Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09988
- Subject:
- NM_001351000.1
- Aligned Length:
- 1275
- Identities:
- 1160
- Gaps:
- 114
Alignment
Query 1 ATGTTCCCACCAGCCAGGGGGAAGGAGCTGCTCTCGTTTGAGGATGTGGCGATGTACTTCACCAGAGAGGAGTG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTTCCCACCAGCCAGGGGGAAGGAGCTGCTCTCGTTTGAGGATGTGGCGATGTACTTCACCAGAGAGGAGTG 74
Query 75 GGGCCACCTCAACTGGGGTCAGAAGGACCTCTACCGAGATGTGATGTTGGAGAACTACAGGAACATGGTCTTGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGGCCACCTCAACTGGGGTCAGAAGGACCTCTACCGAGATGTGATGTTGGAGAACTACAGGAACATGGTCTTGC 148
Query 149 TGGGATTTCAGTTTCCCAAACCTGAGATGATCTGTCAGCTGGAGAACTGGGACGAGCAGTGGATCCTGGATCTA 222
||
Sbjct 149 TG------------------------------------------------------------------------ 150
Query 223 CCGAGAGCTGGGAATAGGAAGGCTTCCGGTAGTGCTTGCCCAGGTTCTGAAGCCAGACACAAGATGAAAAAGCT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 151 ------------------------------------------GGTTCTGAAGCCAGACACAAGATGAAAAAGCT 182
Query 297 AACTCCAAAACAGAAATTTTCTGAAGATTTAGAGTCATATAAGATATCAGTGGTAATGCAGGAATCAGCTGAGA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 183 AACTCCAAAACAGAAATTTTCTGAAGATTTAGAGTCATATAAGATATCAGTGGTAATGCAGGAATCAGCTGAGA 256
Query 371 AACTTTCAGAAAAGTTACATAAGTGTAAAGAATTTGTGGACAGTTGCAGGCTTACTTTCCCTACTAGTGGTGAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 257 AACTTTCAGAAAAGTTACATAAGTGTAAAGAATTTGTGGACAGTTGCAGGCTTACTTTCCCTACTAGTGGTGAT 330
Query 445 GAATACAGCAGGGGCTTCCTTCAAAACCTTAACCTTATTCAAGATCAGAATGCGCAAACAAGGTGGAAGCAGGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 331 GAATACAGCAGGGGCTTCCTTCAAAACCTTAACCTTATTCAAGATCAGAATGCGCAAACAAGGTGGAAGCAGGG 404
Query 519 CAGATATGATGAGGATGGCAAACCCTTCAATCAAAGATCTTTGCTTTTGGGGCATGAGCGAATTCTCACAAGAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 405 CAGATATGATGAGGATGGCAAACCCTTCAATCAAAGATCTTTGCTTTTGGGGCATGAGCGAATTCTCACAAGAG 478
Query 593 CAAAGTCTTATGAATGCAGTGAATGTGGAAAAGTCATTAGGCGTAAGGCATGGTTTGATCAACATCAAAGAATT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 CAAAGTCTTATGAATGCAGTGAATGTGGAAAAGTCATTAGGCGTAAGGCATGGTTTGATCAACATCAAAGAATT 552
Query 667 CACTTTTTAGAGAATCCTTTTGAGTGTAAGGTCTGTGGGCAAGCCTTCAGACAGCGGTCAGCTCTTACGGTCCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 553 CACTTTTTAGAGAATCCTTTTGAGTGTAAGGTCTGTGGGCAAGCCTTCAGACAGCGGTCAGCTCTTACGGTCCA 626
Query 741 TAAACAGTGTCACCTGCAAAACAAGCCATACAGATGTCATGACTGTGGAAAGTGTTTTCGGCAGCTCGCGTATA 814
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 627 TAAACAGTGTCACCTGCAAAACAAGCCATACAGATGTCATGACTGTGGAAAGTGTTTTCGGCAGCTCGCGTATC 700
Query 815 TTGTTGAACATAAGAGGATTCACACCAAAGAAAAACCTTATAAATGTAGCAAATGTGAAAAAACGTTTAGTCAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 701 TTGTTGAACATAAGAGGATTCACACCAAAGAAAAACCTTATAAATGTAGCAAATGTGAAAAAACGTTTAGTCAG 774
Query 889 AATTCAACCCTTATTCGACATCAGGTGATCCATAGTGGAGAAAAACGCCATAAATGCCTTGAGTGTGGAAAAGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 AATTCAACCCTTATTCGACATCAGGTGATCCATAGTGGAGAAAAACGCCATAAATGCCTTGAGTGTGGAAAAGC 848
Query 963 CTTTGGCCGGCATTCAACCCTTCTATGTCATCAACAGATTCACAGTAAACCGAACACCCATAAATGCAGTGAAT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 849 CTTTGGCCGGCATTCAACCCTTCTATGTCATCAACAGATTCACAGTAAACCGAACACCCATAAATGCAGTGAAT 922
Query 1037 GTGGACAGTCCTTTGGTAGGAATGTGGATCTCATTCAGCATCAAAGAATCCATACAAAGGAGGAATTCTTTCAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 923 GTGGACAGTCCTTTGGTAGGAATGTGGATCTCATTCAGCATCAAAGAATCCATACAAAGGAGGAATTCTTTCAA 996
Query 1111 TGTGGAGAATGTGGGAAAACGTTTAGTTTTAAGAGGAATCTTTTTCGACATCAGGTCATTCACACTGGAAGCCA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 997 TGTGGAGAATGTGGGAAAACGTTTAGTTTTAAGAGGAATCTTTTTCGACATCAGGTCATTCACACTGGAAGCCA 1070
Query 1185 ACCCTACCAATGTGTCATATGTGGAAAATCTTTCAAGTGGCACACAAGCTTTATTAAGCACCAGGGCACTCACA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071 ACCCTACCAATGTGTCATATGTGGAAAATCTTTCAAGTGGCACACAAGCTTTATTAAGCACCAGGGCACTCACA 1144
Query 1259 AAGGACAGATATCCACA 1275
|||||||||||||||||
Sbjct 1145 AAGGACAGATATCCACA 1161