Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10208
• Subject: NM_001007225.3
• Aligned Length: 1797
• Identities: 1665
• Gaps: 132

Alignment

Query    1  ---ATGAACAAGCTTTACATCGGGAACCTGAGCCCCGCCGTCACCGCCGACGACCTCCGGCAGCTCTTTGGGGA  71
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGAACAAGCTTTACATCGGGAACCTGAGCCCCGCCGTCACCGCCGACGACCTCCGGCAGCTCTTTGGGGA  74

Query   72  CAGGAAGCTGCCCCTGGCGGGACAGGTCCTGCTGAAGTCCGGCTACGCCTTCGTGGACTACCCCGACCAGAACT  145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGGAAGCTGCCCCTGGCGGGACAGGTCCTGCTGAAGTCCGGCTACGCCTTCGTGGACTACCCCGACCAGAACT  148

Query  146  GGGCCATCCGCGCCATCGAGACCCTCTCGGGTAAAGTGGAATTGCATGGGAAAATCATGGAAGTTGATTACTCA  219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGCCATCCGCGCCATCGAGACCCTCTCGGGTAAAGTGGAATTGCATGGGAAAATCATGGAAGTTGATTACTCA  222

Query  220  GTCTCTAAAAAGCTAAGGAGCAGGAAAATTCAGATTCGAAACATCCCTCCTCACCTGCAGTGGGAGGTGTTGGA  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCTCTAAAAAGCTAAGGAGCAGGAAAATTCAGATTCGAAACATCCCTCCTCACCTGCAGTGGGAGGTGTTGGA  296

Query  294  TGGACTTTTGGCTCAATATGGGACAGTGGAGAATGTGGAACAAGTCAACACAGACACAGAAACCGCCGTTGTCA  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGACTTTTGGCTCAATATGGGACAGTGGAGAATGTGGAACAAGTCAACACAGACACAGAAACCGCCGTTGTCA  370

Query  368  ACGTCACATATGCAACAAGAGAAGAAGCAAAAATAGCCATGGAGAAGCTAAGCGGGCATCAGTTTGAGAACTAC  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACGTCACATATGCAACAAGAGAAGAAGCAAAAATAGCCATGGAGAAGCTAAGCGGGCATCAGTTTGAGAACTAC  444

Query  442  TCCTTCAAGATTTCCTACATCCCGGATGAAGAGGTGAGCTCCCCTTCGCCCCCTCAGCGAGCCCAGCGTGGGGA  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCCTTCAAGATTTCCTACATCCCGGATGAAGAGGTGAGCTCCCCTTCGCCCCCTCAGCGAGCCCAGCGTGGGGA  518

Query  516  CCACTCTTCCCGGGAGCAAGGCCACGCCCCTGGGGGCACTTCTCAGGCCAGACAGATTGATTTCCCGCTGCGGA  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCACTCTTCCCGGGAGCAAGGCCACGCCCCTGGGGGCACTTCTCAGGCCAGACAGATTGATTTCCCGCTGCGGA  592

Query  590  TCCTGGTCCCCACCCAGTTTGTTGGTGCCATCATCGGAAAGGAGGGCTTGACCATAAAGAACATCACTAAGCAG  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCTGGTCCCCACCCAGTTTGTTGGTGCCATCATCGGAAAGGAGGGCTTGACCATAAAGAACATCACTAAGCAG  666

Query  664  ACCCAGTCCCGGGTAGATATCCATAGAAAAGAGAACTCTGGAGCTGCAGAGAAGCCTGTCACCATCCATGCCAC  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACCCAGTCCCGGGTAGATATCCATAGAAAAGAGAACTCTGGAGCTGCAGAGAAGCCTGTCACCATCCATGCCAC  740

Query  738  CCCAGAGGGGACTTCTGAAGCATGCCGCATGATTCTTGAAATCATGCAGAAAGAGGCAGATGAGACCAAACTAG  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCCAGAGGGGACTTCTGAAGCATGCCGCATGATTCTTGAAATCATGCAGAAAGAGGCAGATGAGACCAAACTAG  814

Query  812  CCGAAGAGATTCCTCTGAAAATCTTGGCACACAATGGCTTGGTTGGAAGACTGATTGGAAAAGAAGGCAGAAAT  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCGAAGAGATTCCTCTGAAAATCTTGGCACACAATGGCTTGGTTGGAAGACTGATTGGAAAAGAAGGCAGAAAT  888

Query  886  TTGAAGAAAATTGAACATGAAACAGGGACCAAGATAACAATCTCATCTTTGCAGGATTTGAGCATATACAACCC  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTGAAGAAAATTGAACATGAAACAGGGACCAAGATAACAATCTCATCTTTGCAGGATTTGAGCATATACAACCC  962

Query  960  GGAAAGAACCATCACTGTGAAGGGCACAGTTGAGGCCTGTGCCAGTGCTGAGATAGAGATTATGAAGAAGCTGC  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAAAGAACCATCACTGTGAAGGGCACAGTTGAGGCCTGTGCCAGTGCTGAGATAGAGATTATGAAGAAGCTGC  1036

Query 1034  GTGAGGCCTTTGAAAATGATATGCTGGCTGTTAACCAACAAGCCAATCTGATCCCAGGGTTGAACCTCAGCGCA  1107
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||                                       
Sbjct 1037  GTGAGGCCTTTGAAAATGATATGCTGGCTGTTAAC---------------------------------------  1071

Query 1108  CTTGGCATCTTTTCAACAGGACTGTCCGTGCTATCTCCACCAGCAGGGCCCCGCGGAGCTCCCCCCGCTGCCCC  1181
                                                                                      
Sbjct 1072  --------------------------------------------------------------------------  1071

Query 1182  CTACCACCCCTTCACTACCCACTCCGGATACTTCTCCAGCCTGTACCCCCATCACCAGTTTGGCCCGTTCCCGC  1255
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072  ----------------ACCCACTCCGGATACTTCTCCAGCCTGTACCCCCATCACCAGTTTGGCCCGTTCCCGC  1129

Query 1256  ATCATCACTCTTATCCAGAGCAGGAGATTGTGAATCTCTTCATCCCAACCCAGGCTGTGGGCGCCATCATCGGG  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130  ATCATCACTCTTATCCAGAGCAGGAGATTGTGAATCTCTTCATCCCAACCCAGGCTGTGGGCGCCATCATCGGG  1203

Query 1330  AAGAAGGGGGCACACATCAAACAGCTGGCGAGATTCGCCGGAGCCTCTATCAAGATTGCCCCTGCGGAAGGCCC  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1204  AAGAAGGGGGCACACATCAAACAGCTGGCGAGATTCGCCGGAGCCTCTATCAAGATTGCCCCTGCGGAAGGCCC  1277

Query 1404  AGACGTCAGCGAAAGGATGGTCATCATCACCGGGCCACCGGAAGCCCAGTTCAAGGCCCAGGGACGGATCTTTG  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1278  AGACGTCAGCGAAAGGATGGTCATCATCACCGGGCCACCGGAAGCCCAGTTCAAGGCCCAGGGACGGATCTTTG  1351

Query 1478  GGAAACTGAAAGAGGAAAACTTCTTTAACCCCAAAGAAGAAGTGAAGCTGGAAGCGCATATCAGAGTGCCCTCT  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1352  GGAAACTGAAAGAGGAAAACTTCTTTAACCCCAAAGAAGAAGTGAAGCTGGAAGCGCATATCAGAGTGCCCTCT  1425

Query 1552  TCCACAGCTGGCCGGGTGATTGGCAAAGGTGGCAAGACCGTGAACGAACTGCAGAACTTAACCAGTGCAGAAGT  1625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1426  TCCACAGCTGGCCGGGTGATTGGCAAAGGTGGCAAGACCGTGAACGAACTGCAGAACTTAACCAGTGCAGAAGT  1499

Query 1626  CATCGTGCCTCGTGACCAAACGCCAGATGAAAATGAGGAAGTGATCGTCAGAATTATCGGGCACTTCTTTGCTA  1699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500  CATCGTGCCTCGTGACCAAACGCCAGATGAAAATGAGGAAGTGATCGTCAGAATTATCGGGCACTTCTTTGCTA  1573

Query 1700  GCCAGACTGCACAGCGCAAGATCAGGGAAATTGTACAACAGGTGAAGCAGCAGGAGCAGAAATACCCTCAGGGA  1773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1574  GCCAGACTGCACAGCGCAAGATCAGGGAAATTGTACAACAGGTGAAGCAGCAGGAGCAGAAATACCCTCAGGGA  1647

Query 1774  GTCGCCTCACAGCGCAGCAAG  1794
            |||||||||||||||||||||
Sbjct 1648  GTCGCCTCACAGCGCAGCAAG  1668