Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_09947
Subject:
NR_028067.1
Aligned Length:
964
Identities:
845
Gaps:
43

Alignment

Query   1  ATGAAGATAGC--AAACAACACAGTAGTGACAGAATTTATCCTCCTTGGTCTGACTCAGTCTCAAGATATTCAG  72
           |||  ||.|||  .||||..|||||..|.|.||||||.|||||||||.||.||||.||||.||.|||||||.||
Sbjct   1  ATG--GAAAGCGAGAACAGAACAGTGATAAGAGAATTCATCCTCCTTCGTTTGACCCAGTTTCGAGATATTTAG  72

Query  73  CTCTTGGTCTTTGTGCTGATCTTAATTTTCTACCTTATCATCCTCCCTGGAAATTTTCTCATTATTTTCACCAT  146
           |||.|||||||||||||..|.|||||.||||||.|..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  73  CTCCTGGTCTTTGTGCTAGTTTTAATATTCTACTTCTTCATCCTCCCTGGAAATTTTCTCATTATTTTCACCAT  146

Query 147  AAGGTCAGACCCTGGGCTCACAGCCCCCCTCTATTTATTTCTGGGCAACTTGGCCTTCCTGGATGCATCCTACT  220
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 147  AAGGTCAGACCCTGGGCTCACAGCCCCCCTCTATTTATTTCTGGGCAACTTGGCCTTCCTGGATGCATCCTACT  220

Query 221  CCTTCATTGTGGCTCCCAGGATGTTGGTGGACTTCCTCTCTGAGAAGAAGGTAATCTCCTACAGAGGCTGCATC  294
           ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221  CCTTCATTGTGGCTCCCAAGATGTTGGTGGACTTCCTCTCTGAGAAGAAGGTAATCTCCTACAGAGGCTGCATC  294

Query 295  ACTCAGCTCTTTTTCTTGCACTTCCTTGGAGGAGGGGAGGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTA  368
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295  ACTCAGCTCTTTTTCTTGCACTTCCTTGGAGGAGGGGAGGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTA  368

Query 369  CATCGCCATCTGCCGGCCCCTGCACTGTTCAACTGTCATGAACCCTAGAGCCTGCTATGCAATGATGTTGGCTC  442
           ||||.|||||||||.|||.|||||.|.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369  CATCACCATCTGCCTGCCTCTGCAGTATTCAACTGTCATGAACTCTAGAGCCTGCTATGCAATGATGTTGGCTC  442

Query 443  TGTGGCTTGGGGGTTTTGTCCACTCCATTATCCAGGTGGTCCTCATCCTCCGCTTGCCTTTTTGTGGCCCAAAC  516
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443  TGTGGCTTGGGGGTTTTGTCCACTCCATTATCCAGGTGGTCCTCATCATCCGCTTGCCTTTTTGTGGCCCAAAC  516

Query 517  CAGCTGGACAACTTCTTCTGTGATGTCCGACAGGTCATCAAGCTGGCTTGCACCGACATGTTTGTGGTGGAGCT  590
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517  CAGCTGGACAACTTCTTCTGTGATGTCCGACAGGTCATCAAGCTGGCTTGCACCGACATGTTTGTGGTGGAGCT  590

Query 591  TCTGATGGTCTTCAACAGTGGCCTGATGACACTCCTGTGCTTTCTGGGGCTTCTGGCTTCCTATGCAGTCATCC  664
           |||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 591  TCTGATGGTCTTCAATAGTGGCCTGATGACACTCATGTGCTTTCTGGGACTTCTGGCCTCCTATGCAGTCATTC  664

Query 665  TCTGCCATGTTCG--TAGGGCAG------CTTCTGAAGGGAAGAACAAGGCCATGTCCACATGCACCACTCGTG  730
           |.||      |||  ||.|  ||      |||||||.|..||.||||||||||||||||||||||||||.|.|.
Sbjct 665  TTTG------TCGCATACG--AGCGTCTTCTTCTGAGGCAAAAAACAAGGCCATGTCCACATGCACCACCCATA  730

Query 731  TCATTATTATACTTCTT-ATGTTTGGACCTGCTATCTTCATCTACATGTGCCCTTTCAGGGCCTTACCAGCTGA  803
           |||||.||||| ||||| |||||||||||||..|||||||||||||.||||||.||||||||.||.|||||.||
Sbjct 731  TCATTGTTATA-TTCTTCATGTTTGGACCTGGCATCTTCATCTACACGTGCCCCTTCAGGGCTTTCCCAGCCGA  803

Query 804  CAAGATGGTTTCTCTCTTTCACACAGTGATCTTTCCATTGATGAATCCTATGATTTATACCCTTCGCAACCAGG  877
           ||||.|||||||||||||.|||||||||||..||||.|||.||||||||.|.|||||||||||||..|||||||
Sbjct 804  CAAGGTGGTTTCTCTCTTCCACACAGTGATTCTTCCTTTGTTGAATCCTGTCATTTATACCCTTCATAACCAGG  877

Query 878  AAGTGAAAACTTCCATGAAGAGGTTATTGAGTCGACATGTAGTCTGTCAAGTGGATTTTATAATAAG-----AA  946
           ||||||||.||||||||||.|.|.|.||.|.|..|||..|||.|||               ||.|||     ||
Sbjct 878  AAGTGAAAGCTTCCATGAAAAAGGTGTTTAATAAACACATAGCCTG---------------AAAAAGGGCAAAA  936

Query 947  AC  948
           | 
Sbjct 937  A-  937