Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09988
• Subject: XM_011516073.2
• Aligned Length: 1275
• Identities: 989
• Gaps: 285

Alignment

Query    1  ATGTTCCCACCAGCCAGGGGGAAGGAGCTGCTCTCGTTTGAGGATGTGGCGATGTACTTCACCAGAGAGGAGTG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGGCCACCTCAACTGGGGTCAGAAGGACCTCTACCGAGATGTGATGTTGGAGAACTACAGGAACATGGTCTTGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGGGATTTCAGTTTCCCAAACCTGAGATGATCTGTCAGCTGGAGAACTGGGACGAGCAGTGGATCCTGGATCTA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CCGAGAGCTGGGAATAGGAAGGCTTCCGGTAGTGCTTGCCCAGGTTCTGAAGCCAGACACAAGATGAAAAAGCT  296
                                                                           |||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------------ATGAAAAAGCT  11

Query  297  AACTCCAAAACAGAAATTTTCTGAAGATTTAGAGTCATATAAGATATCAGTGGTAATGCAGGAATCAGCTGAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   12  AACTCCAAAACAGAAATTTTCTGAAGATTTAGAGTCATATAAGATATCAGTGGTAATGCAGGAATCAGCTGAGA  85

Query  371  AACTTTCAGAAAAGTTACATAAGTGTAAAGAATTTGTGGACAGTTGCAGGCTTACTTTCCCTACTAGTGGTGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   86  AACTTTCAGAAAAGTTACATAAGTGTAAAGAATTTGTGGACAGTTGCAGGCTTACTTTCCCTACTAGTGGTGAT  159

Query  445  GAATACAGCAGGGGCTTCCTTCAAAACCTTAACCTTATTCAAGATCAGAATGCGCAAACAAGGTGGAAGCAGGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  160  GAATACAGCAGGGGCTTCCTTCAAAACCTTAACCTTATTCAAGATCAGAATGCGCAAACAAGGTGGAAGCAGGG  233

Query  519  CAGATATGATGAGGATGGCAAACCCTTCAATCAAAGATCTTTGCTTTTGGGGCATGAGCGAATTCTCACAAGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  234  CAGATATGATGAGGATGGCAAACCCTTCAATCAAAGATCTTTGCTTTTGGGGCATGAGCGAATTCTCACAAGAG  307

Query  593  CAAAGTCTTATGAATGCAGTGAATGTGGAAAAGTCATTAGGCGTAAGGCATGGTTTGATCAACATCAAAGAATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  308  CAAAGTCTTATGAATGCAGTGAATGTGGAAAAGTCATTAGGCGTAAGGCATGGTTTGATCAACATCAAAGAATT  381

Query  667  CACTTTTTAGAGAATCCTTTTGAGTGTAAGGTCTGTGGGCAAGCCTTCAGACAGCGGTCAGCTCTTACGGTCCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  382  CACTTTTTAGAGAATCCTTTTGAGTGTAAGGTCTGTGGGCAAGCCTTCAGACAGCGGTCAGCTCTTACGGTCCA  455

Query  741  TAAACAGTGTCACCTGCAAAACAAGCCATACAGATGTCATGACTGTGGAAAGTGTTTTCGGCAGCTCGCGTATA  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  456  TAAACAGTGTCACCTGCAAAACAAGCCATACAGATGTCATGACTGTGGAAAGTGTTTTCGGCAGCTCGCGTATC  529

Query  815  TTGTTGAACATAAGAGGATTCACACCAAAGAAAAACCTTATAAATGTAGCAAATGTGAAAAAACGTTTAGTCAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  530  TTGTTGAACATAAGAGGATTCACACCAAAGAAAAACCTTATAAATGTAGCAAATGTGAAAAAACGTTTAGTCAG  603

Query  889  AATTCAACCCTTATTCGACATCAGGTGATCCATAGTGGAGAAAAACGCCATAAATGCCTTGAGTGTGGAAAAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  604  AATTCAACCCTTATTCGACATCAGGTGATCCATAGTGGAGAAAAACGCCATAAATGCCTTGAGTGTGGAAAAGC  677

Query  963  CTTTGGCCGGCATTCAACCCTTCTATGTCATCAACAGATTCACAGTAAACCGAACACCCATAAATGCAGTGAAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  678  CTTTGGCCGGCATTCAACCCTTCTATGTCATCAACAGATTCACAGTAAACCGAACACCCATAAATGCAGTGAAT  751

Query 1037  GTGGACAGTCCTTTGGTAGGAATGTGGATCTCATTCAGCATCAAAGAATCCATACAAAGGAGGAATTCTTTCAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  752  GTGGACAGTCCTTTGGTAGGAATGTGGATCTCATTCAGCATCAAAGAATCCATACAAAGGAGGAATTCTTTCAA  825

Query 1111  TGTGGAGAATGTGGGAAAACGTTTAGTTTTAAGAGGAATCTTTTTCGACATCAGGTCATTCACACTGGAAGCCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  826  TGTGGAGAATGTGGGAAAACGTTTAGTTTTAAGAGGAATCTTTTTCGACATCAGGTCATTCACACTGGAAGCCA  899

Query 1185  ACCCTACCAATGTGTCATATGTGGAAAATCTTTCAAGTGGCACACAAGCTTTATTAAGCACCAGGGCACTCACA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  900  ACCCTACCAATGTGTCATATGTGGAAAATCTTTCAAGTGGCACACAAGCTTTATTAAGCACCAGGGCACTCACA  973

Query 1259  AAGGACAGATATCCACA  1275
            |||||||||||||||||
Sbjct  974  AAGGACAGATATCCACA  990