGCGGCGCTGTTTGAGCAGAGCCGCAAGACGCAGGAC  444

Query  427  AAGGGTCGCCGGTACACACTGACGGAGGGGGACTTCCACCACCTGAAGAATGCCCGGCTCACGCACCTGCACCT  500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGGGTCGCCGGTACACACTGACGGAGGGGGACTTCCACCACCTGAAGAATGCCCGGCTCACGCACCTGCACCT  518

Query  501  GCCGCCCCTCAAGATTGTCACCATCCACGAGTGTGACTCAGGCGAGGCCAGCTCAGCCACCACGCCCCACCCGG  574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCCGCCCCTCAAGATTGTCACCATCCACGAGTGTGACTCAGGCGAGGCCAGCTCAGCCACCACGCCCCACCCGG  592

Query  575  CCACCTCTCCCAAGGCCACTCTGGCCATCTTCCAGCCCCCGGGGAAGGCCCTCACCGGCCGCTCTGTGGGCCCC  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCACCTCTCCCAAGGCCACTCTGGCCATCTTCCAGCCCCCGGGGAAGGCCCTCACCGGCCGCTCTGTGGGCCCC  666

Query  649  AGCTCCGCCCTGCCAGGTGACCCCTACAACTCAGCCGCGGGCGCCACTGACTTCGCAGAGATCAGCCCCTCGGC  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGCTCCGCCCTGCCAGGTGACCCCTACAACTCAGCCGCGGGCGCCACTGACTTCGCAGAGATCAGCCCCTCGGC  740

Query  723  ATCTAGCGACTCTGGGGAAGGCACCTTGTTGGATGCCGGTACCAGGAGCACCAAGGCTGGAGGGCCCGGGGCTG  796
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATCTAGCGACTCTGGGGAAGGCACCTCGTTGGATGCCGGTACCAGGAGCACCAAGGCTGGAGGGCCCGGGGCTG  814

Query  797  CAGCAGGGCCTGGGGAGGCGGGCCCGGGATCCGGGGCAGGTACCGTTCTGCAGTTCCTCACCCGCCTGCGCCGC  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGCAGGGCCTGGGGAGGCGGGCCCGGGATCCGGGGCAGGTACCGTTCTGCAGTTCCTCACCCGCCTGCGCCGC  888

Query  871  CATGCCAGCCTGGATGGGGCCAGCCCCTATTTCAAGGTCAAGAAGTGGAAGCTGGAGCCCAGCCAGCGGGCAGC  944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CATGCCAGCCTGGATGGGGCCAGCCCCTATTTCAAGGTCAAGAAGTGGAAGCTGGAGCCCAGCCAGCGGGCAGC  962

Query  945  CAGTCTGGACACGAGAGGTTCCCCCAAGCGGCACCACTTCCAGCGGCAGCGGGCAGCCAGTGAGAGCACGGAGC  1018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGTCTGGACACGAGAGGTTCCCCCAAGCGGCACCACTTCCAGCGGCAGCGGGCAGCCAGTGAGAGCACGGAGC  1036

Query 1019  AGGAGGAGGGGGATGCCCCCCAGGAGGACTTCATCCAGTACATTGCCCGGGCGGGCGACGCCGTGGCCTTCCCG  1092
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGAGGAGGGGGATGCCCCCCAGGAGGACTTCATCCAGTACATTGCCCGGGCGGGCGACGCCGTGGCCTTCCCG  1110

Query 1093  CGCCCCCGCCCCTTTCTGGCCAGCCCGCCCCCTGCTCTCGGCAGGTATTTTTCAGTAGATGGAGGTGCTAGGGG  1166
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CACCCCCGCCCCTTTCTGGCCAGCCCGCCCCCTGCTCTCGGCAGGTATTTTTCAGTAGATGGAGGTGCTAGGGG  1184

Query 1167  TGGACCTGTGGGCCCTTGCCCCCCTTCGCCCCCCCCTAGGCGGCCCAGGGAGCGCTCTCCAGGCCCCGTGGACA  1240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGGACCTGTGGGCCCTTGCCCCCCTTCGCCCCCCCCTAGGCGGCCCAGGGAGCGCTCTCCAGGCCCCGTGGACA  1258

Query 1241  CGCGCTCGCCTGCCTCCAGCGGCAAGGCCCCTCCCAGAGGCGGACTCACTGGGGCCACCTCTCCAGCATGGACC  1314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGCGCTCGCCTGCCTCCAGCGGCAAGGCCCCTCCCAGAGGCGGACTCACTGGGGCCACCTCTCCAGCATGGACC  1332

Query 1315  AGAGGAGGGAAGCAGGGAGAGACTGGG  1341
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGAGGAGGGAAGCAGGGAGAGACTGGG  1359