Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09947
- Subject:
- NR_028067.1
- Aligned Length:
- 964
- Identities:
- 845
- Gaps:
- 43
Alignment
Query 1 ATGAAGATAGC--AAACAACACAGTAGTGACAGAATTTATCCTCCTTGGTCTGACTCAGTCTCAAGATATTCAG 72
||| ||.||| .||||..|||||..|.|.||||||.|||||||||.||.||||.||||.||.|||||||.||
Sbjct 1 ATG--GAAAGCGAGAACAGAACAGTGATAAGAGAATTCATCCTCCTTCGTTTGACCCAGTTTCGAGATATTTAG 72
Query 73 CTCTTGGTCTTTGTGCTGATCTTAATTTTCTACCTTATCATCCTCCCTGGAAATTTTCTCATTATTTTCACCAT 146
|||.|||||||||||||..|.|||||.||||||.|..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 73 CTCCTGGTCTTTGTGCTAGTTTTAATATTCTACTTCTTCATCCTCCCTGGAAATTTTCTCATTATTTTCACCAT 146
Query 147 AAGGTCAGACCCTGGGCTCACAGCCCCCCTCTATTTATTTCTGGGCAACTTGGCCTTCCTGGATGCATCCTACT 220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 147 AAGGTCAGACCCTGGGCTCACAGCCCCCCTCTATTTATTTCTGGGCAACTTGGCCTTCCTGGATGCATCCTACT 220
Query 221 CCTTCATTGTGGCTCCCAGGATGTTGGTGGACTTCCTCTCTGAGAAGAAGGTAATCTCCTACAGAGGCTGCATC 294
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221 CCTTCATTGTGGCTCCCAAGATGTTGGTGGACTTCCTCTCTGAGAAGAAGGTAATCTCCTACAGAGGCTGCATC 294
Query 295 ACTCAGCTCTTTTTCTTGCACTTCCTTGGAGGAGGGGAGGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTA 368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 ACTCAGCTCTTTTTCTTGCACTTCCTTGGAGGAGGGGAGGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTA 368
Query 369 CATCGCCATCTGCCGGCCCCTGCACTGTTCAACTGTCATGAACCCTAGAGCCTGCTATGCAATGATGTTGGCTC 442
||||.|||||||||.|||.|||||.|.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369 CATCACCATCTGCCTGCCTCTGCAGTATTCAACTGTCATGAACTCTAGAGCCTGCTATGCAATGATGTTGGCTC 442
Query 443 TGTGGCTTGGGGGTTTTGTCCACTCCATTATCCAGGTGGTCCTCATCCTCCGCTTGCCTTTTTGTGGCCCAAAC 516
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443 TGTGGCTTGGGGGTTTTGTCCACTCCATTATCCAGGTGGTCCTCATCATCCGCTTGCCTTTTTGTGGCCCAAAC 516
Query 517 CAGCTGGACAACTTCTTCTGTGATGTCCGACAGGTCATCAAGCTGGCTTGCACCGACATGTTTGTGGTGGAGCT 590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 CAGCTGGACAACTTCTTCTGTGATGTCCGACAGGTCATCAAGCTGGCTTGCACCGACATGTTTGTGGTGGAGCT 590
Query 591 TCTGATGGTCTTCAACAGTGGCCTGATGACACTCCTGTGCTTTCTGGGGCTTCTGGCTTCCTATGCAGTCATCC 664
|||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 591 TCTGATGGTCTTCAATAGTGGCCTGATGACACTCATGTGCTTTCTGGGACTTCTGGCCTCCTATGCAGTCATTC 664
Query 665 TCTGCCATGTTCG--TAGGGCAG------CTTCTGAAGGGAAGAACAAGGCCATGTCCACATGCACCACTCGTG 730
|.|| ||| ||.| || |||||||.|..||.||||||||||||||||||||||||||.|.|.
Sbjct 665 TTTG------TCGCATACG--AGCGTCTTCTTCTGAGGCAAAAAACAAGGCCATGTCCACATGCACCACCCATA 730
Query 731 TCATTATTATACTTCTT-ATGTTTGGACCTGCTATCTTCATCTACATGTGCCCTTTCAGGGCCTTACCAGCTGA 803
|||||.||||| ||||| |||||||||||||..|||||||||||||.||||||.||||||||.||.|||||.||
Sbjct 731 TCATTGTTATA-TTCTTCATGTTTGGACCTGGCATCTTCATCTACACGTGCCCCTTCAGGGCTTTCCCAGCCGA 803
Query 804 CAAGATGGTTTCTCTCTTTCACACAGTGATCTTTCCATTGATGAATCCTATGATTTATACCCTTCGCAACCAGG 877
||||.|||||||||||||.|||||||||||..||||.|||.||||||||.|.|||||||||||||..|||||||
Sbjct 804 CAAGGTGGTTTCTCTCTTCCACACAGTGATTCTTCCTTTGTTGAATCCTGTCATTTATACCCTTCATAACCAGG 877
Query 878 AAGTGAAAACTTCCATGAAGAGGTTATTGAGTCGACATGTAGTCTGTCAAGTGGATTTTATAATAAG-----AA 946
||||||||.||||||||||.|.|.|.||.|.|..|||..|||.||| ||.||| ||
Sbjct 878 AAGTGAAAGCTTCCATGAAAAAGGTGTTTAATAAACACATAGCCTG---------------AAAAAGGGCAAAA 936
Query 947 AC 948
|
Sbjct 937 A- 937