Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09988
- Subject:
- XM_017012022.1
- Aligned Length:
- 1294
- Identities:
- 1184
- Gaps:
- 89
Alignment
Query 1 ATGTTCC--CACCAGCCAGGGGGAAGGAGCTGCTCT---CGTTTGAGG---AT--------GTGGCGA-TGTAC 57
|||.|.| .|||| |||..|| |||.|..|| || ||.||.| |||||
Sbjct 1 ATGCTGCAATACCA---------------CTGTGCTGAACGTCTCTGGCACATTCATCTTGGTTGCAATTGTAC 59
Query 58 TTCACCAGAGAGGAGTGGGGCCACCTCAACTGGGGTCAGAAGGACCTCTACCGAGATGTG--ATGTTGGAGAAC 129
||.| |||.| .|..|||| ||| ||| ||| ||
Sbjct 60 TTTA--------------GGCTA-------------------TATTTCTA---AGA-GTGAAATG-------AC 89
Query 130 TACAGGAACATGGTCTTGCTGGGATTTCAGTTTCCCAAACCTGAGATGATCTGTCAGCTGGAGAACTGGGACGA 203
.||||..|.| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 90 CACAGCCAAA-----------GGATTTCAGTTTCCCAAACCTGAGATGATCTGTCAGCTGGAGAACTGGGACGA 152
Query 204 GCAGTGGATCCTGGATCTACCGAGAGCTGGGAATAGGAAGGCTTCCGGTAGTGCTTGCCCAGGTTCTGAAGCCA 277
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 153 GCAGTGGATCCTGGATCTACCGAGAACTGGGAATAGGAAGGCTTCCGGTAGTGCTTGCCCAGGTTCTGAAGCCA 226
Query 278 GACACAAGATGAAAAAGCTAACTCCAAAACAGAAATTTTCTGAAGATTTAGAGTCATATAAGATATCAGTGGTA 351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 227 GACACAAGATGAAAAAGCTAACTCCAAAACAGAAATTTTCTGAAGATTTAGAGTCATATAAGATATCAGTGGTA 300
Query 352 ATGCAGGAATCAGCTGAGAAACTTTCAGAAAAGTTACATAAGTGTAAAGAATTTGTGGACAGTTGCAGGCTTAC 425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATGCAGGAATCAGCTGAGAAACTTTCAGAAAAGTTACATAAGTGTAAAGAATTTGTGGACAGTTGCAGGCTTAC 374
Query 426 TTTCCCTACTAGTGGTGATGAATACAGCAGGGGCTTCCTTCAAAACCTTAACCTTATTCAAGATCAGAATGCGC 499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 375 TTTCCCTACTAGTGGTGATGAATACAGCAGGGGCTTCCTTCAAAACCTTAACCTTATTCAAGATCAGAATGCGC 448
Query 500 AAACAAGGTGGAAGCAGGGCAGATATGATGAGGATGGCAAACCCTTCAATCAAAGATCTTTGCTTTTGGGGCAT 573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 449 AAACAAGGTGGAAGCAGGGCAGATATGATGAGGATGGCAAACCCTTCAATCAAAGATCTTTGCTTTTGGGGCAT 522
Query 574 GAGCGAATTCTCACAAGAGCAAAGTCTTATGAATGCAGTGAATGTGGAAAAGTCATTAGGCGTAAGGCATGGTT 647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 523 GAGCGAATTCTCACAAGAGCAAAGTCTTATGAATGCAGTGAATGTGGAAAAGTCATTAGGCGTAAGGCATGGTT 596
Query 648 TGATCAACATCAAAGAATTCACTTTTTAGAGAATCCTTTTGAGTGTAAGGTCTGTGGGCAAGCCTTCAGACAGC 721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 597 TGATCAACATCAAAGAATTCACTTTTTAGAGAATCCTTTTGAGTGTAAGGTCTGTGGGCAAGCCTTCAGACAGC 670
Query 722 GGTCAGCTCTTACGGTCCATAAACAGTGTCACCTGCAAAACAAGCCATACAGATGTCATGACTGTGGAAAGTGT 795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 671 GGTCAGCTCTTACGGTCCATAAACAGTGTCACCTGCAAAACAAGCCATACAGATGTCATGACTGTGGAAAGTGT 744
Query 796 TTTCGGCAGCTCGCGTATATTGTTGAACATAAGAGGATTCACACCAAAGAAAAACCTTATAAATGTAGCAAATG 869
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 745 TTTCGGCAGCTCGCGTATCTTGTTGAACATAAGAGGATTCACACCAAAGAAAAACCTTATAAATGTAGCAAATG 818
Query 870 TGAAAAAACGTTTAGTCAGAATTCAACCCTTATTCGACATCAGGTGATCCATAGTGGAGAAAAACGCCATAAAT 943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 819 TGAAAAAACGTTTAGTCAGAATTCAACCCTTATTCGACATCAGGTGATCCATAGTGGAGAAAAACGCCATAAAT 892
Query 944 GCCTTGAGTGTGGAAAAGCCTTTGGCCGGCATTCAACCCTTCTATGTCATCAACAGATTCACAGTAAACCGAAC 1017
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 893 GCCTTGAGTGTGGAAAAGCCTTTGGCCGGCATTCAACCCTTCTATGTCATCAACAGATTCACAGTAAACCGAAC 966
Query 1018 ACCCATAAATGCAGTGAATGTGGACAGTCCTTTGGTAGGAATGTGGATCTCATTCAGCATCAAAGAATCCATAC 1091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 967 ACCCATAAATGCAGTGAATGTGGACAGTCCTTTGGTAGGAATGTGGATCTCATTCAGCATCAAAGAATCCATAC 1040
Query 1092 AAAGGAGGAATTCTTTCAATGTGGAGAATGTGGGAAAACGTTTAGTTTTAAGAGGAATCTTTTTCGACATCAGG 1165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041 AAAGGAGGAATTCTTTCAATGTGGAGAATGTGGGAAAACGTTTAGTTTTAAGAGGAATCTTTTTCGACATCAGG 1114
Query 1166 TCATTCACACTGGAAGCCAACCCTACCAATGTGTCATATGTGGAAAATCTTTCAAGTGGCACACAAGCTTTATT 1239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115 TCATTCACACTGGAAGCCAACCCTACCAATGTGTCATATGTGGAAAATCTTTCAAGTGGCACACAAGCTTTATT 1188
Query 1240 AAGCACCAGGGCACTCACAAAGGACAGATATCCACA 1275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189 AAGCACCAGGGCACTCACAAAGGACAGATATCCACA 1224