Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09990
• Subject: XM_011512739.2
• Aligned Length: 1506
• Identities: 1100
• Gaps: 405

Alignment

Query    1  ATGGCATGGCCCAAACTGCCCGCACCTTGGCTGCTGCTCTGCACCTGGCTCCCAGCAGGGTGCCTGTCCTTGCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGTGACGGTCCAGCACACAGAACGCTATGTCACCCTGTTTGCCTCTATCATCCTCAAATGTGACTACACCACCT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CTGCCCAGCTCCAGGACGTGGTGGTGACATGGCGCTTCAAGTCCTTCTGCAAGGACCCTATCTTTGACTACTAC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TCAGCGTCATACCAGGCAGCTTTATCCCTGGGCCAGGACCCATCCAATGACTGCAACGACAACCAGCGGGAAGT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TCGCATAGTGGCCCAGCGGCGGGGGCAGAATGAGCCCGTGCTGGGGGTAGATTACCGGCAGCGCAAGATCACCA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TCCAGAACCGAGCAGATCTCGTGATAAATGAAGTGATGTGGTGGGACCATGGAGTGTATTACTGCACCATTGAG  444
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------ATGTGGTGGGACCATGGAGTGTATTACTGCACCATTGAG  39

Query  445  GCTCCAGGGGACACATCAGGAGACCCCGATAAGGAAGTAAAGCTCATCGTCCTACACTGGCTGACAGTGATCTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   40  GCTCCAGGGGACACATCAGGAGACCCCGATAAGGAAGTAAAGCTCATCGTCCTACACTGGCTGACAGTGATCTT  113

Query  519  CATCATCCTGGGAGCCCTCCTCCTCCTGCTGCTGATTGGAGTGTGCTGGTGCCAGTGCTGTCCTCAGTATTGCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  114  CATCATCCTGGGAGCCCTCCTCCTCCTGCTGCTGATTGGAGTGTGCTGGTGCCAGTGCTGTCCTCAGTATTGCT  187

Query  593  GCTGCTATATCCGCTGTCCCTGCTGTCCTGCCCACTGCTGCTGTCCTGAGGAAGATTTGTCCCTGCCGTCCAGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  188  GCTGCTATATCCGCTGTCCCTGCTGTCCTGCCCACTGCTGCTGTCCTGAGGAAGATTTGTCCCTGCCGTCCAGC  261

Query  667  CTCCCGCAGATGCCAATGACCCAGACCACCAATCAGCCTCCCATCGCCAATGGTGTCCTGGAGTATTTGGAGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  262  CTCCCGCAGATGCCAATGACCCAGACCACCAATCAGCCTCCCATCGCCAATGGTGTCCTGGAGTATTTGGAGAA  335

Query  741  AGAACTGCGGAACCTCAACCTGGCCCAGCCTCTGCCCCCTGACCTCAAAGGCAGATTTGGCCATCCCTGCAGCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  336  AGAACTGCGGAACCTCAACCTGGCCCAGCCTCTGCCCCCTGACCTCAAAGGCAGATTTGGCCATCCCTGCAGCA  409

Query  815  TGCTGTCCTCCCTGGGCTCTGAGGTCGTGGAACGCAGAATCATCCACCTGCCCCCACTGATCAGAGACCTGTCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  410  TGCTGTCCTCCCTGGGCTCTGAGGTCGTGGAACGCAGAATCATCCACCTGCCCCCACTGATCAGAGACCTGTCA  483

Query  889  TCCTCAAGGAGGACCAGTGACTCCCTGCACCAGCAGTGGCTCACCCCAATTCCCTCCAGGCCCTGGGATCTGAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  484  TCCTCAAGGAGGACCAGTGACTCCCTGCACCAGCAGTGGCTCACCCCAATTCCCTCCAGGCCCTGGGATCTGAG  557

Query  963  GGAGGGGAGAAGCCACCACCATTACCCTGATTTCCACCAGGAGCTCCAGGACCGGGGGCCAAAGTCTTGGGCAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  558  GGAGGGGAGAAGCCACCACCATTACCCTGATTTCCACCAGGAGCTCCAGGACCGGGGGCCAAAGTCTTGGGCAT  631

Query 1037  TGGAAAGAAGGGAGTTGGACCCATCGTGGAGTGGAAGGCACCGTAGCTCTAGGCTGAATGGGTCACCCATACAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  632  TGGAAAGAAGGGAGTTGGACCCATCGTGGAGTGGAAGGCACCGTAGCTCTAGGCTGAATGGGTCACCCATACAC  705

Query 1111  TGGTCAGACAGGGACAGCCTAAGCGATGTCCCCTCATCCAGTGAGGCACGCTGGCGGCCGAGCCACCCTCCTTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  706  TGGTCAGACAGGGACAGCCTAAGCGATGTCCCCTCATCCAGTGAGGCACGCTGGCGGCCGAGCCACCCTCCTTT  779

Query 1185  CAGGAGCCGCTGTCAGGAGAGGCCCCGCAGGCCCAGCCCCCGGGAGAGCACTCAGAGGCACGGGAGACGACGCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  780  CAGGAGCCGCTGTCAGGAGAGGCCCCGCAGGCCCAGCCCCCGGGAGAGCACTCAGAGGCACGGGAGACGACGCA  853

Query 1259  GGCACCGCAGCTACTCTCCTCCCTTGCCCTCCGGCCTCAGTTCCTGGAGCTCTGAAGAGGACAAGGAGAGGCAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  854  GGCACCGCAGCTACTCTCCTCCCTTGCCCTCCGGCCTCAGTTCCTGGAGCTCTGAAGAGGACAAGGAGAGGCAG  927

Query 1333  CCCCAGAGCTGGCGGGCCCACCGCCGCGGCTCGCACTCCCCACACTGGCCCGAGGAGAAGCCGCCTAGCTACCG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  928  CCCCAGAGCTGGCGGGCCCACCGCCGCGGCTCGCACTCCCCACACTGGCCCGAGGAGAAGCCGCCTAGCTACCG  1001

Query 1407  CTCACTGGATATCACTCCAGGCAAGAATAGCAGGAAAAAAGGGAGTGTGGAGAGGCGCTCGGAGAAAGACAGCT  1480
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002  CTCACTTGATATCACTCCAGGCAAGAATAGCAGGAAAAAAGGGAGTGTGGAGAGGCGCTCGGAGAAAGACAGCT  1075

Query 1481  CTCATAGTGGAAGGAGTGTGGTCATT  1506
            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1076  CTCATAGTGGAAGGAGTGTGGTCATT  1101