Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_10086
Subject:
NM_001367410.1
Aligned Length:
1341
Identities:
1215
Gaps:
109

Alignment

Query    1  MMNRTTPDQELAPASEPVWERPWSVEEIRRSSQSWSLAADAGLLQFLQEFSQQTISRTHEIKKQVDGLIRETKA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TDCRLHNVFNDFLMLSNTQFIENRVYDEEVEEPVLKAEAEKTEQEKTREQKEVDLIPKVQEAVNYGLQVLDSAF  148
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------MLSNTQFIENRVYDEEVEEPVLKAEAEKTEQEKTREQKEVDLIPKVQEAVNYGLQVLDSAF  61

Query  149  EQLDIKAGNSDSEEDDANGRVELILEPKDLYIDRPLPYLIGSKLFMEQEDVGLGELSSEEGSVGSDRGSIVDTE  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct   62  EQLDIKAGNSDSEEDDANGRVELILEPKDLYIDRPLPYLIGSKLFMEQEDVGLGELSS-EGSVGSDRGSIVDTE  134

Query  223  EEKEEEESDEDFAHHSDNEQNRHTTQMSDEEEDDDGCDLFADSEKEEEDIEDIEENTRPKRSRPTSFADELAAR  296
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  135  EEKEEEESDEDFAHHSDNEQNQHTTQMSDEEEDDDGCDLFADSEKEEEDIEDIEENTRPKRSRPTSFADELAAR  208

Query  297  IKGDAVGRVDEEPTTLPSGEAKPRKTLKEKKERRTPSDDEEDNLFAPPKLTDEDFSPFGSGGGLFSGGKGLFDD  370
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  209  IKGDAMGRVDEEPTTLPSGEAKPRKTLKEKKERRTPSDDEEDNLFAPPKLTDEDFSPFGSGGGLFSGGKGLFDD  282

Query  371  EDEESDLFTEAPQDRQAGASVKEESSSSKPGKKIPAGAVSVFLGDTDVFGAASVPSMKEPQKPEQPTPRKSPYG  444
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  283  EDEESDLFTEASQDRQAGASVKEESSSSKPGKKIPAGAVSVFLGDTDVFGAASVPSLKEPQKPEQPTPRKSPYG  356

Query  445  PPPTGLFDDDDGDDDDDFFSAPHSKPSKTGKVQSTADIFGDEEGDLFKEKAVASPEATVSQTDENKARAEKKVT  518
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  357  PPPTGLFDDDDGDDDDDFFSAPHSKPSKTRKVQSTADIFGDEEGDLFKEKAVASPEATVSQTDENKARAEKKVT  430

Query  519  LSSSKNLKPSSETKTQKGLFSDEEDSEDLFSSQSASKLKGASLLPGKLPTLVSLFDDEDEEDNLFGGTAAKKQT  592
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  431  LSYSKNLKPSSETKTQKGLFSDEEDSEDLFSSQSASNLKGASLLPGKLPTSVSLFDDEDEEDNLFGGTAAKKQT  504

Query  593  LCLQAQREEKAKASELSKKKASALLFSSDEEDQWNIPASQTHLASDSRSKGEPRDSGTLQSQEAKAVKKTSLFE  666
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  505  LSLQAQREEKAKASELSKKKASALLFSSDEEDQWNIPASQTHLASDSRSKGEPRDSGTLQSQEAKAVKKTSLFE  578

Query  667  EDEEDDLFAIAKDSQKKTQRVSLLFEDDVDSGGSLFGSPPTSVPPATKKKETVSEAPPLLFSDEEEKEAQLGVK  740
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  579  EDKEDDLFAIAKDSQKKTQRVSLLFEDDVDSGGSLFGSPPTSVPPATKKKETVSEAPPLLFSDEEEKEAQLGVK  652

Query  741  SVDKKVESAKESLKFGRTDVAESEKEGLLTRSAQETVKHSDLFSSSSPWDKGTKPRTKTVLSLFDEEEDKMEDQ  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  653  SVDKKVESAKESLKFGRTDVAESEKEGLLTRSAQETVKHSDLFSSSSPWDKGTKPRTKTVLSLFDEEEDKMEDQ  726

Query  815  NIIQAPQKEVGKGRDPDAHPKSTGVFQDEELLFSHKLQKDNDPDVDLFAGTKKTKLLEPSVGSLFGDDEDDDLF  888
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  727  NIIQAPQKEVGKGCDPDAHPKSTGVFQDEELLFSHKLQKDNDPDVDLFAGTKKTKLLEPSVGSLFGDDEDDDLF  800

Query  889  SSAKSQPLVQEKKRVVKKDHSVDSFKNQKHPESIQGSKEKGIWKPETPQDSSGLAPFKTKEPSTRIGKIQANLA  962
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||                     |||||
Sbjct  801  SSAKSQPLVQEKKRVVKKDHSVNSFKNQKHPESIQGSKEKGIWKPETP---------------------QANLA  853

Query  963  INPAALLPTAASQISEVKPVLPELAFPSSEHRRSYGLESVPVLPGSGEAGVSFDLPAQADTLHSANKSRVKMRG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  854  INPAALLPTAASQISEVKPVLPELAFPSSEHRRSHGLESVPVLPGSGEAGVSFDLPAQADTLHSANKSRVKMRG  927

Query 1037  KRRPQTRAARRLAAQESSETEDMSVPRGPIAQWADGAISPNGHRPQLRAASGEDSTEEALAAAAAPWEGGPVPG  1110
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  928  KRRPQTRAARRLAAQESSEAEDMSVPRGPIAQWADGAISPNGHRPQLRAASGEDSTEEALAAAAAPWEGGPVPG  1001

Query 1111  VDRSPFAKSLGHSRGEADLFDSGDIFSTGTGSQSVERTKPKAKIAENPANPPVGGKAKSPMFPALGEASSDDDL  1184
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002  VDTSPFAKSLGHSRGEADLFDSGDIFSTGTGSQSVERTKPKAKIAENPANPPVGGKAKSPMFPALGEASSDDDL  1075

Query 1185  FQSAKPKPAKKTNPFPLLEDEDDLFTDQKVKKNETKSNSQQDVILTTQDIFEDDIFATEAIKPSQKTREKEKTL  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1076  FQSAKPKPAKKTNPFPLLEDEDDLFTDQKVKKNETKSSSQQDVILTTQDIFEDDIFATEAIKPSQKTREKEKTL  1149

Query 1259  ESNLFDDNIDIFADLTVKPKEKSKKKVEAKSIFDDDMDDIFSSGIQAKTTKPKSRSAQAAPEPRFEHKVSNIFD  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1150  ESNLFDDNIDIFADLTVKPKEKSKKKVEAKSIFDDDMDDIFSTGIQAKTTKPKSRSAQAAPEPRFEHKVSNIFD  1223

Query 1333  DPLNAFGGQ  1341
            |||||||||
Sbjct 1224  DPLNAFGGQ  1232