Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09915
• Subject: NM_001160011.3
• Aligned Length: 915
• Identities: 629
• Gaps: 285

Alignment

Query   1  ATGGCCTGCATCCTGAAGAGAAAGTCTGTGATTGCTGTGAGCTTCATAGCAGCGTTCCTTTTCCTGCTGGTTGT  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCCTGCATCCTGAAGAGAAAGTCTGTGATTGCTGTGAGCTTCATAGCAGCGTTCCTTTTCCTGCTGGTTGT  74

Query  75  GCGTCTTGTAAATGAAGTGAATTTCCCATTGCTACTAAACTGCTTTGGACAACCTGGTACAAAGTGGATACCAT  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  GCGTCTTGTAAATGAAGTGAATTTCCCATTGCTACTAAACTGCTTTGGACAACCTGGTACAAAGTGGATACCAT  148

Query 149  TCTCCTACACATACAGGCGGCCCCTTCGAACTCACTATGGATACATAAATGTGAAGACACAAGAGCCTTTGCAA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TCTCCTACACATACAGGCGGCCCCTTCGAACTCACTATGGATACATAAATGTGAAGACACAAGAGCCTTTGCAA  222

Query 223  CTGGACTGTGACCTTTGTGCCATAGTGTCAAACTCAGGTCAGATGGTTGGCCAGAAGGTGGGAAATGAGATAGA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  CTGGACTGTGACCTTTGTGCCATAGTGTCAAACTCAGGTCAGATGGTTGGCCAGAAGGTGGGAAATGAGATAGA  296

Query 297  TCGATCCTCCTGCATTTGGAGAATGAACAATGCCCCCACCAAAGGTTATGAAGAAGATGTCGGCCGCATGACCA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  TCGATCCTCCTGCATTTGGAGAATGAACAATGCCCCCACCAAAGGTTATGAAGAAGATGTCGGCCGCATGACCA  370

Query 371  TGATTCGAGTTGTGTCCCATACCAGCGTTCCTCTTTTGCTAAAAAACCCTGATTATTTTTTCAAGGAAGCGAAT  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TGATTCGAGTTGTGTCCCATACCAGCGTTCCTCTTTTGCTAAAAAACCCTGATTATTTTTTCAAGGAAGCGAAT  444

Query 445  ACTACTATTTATGTTATTTGGGGACCTTTCCGCAATATGAGGAAAGATGGCAATGGCATCGTTTACAACATGTT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  ACTACTATTTATGTTATTTGGGGACCTTTCCGCAATATGAGGAAAGATGGCAATGGCATCGTTTACAACATGTT  518

Query 519  GAAAAAGACAGTTGGTATCTATCCGAATGCCCAAATATACGTGACCACAGAGAAGCGCATGAGTTACTGTGATG  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  GAAAAAGACAGTTGGTATCTATCCGAATGCCCAAATATACGTGACCACAGAGAAGCGCATGAGTTACTGTGATG  592

Query 593  GAGTTTTTAAGAAGGAAACTGGGAAGGACAGAGTCCAGTCTGGCTCATATCTCAGCACAGGGTGGTTTACCTTC  666
           |||||||||||||||||||||||||||||  |||.|||               ||                   
Sbjct 593  GAGTTTTTAAGAAGGAAACTGGGAAGGAC--AGTACAG---------------AG-------------------  630

Query 667  ATTCTGGCCATGGACGCCTGTTATGGCATTCACGTCTACGGGATGATAAATGACACCTACTGCAAGACAGAAGG  740
                                                                                     
Sbjct 631  --------------------------------------------------------------------------  630

Query 741  GTATAGAAAAGTCCCCTACCATTATTATGAACAAGGAAGAGATGAGTGTGATGAATATTTTCTTCATGAACATG  814
                                                                                     
Sbjct 631  --------------------------------------------------------------------------  630

Query 815  CCCCATATGGGGGTCATAGGTTTATCACTGAAAAGAAAGTGTTTGCTAAATGGGCCAAGAAGCACAGGATAATA  888
                                                                                     
Sbjct 631  --------------------------------------------------------------------------  630

Query 889  TTTACACATCCAAACTGGACATTGTCT  915
                                      
Sbjct 631  ---------------------------  630