Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10214
• Subject: XM_017015199.2
• Aligned Length: 1626
• Identities: 1035
• Gaps: 591

Alignment

Query    1  ATGTTTGGTGGCTATGAGACTATAGAAGCATACGAAGATGATCTTTATCGAGATGAGTCATCTAGTGAACTGAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGTTGATAGTGAGGTGGAATTTCAACTCTATAGCCAAATTCATTATGCCCAAGATCTTGATGATGTCATCAGGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGGAAGAGCATGAAGAAAAGAACTCTGGGAATTCGGAATCTTCGAGTAGTAAACCAAATCAGAAGAAGCTAATC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GTCCTTTCAGATAGTGAGGTCATCCAGCTGTCAGATGGGTCAGAGGTCATCACTTTGTCTGATGAAGACAGTAT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TTATAGATGTAAAGGAAAGAATGTTAGAGTTCAAGCACAAGAAAATGCCCATGGTCTTTCTTCTTCTCTTCAAT  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CTAATGAGCTGGTTGATAAGAAATGCAAGAGTGATATTGAGAAGCCTAAATCTGAAGAGAGATCAGGTGTAATC  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  CGAGAGGTCATGATTATAGAGGTCAGTTCAAGTGAAGAGGAAGAGAGCACCATTTCAGAAGGTGATAATGTGGA  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  AAGCTGGATGCTACTGGGATGTGAAGTAGATGATAAAGATGATGATATCCTTCTCAACCTTGTGGGATGTGAAA  592
                                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------ATGATAAAGATGATGATATCCTTCTCAACCTTGTGGGATGTGAAA  45

Query  593  ACTCTGTTACTGAAGGAGAAGATGGTATAAACTGGTCCATCAGTGACAAAGACATTGAGGCCCAGATAGCTAAT  666
            |||||||||||||                                            |||||||||||||||||
Sbjct   46  ACTCTGTTACTGA--------------------------------------------AGGCCCAGATAGCTAAT  75

Query  667  AACCGAACACCTGGAAGATGGACCCAGCGGTACTATTCAGCCAACAAAAACATTATCTGTAGAAATTGTGACAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   76  AACCGAACACCTGGAAGATGGACCCAGCGGTACTATTCAGCCAACAAAAACATTATCTGTAGAAATTGTGACAA  149

Query  741  ACGTGGTCATTTATCAAAAAACTGCCCCTTACCACGAAAAGTTCGTCGCTGCTTCCTGTGCTCCAGGAGAGGAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  150  ACGTGGTCATTTATCAAAAAACTGCCCCTTACCACGAAAAGTTCGTCGCTGCTTCCTGTGCTCCAGGAGAGGAC  223

Query  815  ATCTCCTGTATTCCTGTCCAGCCCCCCTTTGCGAATACTGTCCTGTGCCTAAGATGTTGGACCACTCATGTCTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  224  ATCTCCTGTATTCCTGTCCAGCCCCCCTTTGCGAATACTGTCCTGTGCCTAAGATGTTGGACCACTCATGTCTT  297

Query  889  TTCAGACATTCCTGGGATAAACAGTGTGACCGATGTCATATGCTAGGCCACTATACAGATGCTTGCACAGAAAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  298  TTCAGACATTCCTGGGATAAACAGTGTGACCGATGTCATATGCTAGGCCACTATACAGATGCTTGCACAGAAAT  371

Query  963  CTGGAGGCAGTATCACCTAACGACCAAACCTGGACCACCCAAAAAGCCGAAGACCCCTTCAAGACCATCAGCCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  372  CTGGAGGCAGTATCACCTAACGACCAAACCTGGACCACCCAAAAAGCCGAAGACCCCTTCAAGACCATCAGCCT  445

Query 1037  TAGCATATTGCTATCACTGCGCGCAAAAAGGCCATTATGGACACGAATGTCCAGAAAGAGAAGTGTATGACCCG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  446  TAGCATATTGCTATCACTGCGCGCAAAAAGGCCATTATGGACACGAATGTCCAGAAAGAGAAGTGTATGACCCG  519

Query 1111  TCTCCAGTATCTCCATTCATCTGCTACTATGATGACAAATATGAAATTCAGGAGAGAGAAAAGAGACTAAAACA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  520  TCTCCAGTATCTCCATTCATCTGCTACTATGATGACAAATATGAAATTCAGGAGAGAGAAAAGAGACTAAAACA  593

Query 1185  AAAAATAAAAGTACTCAAGAAAAATGGGGTTATCCCAGAGCCATCCAAGCTACCTTATATAAAAGCAGCAAATG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  594  AAAAATAAAAGTACTCAAGAAAAATGGGGTTATCCCAGAGCCATCCAAGCTACCTTATATAAAAGCAGCAAATG  667

Query 1259  AGAACCCCCACCATGATATAAGGAAGGGCCGTGCCTCATGGAAAAGCAACAGGTGGCCTCAAGAAAATAAAGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  668  AGAACCCCCACCATGATATAAGGAAGGGCCGTGCCTCATGGAAAAGCAACAGGTGGCCTCAAGAAAATAAAGAA  741

Query 1333  ACACAAAAAGAAATGAAGAACAAGAATAGAAACTGGGAGAAGCACAGGAAGGCTGACAGACATCGTGAAGTGGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  742  ACACAAAAAGAAATGAAGAACAAGAATAGAAACTGGGAGAAGCACAGGAAGGCTGACAGACATCGTGAAGTGGA  815

Query 1407  TGAGGATTTTCCCAGGGGCCCCAAAACCTACTCTTCTCCTGGCAGTTTTAAAACCCAGAAGCCTTCTAAGCCCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  816  TGAGGATTTTCCCAGGGGCCCCAAAACCTACTCTTCTCCTGGCAGTTTTAAAACCCAGAAGCCTTCTAAGCCCT  889

Query 1481  TTCACCGTTCATCACATTACCACACGTCAAGAGAAGACAAGTCTCCCAAGGAAGGCAAGAGGGGCAAGCAGAAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  890  TTCACCGTTCATCACATTACCACACGTCAAGAGAAGACAAGTCTCCCAAGGAAGGCAAGAGGGGCAAGCAGAAG  963

Query 1555  AAAAAGGAGAGGTGCTGGGAAGATGATGACAATGATAACTTATTTCTTATTAAGCAGAGAAAAAAAAAGTCT  1626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  964  AAAAAGGAGAGGTGCTGGGAAGATGATGACAATGATAACTTATTTCTTATTAAGCAGAGAAAAAAAAAGTCT  1035