Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_09983
Subject:
NM_001178089.3
Aligned Length:
1566
Identities:
1565
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGCTGTCAGCCACCTGCCAACCATGGTCCAGGAATCGGTGACCTTCAAGGATGTGGCTATACTGTTCACCCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGTCAGCCACCTGCCAACCATGGTCCAGGAATCGGTGACCTTCAAGGATGTGGCTATACTGTTCACCCA  74

Query   75  GGAAGAGTGGGGGCAGCTGAGCCCCGCCCAGAGGGCCCTGTACAGGGACGTGATGCTGGAGAACTACAGCAACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAAGAGTGGGGGCAGCTGAGCCCCGCCCAGAGGGCCCTGTACAGGGACGTGATGCTGGAGAACTACAGCAACC  148

Query  149  TGGTCTCACTGGGACTCTTAGGACCCAAACCAGATACGTTTTCCCAGCTAGAAAAAAGGGAAGTGTGGATGCCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGTCTCACTGGGACTCTTAGGACCCAAACCAGATACGTTTTCCCAGCTAGAAAAAAGGGAAGTGTGGATGCCA  222

Query  223  GAGGACACCCCTGGAGGCTTCTGTCTTGACTGGATGACTATGCCTGCCAGTAAGAAATCTACTGTCAAGGCAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGGACACCCCTGGAGGCTTCTGTCTTGACTGGATGACTATGCCTGCCAGTAAGAAATCTACTGTCAAGGCAGA  296

Query  297  GATTCCTGAAGAAGAATTGGATCAATGGACAATAAAGGAAAGATTCAGTAGCAGTAGTCACTGGAAGTGTGCTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATTCCTGAAGAAGAATTGGATCAATGGACAATAAAGGAAAGATTCAGTAGCAGTAGTCACTGGAAGTGTGCTA  370

Query  371  GCCTGCTGGAGTGGCAATGTGGAGGCCAGGAGATCAGTTTGCAGCGAGTGGTACTCACTCACCCCAACACCCCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCTGCTGGAGTGGCAATGTGGAGGCCAGGAGATCAGTTTGCAGCGAGTGGTACTCACTCACCCCAACACCCCA  444

Query  445  TCACAGGAATGTGATGAATCCGGGAGCACTATGAGCTCATCTCTTCACAGTGCTCAAAGTCAGGGATTTCAACC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCACAGGAATGTGATGAATCCGGGAGCACTATGAGCTCATCTCTTCACAGTGATCAAAGTCAGGGATTTCAACC  518

Query  519  TAGCAAAAATGCCTTTGAGTGTAGTGAGTGTGGAAAAGTCTTCTCTAAGAGTTCAACTCTTAATAAACATCAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TAGCAAAAATGCCTTTGAGTGTAGTGAGTGTGGAAAAGTCTTCTCTAAGAGTTCAACTCTTAATAAACATCAGA  592

Query  593  AAATTCATAATGAAAAAAATGCAAATCAGAAAATTCATATTAAGGAGAAAAGATATGAATGTAGAGAATGTGGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAATTCATAATGAAAAAAATGCAAATCAGAAAATTCATATTAAGGAGAAAAGATATGAATGTAGAGAATGTGGG  666

Query  667  AAAGCCTTTCACCAGAGTACGCACCTTATCCATCACCAAAGAATTCACACTGGCGAGAAACCCTATGAATGTAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAGCCTTTCACCAGAGTACGCACCTTATCCATCACCAAAGAATTCACACTGGCGAGAAACCCTATGAATGTAA  740

Query  741  GGAATGTGGCAAGGCCTTCTCAGTGAGCTCCTCACTTACGTACCATCAGAAAATTCATACTGGAGAGAAGCCTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAATGTGGCAAGGCCTTCTCAGTGAGCTCCTCACTTACGTACCATCAGAAAATTCATACTGGAGAGAAGCCTT  814

Query  815  TTGAATGCAACTTATGTGGAAAAGCTTTTATCCGAAATATACACCTTGCCCATCATCATAGAATACATACTGGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGAATGCAACTTATGTGGAAAAGCTTTTATCCGAAATATACACCTTGCCCATCATCATAGAATACATACTGGA  888

Query  889  GAGAAACCTTTTAAATGTAACATTTGTGAAAAAGCCTTTGTGTGCAGGGCACACCTTACCAAACACCAGAATAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGAAACCTTTTAAATGTAACATTTGTGAAAAAGCCTTTGTGTGCAGGGCACACCTTACCAAACACCAGAATAT  962

Query  963  CCACAGTGGAGAGAAACCCTATAAATGCAATGAATGTGGAAAAGCCTTTAATCAGAGTACAAGTTTCCTTCAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCACAGTGGAGAGAAACCCTATAAATGCAATGAATGTGGAAAAGCCTTTAATCAGAGTACAAGTTTCCTTCAGC  1036

Query 1037  ATCAGAGAATTCACACTGGAGAGAAACCCTTTGAATGTAATGAATGTGGGAAGGCCTTCAGGGTGAACTCTTCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATCAGAGAATTCACACTGGAGAGAAACCCTTTGAATGTAATGAATGTGGGAAGGCCTTCAGGGTGAACTCTTCC  1110

Query 1111  CTTACTGAACATCAGAGAATTCATACTGGAGAGAAACCTTATAAATGTAATGAATGTGGGAAAGCTTTCAGGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTTACTGAACATCAGAGAATTCATACTGGAGAGAAACCTTATAAATGTAATGAATGTGGGAAAGCTTTCAGGGA  1184

Query 1185  TAATTCATCCTTTGCACGACATCGGAAAATTCACACTGGAGAGAAACCTTACAGATGTGGCTTGTGTGAGAAAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAATTCATCCTTTGCACGACATCGGAAAATTCACACTGGAGAGAAACCTTACAGATGTGGCTTGTGTGAGAAAG  1258

Query 1259  CCTTTCGGGACCAATCAGCACTAGCCCAACATCAGAGAATTCATACTGGGGAAAAACCTTATACATGTAACATA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCTTTCGGGACCAATCAGCACTAGCCCAACATCAGAGAATTCATACTGGGGAAAAACCTTATACATGTAACATA  1332

Query 1333  TGTGAAAAAGCCTTCAGTGACCATTCAGCCCTTACCCAACATAAGAGAATTCATACTAGGGAAAAACCTTACAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TGTGAAAAAGCCTTCAGTGACCATTCAGCCCTTACCCAACATAAGAGAATTCATACTAGGGAAAAACCTTACAA  1406

Query 1407  ATGTAAAATCTGTGAGAAAGCCTTTATCCGAAGCACTCACCTGACTCAACATCAGAGGATTCACACAGGAGAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ATGTAAAATCTGTGAGAAAGCCTTTATCCGAAGCACTCACCTGACTCAACATCAGAGGATTCACACAGGAGAGA  1480

Query 1481  AACCCTATAAATGTAATAAATGTGGGAAAGCTTTTAACCAGACTGCAAACCTCATTCAGCATCAGAGACATCAT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AACCCTATAAATGTAATAAATGTGGGAAAGCTTTTAACCAGACTGCAAACCTCATTCAGCATCAGAGACATCAT  1554

Query 1555  ATTGGAGAGAAG  1566
            ||||||||||||
Sbjct 1555  ATTGGAGAGAAG  1566