Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09947
• Subject: NM_001004723.3
• Aligned Length: 956
• Identities: 840
• Gaps: 43

Alignment

Query   1  ATGAAGATAGC--AAACAACACAGTAGTGACAGAATTTATCCTCCTTGGTCTGACTCAGTCTCAAGATATTCAG  72
           |||  ||.|||  .||||..|||||..|.|.||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATG--GAAAGCGAGAACAGAACAGTGATAAGAGAATTCATCCTCCTTGGTCTGACCCAGTCTCAAGATATTCAG  72

Query  73  CTCTTGGTCTTTGTGCTGATCTTAATTTTCTACCTTATCATCCTCCCTGGAAATTTTCTCATTATTTTCACCAT  146
           |||.|||||||||||||..|.|||||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  73  CTCCTGGTCTTTGTGCTAGTTTTAATATTCTACTTCATCATCCTCCCTGGAAATTTTCTCATTATTTTCACCAT  146

Query 147  AAGGTCAGACCCTGGGCTCACAGCCCCCCTCTATTTATTTCTGGGCAACTTGGCCTTCCTGGATGCATCCTACT  220
           ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 147  AAAGTCAGACCCTGGGCTCACAGCCCCCCTCTATTTCTTTCTGGGCAACTTGGCCTTCCTGGATGCATCCTACT  220

Query 221  CCTTCATTGTGGCTCCCAGGATGTTGGTGGACTTCCTCTCTGAGAAGAAGGTAATCTCCTACAGAGGCTGCATC  294
           |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 221  CCTTCATTGTGGCTCCCCGGATGTTGGTGGACTTCCTCTCTGCGAAGAAGATAATCTCCTACAGAGGCTGCATC  294

Query 295  ACTCAGCTCTTTTTCTTGCACTTCCTTGGAGGAGGGGAGGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTA  368
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295  ACTCAGCTCTTTTTCTTGCACTTCCTTGGAGGAGGGGAGGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTA  368

Query 369  CATCGCCATCTGCCGGCCCCTGCACTGTTCAACTGTCATGAACCCTAGAGCCTGCTATGCAATGATGTTGGCTC  442
           ||||||||||||||||||.|||||||.|.|.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369  CATCGCCATCTGCCGGCCTCTGCACTATCCTACTGTCATGAACCCTAGAACCTGCTATGCAATGATGTTGGCTC  442

Query 443  TGTGGCTTGGGGGTTTTGTCCACTCCATTATCCAGGTGGTCCTCATCCTCCGCTTGCCTTTTTGTGGCCCAAAC  516
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443  TGTGGCTTGGGGGTTTTGTCCACTCCATTATCCAGGTGGTCCTCATCCTCCGCTTGCCTTTTTGTGGCCCAAAC  516

Query 517  CAGCTGGACAACTTCTTCTGTGATGTCCGACAGGTCATCAAGCTGGCTTGCACCGACATGTTTGTGGTGGAGCT  590
           ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||..||||||||||||||
Sbjct 517  CAGCTGGACAACTTCTTCTGTGATGTCCCACAGGTCATCAAGCTGGCCTGCACCGACACATTTGTGGTGGAGCT  590

Query 591  TCTGATGGTCTTCAACAGTGGCCTGATGACACTCCTGTGCTTTCTGGGGCTTCTGGCTTCCTATGCAGTCATCC  664
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 591  TCTGATGGTCTTCAACAGTGGCCTGATGACACTCCTGTGCTTTCTGGGGCTTCTGGCCTCCTATGCAGTCATTC  664

Query 665  TCTGCCATGTTCGTAGGG-CAGCTTCTGAAGGGAAGAACAAGGCCATGTCCACATGCACCACTCGTGTCATTAT  737
           |.||.|...|.|| |||| |..|||||||.|..||.|||||||||||||||||.||||.|||.|.|.|||||.|
Sbjct 665  TTTGTCGCATACG-AGGGTCTTCTTCTGAGGCAAAAAACAAGGCCATGTCCACGTGCATCACCCATATCATTGT  737

Query 738  TATACTTCTT-ATGTTTGGACCTGCTATCTTCATCTACATGTGCCCTTTCAGGGCCTTACCAGCTGACAAGATG  810
           |||| ||||| |||||||||||||..|||||||||||||.|.||||.||||||||.||.||||||||||||.||
Sbjct 738  TATA-TTCTTCATGTTTGGACCTGGCATCTTCATCTACACGCGCCCCTTCAGGGCTTTCCCAGCTGACAAGGTG  810

Query 811  GTTTCTCTCTTTCACACAGTGATCTTTCCATTGATGAATCCTATGATTTATACCCTTCGCAACCAGGAAGTGAA  884
           |||||||||||.|||||||||||.|||||.|||.||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 811  GTTTCTCTCTTCCACACAGTGATTTTTCCTTTGTTGAATCCTGTCATTTATACCCTTCGCAACCAGGAAGTGAA  884

Query 885  AACTTCCATGAA----GAGGTTATTGAGTCGACATGTAGTCTGTCAAGTGGATTTTATAATAAGAAAC  948
           |.||||||||||    |.|.|||.|.||    ||..|||.|                           
Sbjct 885  AGCTTCCATGAAAAAGGTGTTTAATAAG----CACATAGCC---------------------------  921