Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10033
• Subject: XM_017020556.1
• Aligned Length: 2377
• Identities: 1934
• Gaps: 419

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGTTTCGGCCTGGGGCGGCGGGGGCGGCCCAGAAAAGGCCTAGCGTCCTGGGCTGTGTGGGTGTAGCGTC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CAGGGCGCGTCGGTCTCTATGGCAACGCTCCACACGCGGAGGTCGGGTACGGTTATCTGTGGCCACAAAGAAAG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------ATGGAT  6
                                                                                ||||||
Sbjct  149  TTATTTGTCTCTGTCTTGGCAAGGCTGGGAGGAAAGTTTTAGCTAAGAAACTCAGCCCATTGGAGACCATGGAT  222

Query    7  AAGTACGATGCGATTAAGGCCATCGGGCAAGGTGCCTTCGGGAAAGCATACTTAGCTAAAGGGAAATCAGATAG  80
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGTACGATGTGATTAAGGCCATCGGGCAAGGTGCCTTCGGGAAAGCATACTTAGCTAAAGGGAAATCAGATAG  296

Query   81  CAAGCACTGTGTCATAAAAGAGATCAATTTTGAAAAGATGCCCATACAAGAAAAAGAAGCTTCAAAGAAAGAAG  154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAAGCACTGTGTCATAAAAGAGATCAATTTTGAAAAGATGCCCATACAAGAAAAAGAAGCTTCAAAGAAAGAAG  370

Query  155  TGATTCTTCTGGAAAAGATGAAACATCCCAACATTGTAGCCTTCTTCAATTCATTTCAAGAGAATGGCAGGCTG  228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGATTCTTCTGGAAAAGATGAAACATCCCAACATTGTAGCCTTCTTCAATTCATTTCAAGAGAATGGCAGGCTG  444

Query  229  TTTATTGTAATGGAATATTGTGATGGAGGGGATCTCATGAAAAGGATCAATAGACAACGGGGTGTGTTATTTAG  302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTATTGTAATGGAATATTGTGATGGAGGGGATCTCATGAAAAGGATCAATAGACAACGGGGTGTGTTATTTAG  518

Query  303  TGAAGATCAGATCCTCGGTTGGTTTGTACAGATTTCTCTAGGACTAAAACATATTCATGACAGGAAGATATTAC  376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAAGATCAGATCCTCGGTTGGTTTGTACAGATTTCTCTAGGACTAAAACATATTCATGACAGGAAGATATTAC  592

Query  377  ACAGGGACATAAAAGCTCAGAACATTTTTCTTAGCAAGAACGGAATGGTGGCAAAGCTTGGGGACTTTGGTATA  450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAGGGACATAAAAGCTCAGAACATTTTTCTTAGCAAGAACGGAATGGTGGCAAAGCTTGGGGACTTTGGTATA  666

Query  451  GCAAGAGTCCTGAATAATTCCATGGAACTTGCTCGAACTTGTATTGGAACACCTTACTACCTGTCCCCAGAGAT  524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCAAGAGTCCTGAATAATTCCATGGAACTTGCTCGAACTTGTATTGGAACACCTTACTACCTGTCCCCAGAGAT  740

Query  525  CTGTCAGAATAAACCCTACAACAATAAAACGGATATTTGGTCTCTTGGCTGTGTCTTATATGAGCTCTGCACAC  598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGTCAGAATAAACCCTACAACAATAAAACGGATATTTGGTCTCTTGGCTGTGTCTTATATGAGCTCTGCACAC  814

Query  599  TTAAACATCCTTTTGAGGGTAACAACTTACAGCAGCTGGTTCTGAAGATTTGTCAAGCACATTTTGCCCCAATA  672
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTAAACATCCTTTTGAGGGTAACAACTTACAGCAGCTGGTTCTGAAGATTTGTCAAGCACATTTTGCCCCAATA  888

Query  673  TCTCCGGGGTTTTCTCGTGAGCTCCATTCCTTGATATCTCAGCTCTTTCAAGTATCTCCTCGAGACCGACCATC  746
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCTCCGGGGTTTTCTCGTGAGCTCCATTCCTTGATATCTCAGCTCTTTCAAGTATCTCCTCGAGACCGACCATC  962

Query  747  CATAAATTCCATTTTGAAAAGGCCCTTTTTAGAGAATCTTATTCCCAAATATTTGACTCCTGAGGTCATTCAGG  820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATAAATTCCATTTTGAAAAGGCCCTTTTTAGAGAATCTTATTCCCAAATATTTGACTCCTGAGGTCATTCAGG  1036

Query  821  AAGAATTCAGTCACATGCTTATATGCAGAGCAGGAGCGCCAGCTTCTCGACATGCTGGGAAGGTGGTCCAGAAG  894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAGAATTCAGTCACATGCTTATATGCAGAGCAGGAGCGCCAGCTTCTCGACATGCTGGGAAGGTGGTCCAGAAG  1110

Query  895  TGTAAAATACAAAAAGTGAGATTCCAGGGAAAGTGCCCACCAAGATCAAGGATATCTGTGCCAATTAAAAGGAA  968
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGTAAAATACAAAAAGTGAGATTCCAGGGAAAGTGCCCACCAAGATCAAGGATATCTGTGCCAATTAAAAGGAA  1184

Query  969  TGCTATATTGCATAGAAATGAATGGAGACCACCAGCTGGAGCCCAGAAGGCCAGATCTATAAAAATGATAGAAA  1042
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCTATATTGCATAGAAATGAATGGAGACCACCAGCTGGAGCCCAGAAGGCCAGATCTATAAAAATGATAGAAA  1258

Query 1043  GACCCAAAATTGCTGCTGTCTGTGGACATTATGATTATTATTATGCTCAACTTGATATGCTGAGGAGGAGAGCC  1116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GACCCAAAATTGCTGCTGTCTGTGGACATTATGATTATTATTATGCTCAACTTGATATGCTGAGGAGGAGAGCC  1332

Query 1117  CACAAACCAAGTTATCACCCTATTCCTCAAGAAAATACTGGAGTTGAGGATTACGGTCAGGAAACGAGGCATGG  1190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CACAAACCAAGTTATCACCCTATTCCTCAAGAAAATACTGGAGTTGAGGATTACGGTCAGGAAACGAGGCATGG  1406

Query 1191  TCCATCCCCAAGTCAATGGCCTGCTGAGTACCTTCAGAGAAAATTTGAAGCTCAACAATATAAGTTGAAAGTGG  1264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCCATCCCCAAGTCAATGGCCTGCTGAGTACCTTCAGAGAAAATTTGAAGCTCAACAATATAAGTTGAAAGTGG  1480

Query 1265  AGAAGCAATTGGGTCTTCGTCCATCTTCTGCCGAGCCAAATTACAACCAGAGACAAGAGCTAAGAAGTAATGGA  1338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGAAGCAATTGGGTCTTCGTCCATCTTCTGCCGAGCCAAATTACAACCAGAGACAAGAGCTAAGAAGTAATGGA  1554

Query 1339  GAAGAGCCTAGATTCCAGGAGCTGCCATTTAGGAAAAACGAAATGAAGGAACAGGAATATTGGAAGCAGTTAGA  1412
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAAGAGCCTAGATTCCAGGAGCTGCCATTTAGGAAAAACGAAATGAAGGAACAGGAATATTGGAAGCAGTTAGA  1628

Query 1413  GGAAATACGCCAACAGTACCACAATGACATGAAAGAAATTAGAAAGAAGATGGGGAGAGAACCAGAGGAGAACT  1486
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGAAATACGCCAACAGTACCACAATGACATGAAAGAAATTAGAAAGAAGATGGGGAGAGAACCAGAGGAGAACT  1702

Query 1487  CAAAAATAAGTCATAAAACCTATTTGGTGAAGAAGAGTAACCTGCCTGTCCATCAAGATGCATCTGAGGGAGAA  1560
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CAAAAATAAGTCATAAAACCTATTTGGTGAAGAAGAGTAACCTGCCTGTCCATCAAGATGCATCTGAGGGAGAA  1776

Query 1561  GCACCTGTGCAGATGGAATTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGCTCACCGCAAC  1634
            |||||||||                                                                 
Sbjct 1777  GCACCTGTG-----------------------------------------------------------------  1785

Query 1635  CTCCGCCTCCCAGGACATTGAAAAAGACTTGAAACAAATGAGGCTTCAGAACACAAAGGAAAGTAAAAATCCAG  1708
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1786  ----------CAGGACATTGAAAAAGACTTGAAACAAATGAGGCTTCAGAACACAAAGGAAAGTAAAAATCCAG  1849

Query 1709  AACAGAAATATAAAGCTAAGAAGGGGGTAAAATTTGAAATTAATTTAGACAAATGTATTTCTGATGAAAACATC  1782
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850  AACAGAAATATAAAGCTAAGAAGGGGGTAAAATTTGAAATTAATTTAGACAAATGTATTTCTGATGAAAACATC  1923

Query 1783  CTCCAAGAGGAAGAGGCAATGGATATACCAAATGAAACTTTGACCTTTGAGGATGGCATGAAGTTTAAGGAATA  1856
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924  CTCCAAGAGGAAGAGGCAATGGATATACCAAATGAAACTTTGACCTTTGAGGATGGCATGAAGTTTAAGGAATA  1997

Query 1857  TGAATGTGTAAAGGAGCATGGAGATTATACAGACAAAGCATTTGAAAAACTTCACTGCCCAGAAGCA-----GG  1925
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||
Sbjct 1998  TGAATGTGTAAAGGAGCATGGAGATTATACAGACAAAGCATTTGAAAAACTTCACTGCCCAGAAGCAGCTTTGG  2071

Query 1926  GTTTTCCACG------CAGACTGTAGCTG-CTGTGGGAAACAGGAGGCAGTGGGATGGAGGAGCGCCTCAGACT  1992
            .||.|||..|      |||||| ||.|.| ||.|                                ||||...|
Sbjct 2072  CTTCTCCCAGGAGCTCCAGACT-TACCAGTCTTT--------------------------------CTCATTGT  2112

Query 1993  CTGCTGCAGATGATGGCAGTGGCCGACATCACCTCCACCTGCCCCACGGGGCCTGAC-AGTG-----AGTCTGT  2060
            ||.|||        ||.||             |||||  ||             ||| ||||     |||.|.|
Sbjct 2113  CTTCTG--------GGAAG-------------CTCCA--TG-------------GACAAGTGTTGCCAGTATCT  2150

Query 2061  G---CTTAGC-GTCAGTCGTCAGGAAGGGAAGACCAAGGACCCGTACAGCCCAGTGCTCATCC---TGA-----  2122
            |   ||.||| ||              |.||...||||  |.|.|      |.||||||.|||   |||     
Sbjct 2151  GAAACTCAGCTGT--------------GTAAAGTCAAG--CTCTT------CTGTGCTCTTCCCAGTGACCCTT  2202

Query 2123  -----TG--  2124
                 ||  
Sbjct 2203  TATTTTGGT  2211