Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_10208
- Subject:
- NM_001291873.2
- Aligned Length:
- 1802
- Identities:
- 1588
- Gaps:
- 202
Alignment
Query 1 ATGAACAAGCTTTACATCGGGAACCTGAGCCCCGCCGTCACCGCCGACGACCTCCGGCAGCTCTTTGGGGACAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GAAGCTGCCCCTGGCGGGACAGGTCCTGCTGAAGTCCGGCTACGCCTTCGTGGACTACCCCGACCAGAACTGGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CCATCCGCGCCATCGAGACCCTCTCGGGTAAAGTGGAATTGCATGGGAAAATCATGG--------AAGTTGATT 214
|.|| |..|||| ||.||| |.||||||
Sbjct 1 ------------------------------ATGT----TCTCATG------TCCTGGACACTACCACGTTGAT- 33
Query 215 ACTCAGTCTCTAAAAAGCTAAGGAGCAGGAAAATTCAGATTCGAAACATCCCTCCTCACCTGCAGTGGGAGGTG 288
|.||.|..|||.|.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 34 -----GGCTTTCTAAATCCAGGGAGCAGGAAAATTCAGATTCGAAACATCCCTCCTCACCTGCAGTGGGAGGTG 102
Query 289 TTGGATGGACTTTTGGCTCAATATGGGACAGTGGAGAATGTGGAACAAGTCAACACAGACACAGAAACCGCCGT 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 103 TTGGATGGACTTTTGGCTCAATATGGGACAGTGGAGAATGTGGAACAAGTCAACACAGACACAGAAACCGCCGT 176
Query 363 TGTCAACGTCACATATGCAACAAGAGAAGAAGCAAAAATAGCCATGGAGAAGCTAAGCGGGCATCAGTTTGAGA 436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 177 TGTCAACGTCACATATGCAACAAGAGAAGAAGCAAAAATAGCCATGGAGAAGCTAAGCGGGCATCAGTTTGAGA 250
Query 437 ACTACTCCTTCAAGATTTCCTACATCCCGGATGAAGAGGTGAGCTCCCCTTCGCCCCCTCAGCGAGCCCAGCGT 510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 251 ACTACTCCTTCAAGATTTCCTACATCCCGGATGAAGAGGTGAGCTCCCCTTCGCCCCCTCAGCGAGCCCAGCGT 324
Query 511 GGGGACCACTCTTCCCGGGAGCAAGGCCACGCCCCTGGGGGCACTTCTCAGGCCAGACAGATTGATTTCCCGCT 584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 325 GGGGACCACTCTTCCCGGGAGCAAGGCCACGCCCCTGGGGGCACTTCTCAGGCCAGACAGATTGATTTCCCGCT 398
Query 585 GCGGATCCTGGTCCCCACCCAGTTTGTTGGTGCCATCATCGGAAAGGAGGGCTTGACCATAAAGAACATCACTA 658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 399 GCGGATCCTGGTCCCCACCCAGTTTGTTGGTGCCATCATCGGAAAGGAGGGCTTGACCATAAAGAACATCACTA 472
Query 659 AGCAGACCCAGTCCCGGGTAGATATCCATAGAAAAGAGAACTCTGGAGCTGCAGAGAAGCCTGTCACCATCCAT 732
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 473 AGCAGACCCAGTCCCGGGTAGATATCCATAGAAAAGAGAACTCTGGAGCTGCAGAGAAGCCTGTCACCATCCAT 546
Query 733 GCCACCCCAGAGGGGACTTCTGAAGCATGCCGCATGATTCTTGAAATCATGCAGAAAGAGGCAGATGAGACCAA 806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 547 GCCACCCCAGAGGGGACTTCTGAAGCATGCCGCATGATTCTTGAAATCATGCAGAAAGAGGCAGATGAGACCAA 620
Query 807 ACTAGCCGAAGAGATTCCTCTGAAAATCTTGGCACACAATGGCTTGGTTGGAAGACTGATTGGAAAAGAAGGCA 880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 621 ACTAGCCGAAGAGATTCCTCTGAAAATCTTGGCACACAATGGCTTGGTTGGAAGACTGATTGGAAAAGAAGGCA 694
Query 881 GAAATTTGAAGAAAATTGAACATGAAACAGGGACCAAGATAACAATCTCATCTTTGCAGGATTTGAGCATATAC 954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 695 GAAATTTGAAGAAAATTGAACATGAAACAGGGACCAAGATAACAATCTCATCTTTGCAGGATTTGAGCATATAC 768
Query 955 AACCCGGAAAGAACCATCACTGTGAAGGGCACAGTTGAGGCCTGTGCCAGTGCTGAGATAGAGATTATGAAGAA 1028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 769 AACCCGGAAAGAACCATCACTGTGAAGGGCACAGTTGAGGCCTGTGCCAGTGCTGAGATAGAGATTATGAAGAA 842
Query 1029 GCTGCGTGAGGCCTTTGAAAATGATATGCTGGCTGTTAACCAACAAGCCAATCTGATCCCAGGGTTGAACCTCA 1102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 843 GCTGCGTGAGGCCTTTGAAAATGATATGCTGGCTGTTAACCAACAAGCCAATCTGATCCCAGGGTTGAACCTCA 916
Query 1103 GCGCACTTGGCATCTTTTCAACAGGACTGTCCGTGCTATCTCCACCAGCAGGGCCCCGCGGAGCTCCCCCCGCT 1176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 917 GCGCACTTGGCATCTTTTCAACAGGACTGTCCGTGCTATCTCCACCAGCAGGGCCCCGCGGAGCTCCCCCCGCT 990
Query 1177 GCCCCCTACCACCCCTTCACTACCCACTCCGGATACTTCTCCAGCCTGTACCCCCATCACCAGTTTGGCCCGTT 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 991 GCCCCCTACCACCCCTTCACTACCCACTCCGGATACTTCTCCAGCCTGTACCCCCATCACCAGTTTGGCCCGTT 1064
Query 1251 CCCGCATCATCACTCTTATCCAGAGCAGGAGATTGTGAATCTCTTCATCCCAACCCAGGCTGTGGGCGCCATCA 1324
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1065 CCCGCATCATCACTCTTATCCAGAGCAGGAGATTGTGAATCTCTTCATCCCAACCCAGGCTGTGGGCGCCATCA 1138
Query 1325 TCGGGAAGAAGGGGGCACACATCAAACAGCTGGCGAGATTCGCCGGAGCCTCTATCAAGATTGCCCCTGCGGAA 1398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139 TCGGGAAGAAGGGGGCACACATCAAACAGCTGGCGAGATTCGCCGGAGCCTCTATCAAGATTGCCCCTGCGGAA 1212
Query 1399 GGCCCAGACGTCAGCGAAAGGATGGTCATCATCACCGGGCCACCGGAAGCCCAGTTCAAGGCCCAGGGACGGAT 1472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213 GGCCCAGACGTCAGCGAAAGGATGGTCATCATCACCGGGCCACCGGAAGCCCAGTTCAAGGCCCAGGGACGGAT 1286
Query 1473 CTTTGGGAAACTGAAAGAGGAAAACTTCTTTAACCCCAAAGAAGAAGTGAAGCTGGAAGCGCATATCAGAGTGC 1546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1287 CTTTGGGAAACTGAAAGAGGAAAACTTCTTTAACCCCAAAGAAGAAGTGAAGCTGGAAGCGCATATCAGAGTGC 1360
Query 1547 CCTCTTCCACAGCTGGCCGGGTGATTGGCAAAGGTGGCAAGACCGTGAACGAACTGCAGAACTTAACCAGTGCA 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1361 CCTCTTCCACAGCTGGCCGGGTGATTGGCAAAGGTGGCAAGACCGTGAACGAACTGCAGAACTTAACCAGTGCA 1434
Query 1621 GAAGTCATCGTGCCTCGTGACCAAACGCCAGATGAAAATGAGGAAGTGATCGTCAGAATTATCGGGCACTTCTT 1694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435 GAAGTCATCGTGCCTCGTGACCAAACGCCAGATGAAAATGAGGAAGTGATCGTCAGAATTATCGGGCACTTCTT 1508
Query 1695 TGCTAGCCAGACTGCACAGCGCAAGATCAGGGAAATTGTACAACAGGTGAAGCAGCAGGAGCAGAAATACCCTC 1768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1509 TGCTAGCCAGACTGCACAGCGCAAGATCAGGGAAATTGTACAACAGGTGAAGCAGCAGGAGCAGAAATACCCTC 1582
Query 1769 AGGGAGTCGCCTCACAGCGCAGCAAG 1794
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1583 AGGGAGTCGCCTCACAGCGCAGCAAG 1608