Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09915
• Subject: NM_011372.2
• Aligned Length: 916
• Identities: 766
• Gaps: 2

Alignment

Query   1  ATGGCCTGCATCCTGAAGAGAAAGTCTGTGATTGCTGTGAGCTTCATAGCAGCGTTCCTTTTCCTGCTGGTTGT  74
           ||||||||||||||.|||||.|||.|.|||.|||..||||||||||||||...||.|.|.||.|||||.|...|
Sbjct   1  ATGGCCTGCATCCTCAAGAGGAAGCCCGTGCTTGTGGTGAGCTTCATAGCCCTGTGCATCTTGCTGCTAGCCAT  74

Query  75  GCGTCTTGTAAATGAAGTGAATTTCCCATTGCTACTAAACTGCTTTGGACAACCTGGTACAAAGTGGATACCAT  148
           |||.|||||.|||||.|.||.||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||...||.||.|||||.||.|
Sbjct  75  GCGCCTTGTCAATGATGCGACTTTCCCTTTGCTCCTGAACTGCTTTGGACAGCCTAAGACCAAATGGATCCCTT  148

Query 149  TCTCCTACACATACAGGCGGCCCCTTCGAACTCACTATGGATACATAAATGTGAAGACACAAGAGCCTTTGCAA  222
           |..|||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct 149  TGCCCTACACATTCAGGCAGCCTCTTCGAACTCACTATGGATACATAAATGTGAGGACCCAAGAGCCTTTGCAA  222

Query 223  CTGGACTGTGACCTTTGTGCCATAGTGTCAAACTCAGGTCAGATGGTTGGCCAGAAGGTGGGAAATGAGATAGA  296
           |||.|||||.|||..||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||..|.||||||||
Sbjct 223  CTGAACTGTAACCACTGTGCCATCGTGTCAAATTCAGGTCAAATGGTCGGGCAGAAGGTGGGGGAAGAGATAGA  296

Query 297  TCGAT-CCTCCTGCATTTGGAGAATGAACAATGCCCCCACCAAAGGTTATGAAGAAGATGTCGGCCGCATGACC  369
            |.|| |.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|.|||.||||||||||||..||||||.
Sbjct 297  -CCATGCATCCTGCATCTGGAGAATGAACAACGCCCCAACCAAGGGCTTTGAGGAAGATGTCGGCTACATGACA  369

Query 370  ATGATTCGAGTTGTGTCCCATACCAGCGTTCCTCTTTTGCTAAAAAACCCTGATTATTTTTTCAAGGAAGCGAA  443
           |||.|.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|.
Sbjct 370  ATGGTCCGAGTTGTGTCACATACCAGTGTCCCTCTCTTGCTGAAAAATCCTGACTATTTTTTCAAAGAAGCAAG  443

Query 444  TACTACTATTTATGTTATTTGGGGACCTTTCCGCAATATGAGGAAAGATGGCAATGGCATCGTTTACAACATGT  517
           .|..||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 444  CAGGACCATTTATGTTATCTGGGGCCCTTTCCGCAACATGAGGAAGGATGGTAATGGCATCGTGTACAACATGT  517

Query 518  TGAAAAAGACAGTTGGTATCTATCCGAATGCCCAAATATACGTGACCACAGAGAAGCGCATGAGTTACTGTGAT  591
           |.||.||||||||||.|..||||||..||||.||.||.|||||||||||||||.|||..||||.|.||||.|||
Sbjct 518  TAAAGAAGACAGTTGATGCCTATCCAGATGCGCAGATCTACGTGACCACAGAGCAGCAGATGACTCACTGCGAT  591

Query 592  GGAGTTTTTAAGAAGGAAACTGGGAAGGACAGAGTCCAGTCTGGCTCATATCTCAGCACAGGGTGGTTTACCTT  665
           .||||.||||||.|.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 592  AGAGTGTTTAAGGATGAGACTGGAAAGGACAGAGTCCAGTCTGGCTCCTACCTCAGCACTGGCTGGTTTACCTT  665

Query 666  CATTCTGGCCATGGACGCCTGTTATGGCATTCACGTCTACGGGATGATAAATGACACCTACTGCAAGACAGAAG  739
           .||.|||||.|||||.|||||.||..|.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 666  TATCCTGGCTATGGATGCCTGCTACAGTATCCACGTCTACGGGATGATAAATGAAACCTACTGCAAGACAGAAG  739

Query 740  GGTATAGAAAAGTCCCCTACCATTATTATGAACAAGGAAGAGATGAGTGTGATGAATATTTTCTTCATGAACAT  813
           |||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|.||||||||||.|.||||||.||||.|||||||||
Sbjct 740  GGTATAGAAAAGTCCCCTATCACTACTATGAACAAGGGAAAGATGAGTGTAACGAATATCTTCTCCATGAACAT  813

Query 814  GCCCCATATGGGGGTCATAGGTTTATCACTGAAAAGAAAGTGTTTGCTAAATGGGCCAAGAAGCACAGGATAAT  887
           |||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||.|
Sbjct 814  GCCCCGTATGGGGGACACAGGTTCATCACCGAGAAGAAAGTGTTTGCCAAGTGGGCCAAGAAGCACAGAATAGT  887

Query 888  ATTTACACATCCAAACTGGACATTGTCT  915
           |||.|||||.||.||||||||..||||.
Sbjct 888  ATTCACACACCCGAACTGGACGCTGTCC  915