Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10214
• Subject: NM_032226.2
• Aligned Length: 1629
• Identities: 1626
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ---ATGTTTGGTGGCTATGAGACTATAGAAGCATACGAAGATGATCTTTATCGAGATGAGTCATCTAGTGAACT  71
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGTTTGGTGGCTATGAGACTATAGAAGCATACGAAGATGATCTTTATCGAGATGAGTCATCTAGTGAACT  74

Query   72  GAGTGTTGATAGTGAGGTGGAATTTCAACTCTATAGCCAAATTCATTATGCCCAAGATCTTGATGATGTCATCA  145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAGTGTTGATAGTGAGGTGGAATTTCAACTCTATAGCCAAATTCATTATGCCCAAGATCTTGATGATGTCATCA  148

Query  146  GGGAGGAAGAGCATGAAGAAAAGAACTCTGGGAATTCGGAATCTTCGAGTAGTAAACCAAATCAGAAGAAGCTA  219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGAGGAAGAGCATGAAGAAAAGAACTCTGGGAATTCGGAATCTTCGAGTAGTAAACCAAATCAGAAGAAGCTA  222

Query  220  ATCGTCCTTTCAGATAGTGAGGTCATCCAGCTGTCAGATGGGTCAGAGGTCATCACTTTGTCTGATGAAGACAG  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATCGTCCTTTCAGATAGTGAGGTCATCCAGCTGTCAGATGGGTCAGAGGTCATCACTTTGTCTGATGAAGACAG  296

Query  294  TATTTATAGATGTAAAGGAAAGAATGTTAGAGTTCAAGCACAAGAAAATGCCCATGGTCTTTCTTCTTCTCTTC  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TATTTATAGATGTAAAGGAAAGAATGTTAGAGTTCAAGCACAAGAAAATGCCCATGGTCTTTCTTCTTCTCTTC  370

Query  368  AATCTAATGAGCTGGTTGATAAGAAATGCAAGAGTGATATTGAGAAGCCTAAATCTGAAGAGAGATCAGGTGTA  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AATCTAATGAGCTGGTTGATAAGAAATGCAAGAGTGATATTGAGAAGCCTAAATCTGAAGAGAGATCAGGTGTA  444

Query  442  ATCCGAGAGGTCATGATTATAGAGGTCAGTTCAAGTGAAGAGGAAGAGAGCACCATTTCAGAAGGTGATAATGT  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATCCGAGAGGTCATGATTATAGAGGTCAGTTCAAGTGAAGAGGAAGAGAGCACCATTTCAGAAGGTGATAATGT  518

Query  516  GGAAAGCTGGATGCTACTGGGATGTGAAGTAGATGATAAAGATGATGATATCCTTCTCAACCTTGTGGGATGTG  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAAAGCTGGATGCTACTGGGATGTGAAGTAGATGATAAAGATGATGATATCCTTCTCAACCTTGTGGGATGTG  592

Query  590  AAAACTCTGTTACTGAAGGAGAAGATGGTATAAACTGGTCCATCAGTGACAAAGACATTGAGGCCCAGATAGCT  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAAACTCTGTTACTGAAGGAGAAGATGGTATAAACTGGTCCATCAGTGACAAAGACATTGAGGCCCAGATAGCT  666

Query  664  AATAACCGAACACCTGGAAGATGGACCCAGCGGTACTATTCAGCCAACAAAAACATTATCTGTAGAAATTGTGA  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATAACCGAACACCTGGAAGATGGACCCAGCGGTACTATTCAGCCAACAAAAACATTATCTGTAGAAATTGTGA  740

Query  738  CAAACGTGGTCATTTATCAAAAAACTGCCCCTTACCACGAAAAGTTCGTCGCTGCTTCCTGTGCTCCAGGAGAG  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAAACGTGGTCATTTATCAAAAAACTGCCCCTTACCACGAAAAGTTCGTCGCTGCTTCCTGTGCTCCAGGAGAG  814

Query  812  GACATCTCCTGTATTCCTGTCCAGCCCCCCTTTGCGAATACTGTCCTGTGCCTAAGATGTTGGACCACTCATGT  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GACATCTCCTGTATTCCTGTCCAGCCCCCCTTTGCGAATACTGTCCTGTGCCTAAGATGTTGGACCACTCATGT  888

Query  886  CTTTTCAGACATTCCTGGGATAAACAGTGTGACCGATGTCATATGCTAGGCCACTATACAGATGCTTGCACAGA  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTTTCAGACATTCCTGGGATAAACAGTGTGACCGATGTCATATGCTAGGCCACTATACAGATGCTTGCACAGA  962

Query  960  AATCTGGAGGCAGTATCACCTAACGACCAAACCTGGACCACCCAAAAAGCCGAAGACCCCTTCAAGACCATCAG  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AATCTGGAGGCAGTATCACCTAACGACCAAACCTGGACCACCCAAAAAGCCGAAGACCCCTTCAAGACCATCAG  1036

Query 1034  CCTTAGCATATTGCTATCACTGCGCGCAAAAAGGCCATTATGGACACGAATGTCCAGAAAGAGAAGTGTATGAC  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCTTAGCATATTGCTATCACTGCGCGCAAAAAGGCCATTATGGACACGAATGTCCAGAAAGAGAAGTGTATGAC  1110

Query 1108  CCGTCTCCAGTATCTCCATTCATCTGCTACTATGATGACAAATATGAAATTCAGGAGAGAGAAAAGAGACTAAA  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCGTCTCCAGTATCTCCATTCATCTGCTACTATGATGACAAATATGAAATTCAGGAGAGAGAAAAGAGACTAAA  1184

Query 1182  ACAAAAAATAAAAGTACTCAAGAAAAATGGGGTTATCCCAGAGCCATCCAAGCTACCTTATATAAAAGCAGCAA  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACAAAAAATAAAAGTACTCAAGAAAAATGGGGTTATCCCAGAGCCATCCAAGCTACCTTATATAAAAGCAGCAA  1258

Query 1256  ATGAGAACCCCCACCATGATATAAGGAAGGGCCGTGCCTCATGGAAAAGCAACAGGTGGCCTCAAGAAAATAAA  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATGAGAACCCCCACCATGATATAAGGAAGGGCCGTGCCTCATGGAAAAGCAACAGGTGGCCTCAAGAAAATAAA  1332

Query 1330  GAAACACAAAAAGAAATGAAGAACAAGAATAGAAACTGGGAGAAGCACAGGAAGGCTGACAGACATCGTGAAGT  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAAACACAAAAAGAAATGAAGAACAAGAATAGAAACTGGGAGAAGCACAGGAAGGCTGACAGACATCGTGAAGT  1406

Query 1404  GGATGAGGATTTTCCCAGGGGCCCCAAAACCTACTCTTCTCCTGGCAGTTTTAAAACCCAGAAGCCTTCTAAGC  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGATGAGGATTTTCCCAGGGGCCCCAAAACCTACTCTTCTCCTGGCAGTTTTAAAACCCAGAAGCCTTCTAAGC  1480

Query 1478  CCTTTCACCGTTCATCACATTACCACACGTCAAGAGAAGACAAGTCTCCCAAGGAAGGCAAGAGGGGCAAGCAG  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCTTTCACCGTTCATCACATTACCACACGTCAAGAGAAGACAAGTCTCCCAAGGAAGGCAAGAGGGGCAAGCAG  1554

Query 1552  AAGAAAAAGGAGAGGTGCTGGGAAGATGATGACAATGATAACTTATTTCTTATTAAGCAGAGAAAAAAAAAGTC  1625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAGAAAAAGGAGAGGTGCTGGGAAGATGATGACAATGATAACTTATTTCTTATTAAGCAGAGAAAAAAAAAGTC  1628

Query 1626  T  1626
            |
Sbjct 1629  T  1629