Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10129
• Subject: NM_172925.2
• Aligned Length: 1903
• Identities: 1656
• Gaps: 2

Alignment

Query    1  ATGGCACCCAAAAAGAAGATTGTCAAAAAGAACAAAGGAGATATCAATGAGATGACTATAATCGTAGAAGATAG  74
            |||||||||||||||||||.|.||||.||||||||.|.|||.|||||.||||||||.||.||.||||||||.||
Sbjct    1  ATGGCACCCAAAAAGAAGACTATCAAGAAGAACAAGGCAGAGATCAACGAGATGACCATCATTGTAGAAGACAG  74

Query   75  CCCCCTAAACAAACTGAATGCTTTGAATGGGCTCCTAGAGGGAGGCAATGGCCTTAGCTGCATTTCTTCTGAAC  148
            ||||||||.|||.|||||||||.|.||||||||.||.||||||.||||..||||||||||..|||||||.||||
Sbjct   75  CCCCCTAAGCAAGCTGAATGCTCTAAATGGGCTTCTGGAGGGAAGCAACAGCCTTAGCTGTGTTTCTTCCGAAC  148

Query  149  TAACAGATGCTTCTTATGGCCCCAACCTCTTGGAAGGTTTAAGTAAAATGCGGCAGGAGAACTTCTTATGTGAC  222
            |||||||..||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||.|.||.||||.|||..||||||||
Sbjct  149  TAACAGACACTTCTTATGGCCCCAACCTCCTCGAAGGTTTAAGTAAAATGAGACAAGAGAGCTTTCTATGTGAC  222

Query  223  TTAGTCATTGGTACCAAAACCAAATCCTTTGATGTTCATAAGTCAGTCATGGCTTCATGCAGTGAGTATTTTTA  296
            ||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  223  TTGGTCATCGGTACCAAAACCAAGTCCTTTGATGTCCATAAGTCAGTGATGGCTTCATGCAGCGAGTACTTTTA  296

Query  297  CAACATCCTAAAAAAAGACCCGTCAATTCAGAGGGTGGATCTCAATGATATCTCACCACTAGGCCTGGCCACTG  370
            .||||||||.|||||.||.|||||.|...|.|||||.||.||||||||||||.|.||..||||.||.|||||.|
Sbjct  297  TAACATCCTTAAAAACGATCCGTCCACGAAAAGGGTAGACCTCAATGATATCGCCCCTTTAGGGCTAGCCACAG  370

Query  371  TCATTGCATATGCCTACACTGGAAAGCTCACTCTCTCCTTGTATACAATAGGAAGCATTATTTCTGCTGCTGTT  444
            |.||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  371  TGATCGCGTATGCTTACACGGGAAAGCTGACCCTTTCTTTATACACAATAGGAAGCATCATTTCTGCTGCTGTG  444

Query  445  TATCTTCAGATCCATACTCTTATAAAGATGTGCAGTGATTTTCTGATACGGGAGATGAGTGTTGAGAATTGCAT  518
            ||.||.||||||||.||.|||.|||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  445  TACCTCCAGATCCACACCCTTGTAAAGATGTGCAGCGATTTTCTGATCCGAGAGATCAGTGTGGAGAACTGCAT  518

Query  519  GTATGTTGTTAATATTGCTGAAACATACTCCCTAAAAAATGCAAAAGCAGCAGCCCAGAAATTTATTCGGGATA  592
            |||.||.|||||.||||||||.||.|||..|.|.|||||.|||||.|||.|||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  519  GTACGTGGTTAACATTGCTGAGACCTACAGCTTGAAAAACGCAAAGGCAACAGCCCAGAAATTCATCCGGGATA  592

Query  593  ACTTCCTTGAATTTGCAGAATCGGATCAGTTTATGAAACTTACATTTGAACAAATTAATGAACTTCTTATAGAT  666
            |||||.|.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||..|||||
Sbjct  593  ACTTCATCGAATTTGCAGAATCCGAACAATTTATGAAGCTTACGTTTGAACAGATTAACGAGCTTCTCGTAGAT  666

Query  667  GATGACTTACAGTTGCCTTCTGAGATAGTAGCATTCCAGATTGCAATGAAATGGTTAGAATTTGACCAAAAGAG  740
            ||.||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  GACGACTTACAATTGCCTTCTGAGCTTGTAGCATTCCAGATCGCAATGAAATGGTTAGAATTCGACCAAAAGAG  740

Query  741  AGTAAAATACGCTGCAGATCTTTTGAGCAATATTCGCTTTGGTACCATCTCTGCACAAGACCTGGTCAATTATG  814
            |||.||..|.||.|||||||||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTGAAGCATGCGGCAGATCTTCTAAGCAACATTCGCTTTGGTACCATCTCTGCACAAGACCTGGTCAATTATG  814

Query  815  TTCAATCCGTACCAAGAATGATGCAAGATGCTGATTGTCACAGACTTCTCGTAGATGCTATGAACTACCACTTG  888
            |||||.|||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|.|||.||.||.|||||.||||||||.|||||.
Sbjct  815  TTCAAACCGTACCGAGGATGATGCAAGACGCTGATTGTCATAAACTGCTTGTGGATGCCATGAACTATCACTTA  888

Query  889  CTTCCATATCATCAAAACACATTGCAATCTAGGCGAACAAGAATCCGAGGTGGCTGCCGAGTCCTCGTCACTGT  962
            ||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||..||||.|||||||||||.||..|||||||
Sbjct  889  CTCCCTTATCATCAAAACACACTGCAATCTAGGCGCACAAGAATTAGAGGCGGCTGCCGAGTTCTGATCACTGT  962

Query  963  TGGGGGACGCCCAGGCCTTACTGAGAAGTCCCTTAGCAGAGACATCCTGTATAGAGACCCTGAAAATGGATGGA  1036
            ||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGGGGACGCCCCGGCCTGACTGAGAAGTCCCTTAGTAGAGACATTTTATATAGAGACCCTGAAAATGGATGGA  1036

Query 1037  GCAAGCTTACGGAAATGCCAGCCAAAAGTTTTAATCAGTGTGTGGCTGTGATGGATGGATTTCTTTATGTAGCC  1110
            ||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1037  GCAAGCTTACAGAAATGCCAGCCAAGAGTTTTAATCAGTGTGTGGCTGTGATGGATGGATTCCTTTATGTAGCA  1110

Query 1111  GGTGGTGAAGACCAGAATGATGCAAGAAATCAAGCCAAGCATGCAGTCAGCAATTTCTGCAGATACGATCCCCG  1184
            ||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1111  GGTGGTGAGGACCAGAATGACGCCAGAAACCAAGCCAAGCACGCAGTCAGCAATTTCTGCAGGTACGATCCCCG  1184

Query 1185  CTTCAACACCTGGATACACCTGGCCAGCATGAACCAGAAGCGCACGCACTTCAGCCTGAGCGTGTTCAACGGGC  1258
            |||||||||||||||.|||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTTCAACACCTGGATTCACTTGGGCAGCATGAACCAGAAGCGCACGCACTTCAGCCTGAGCGTGTTCAACGGGC  1258

Query 1259  TCGTGTACGCCGCGGGCGGCCGCAACGCAGAAGGAAGCCTGGCCTCGCTGGAGTGCTACGTGCCCTCCACCAAT  1332
            |..|||||||.|.|||||||||.|||.|.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1259  TGCTGTACGCGGTGGGCGGCCGTAACTCCGAGGGCAGCCTGGCTTCGCTGGAGTGCTACGTGCCCTCCACCAAC  1332

Query 1333  CAGTGGCAGCCGAAGACGCCCCTGGAGGTGGCGCGCTGCTGCCACGCTAGCGCGGTCGCCGACGGCCGCGTGCT  1406
            ||.||||||||.||..||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||.|
Sbjct 1333  CAATGGCAGCCCAAAGCGCCGCTCGAGGTGGCGCGCTGCTGCCACGCCAGCGCCGTGGCCGACGGCCGCGTGAT  1406

Query 1407  GGTGACCGGAGGCTACATCGCCAACGCCTACTCGCGCTCTGTGTGCGCCTACGACCCGGCCAGCGACTCGTGGC  1480
            .||||||||.||||||||||.||..||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||...||||.||||||
Sbjct 1407  CGTGACCGGCGGCTACATCGGCAGTGCGTACTCGCGCTCCGTGTGCGCCTACGACCCCGCGCTCGACGCGTGGC  1480

Query 1481  AGGAGCTGCCGAACCTCAGCACACCCCGGGGCTGGCACTGCGCGGTCACGCTGAGCGACAGAGTGTACGTGATG  1554
            ||||||||||..|.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||..|||||.|||||||..|||||||||||
Sbjct 1481  AGGAGCTGCCCCAGCTGAGCACGCCCCGAGGCTGGCACTGCGCGGTGGCGCTGGGCGACAGGCTGTACGTGATG  1554

Query 1555  GGCGGCAGCCAGCTGGGGCCGCGCGGGGAGCGCGTGGACGTGCTCACCGTGGAGTGCTACAGCCCCGCGACCG-  1627
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||.|||.||||| |.|| 
Sbjct 1555  GGGGGCAGCCAGCTGGGGCCGCGCGGGGAGCGCGTGGACGTGCTCACGGTGGAGAGCTTCAGTCCCGC-AGCGC  1627

Query 1628  GCCAGTGGAGCTACGCGGCGCCGCTGCAGGTGGGAGTGAGCACTGCGGGCGTCTCGGCGCTGCATGGCCGCGCC  1701
            ||||||||||||.||.|||||||||||..|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1628  GCCAGTGGAGCTTCGTGGCGCCGCTGCCCGTGGGCGTGAGCACGGCGGGTGTCTCGGCGCTGCACGGGCGAGCC  1701

Query 1702  TACCTGGTGGGGGGCTGGAACGAGGGCGAGAAGAAGTACAAGAAGTGCATCCAGTGCTTCAGCCCCGAGCTCAA  1775
            ||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1702  TACCTGCTGGGCGGCTGGAACGAGGGCGAGAAGAAGTACAAGAAATGCATCCAGTGCTTCAACCCCGAGCTCAA  1775

Query 1776  CGAGTGGACGGAGGACGACGAGCTACCCGAGGCCACTGTCGGCGTGTCCTGCTGCACCCTCTCGATGCCCAACA  1849
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||..|.||||||||||
Sbjct 1776  CGAGTGGACGGAGGACGACGAGCTGCCCGAGGCCACCGTGGGCGTGTCCTGCTGCACGCTGGCCATGCCCAACA  1849

Query 1850  ACGTGACTCGGGAATCCCGGGCCAGTTCGGTATCTTCTGTGCCAGTCAGTATC  1902
            .||||.|.||.||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 1850  GCGTGTCCCGAGAGTCACGGGCCAGCTCGGTGTCCTCCGTGCCGGTCAGTATC  1902