Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10223
• Subject: NM_000767.5
• Aligned Length: 1473
• Identities: 1080
• Gaps: 342

Alignment

Query    1  ATGGAGCTCAGCGTCCTCCTCTTCCTTGCACTCCTCACAGGCCTCTTGCTACTCCTGGTTCAGCGTCACCCTAA  74
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGAACTCAGCGTCCTCCTCTTCCTTGCACTCCTCACAGGACTCTTGCTACTCCTGGTTCAGCGCCACCCTAA  74

Query   75  CTCCCATGGCACCCTCCCACCAGGGCCCCGCCCTCTGCCCCTTTTGGGGAACCTTCTGCAGATGGACAGAAGAG  148
            |.||||||.|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  CACCCATGACCGCCTCCCACCAGGGCCCCGCCCTCTGCCCCTTTTGGGAAACCTTCTGCAGATGGATAGAAGAG  148

Query  149  GCCTACTCAAATCCTTTCTGAGGTTCCGAGAGAAATATGGGGACGTCTTCACGGTACACCTGGGACCGAGGCCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCTACTCAAATCCTTTCTGAGGTTCCGAGAGAAATATGGGGACGTCTTCACGGTACACCTGGGACCGAGGCCC  222

Query  223  GTGGTCATGCTGTGTGGAGTAGAGGCCATACGGGAGGCCCTGGTGGACAACGCTGAGGCCTTCTCTGGCCGGGG  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTGGTCATGCTGTGTGGAGTAGAGGCCATACGGGAGGCCCTTGTGGACAAGGCTGAGGCCTTCTCTGGCCGGGG  296

Query  297  AAAAATCGTCATCATGGACCCAGTCTACCAGGGATATGGCATGCTCTTTGCCAATGGAAACCGCTGGAAGGTGC  370
            ||||||||.|||..|.||||||.|||.||.|||||||||..||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAAAATCGCCATGGTCGACCCATTCTTCCGGGGATATGGTGTGATCTTTGCCAATGGAAACCGCTGGAAGGTGC  370

Query  371  TTCGGCGATTCTCTGTGACCACCATGAGGGACTTCGGGATGGGAAAGCGGAGTGTGGAGGAGCGGATTCAGGAC  444
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  TTCGGCGATTCTCTGTGACCACTATGAGGGACTTCGGGATGGGAAAGCGGAGTGTGGAGGAGCGGATTCAGGAG  444

Query  445  GAGGCTCAGTGTCTGATAGAGGAACTTCGGAAATCCAAGGGAGCCCTCGTGGACCCCACCTTCCTCTTCCATTC  518
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  445  GAGGCTCAGTGTCTGATAGAGGAGCTTCGGAAATCCAAGGGGGCCCTCATGGACCCCACCTTCCTCTTCCAGTC  518

Query  519  CATTACCGCCAACATCATCTGCTCCATCATCTTTGGAAAACGCTTCCACTACCAAGATCAAGAGTTCCTGAAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATTACCGCCAACATCATCTGCTCCATCGTCTTTGGAAAACGATTCCACTACCAAGATCAAGAGTTCCTGAAGA  592

Query  593  CGCTGAACTTGTTCTGCCAGAGTTTCTTACTCATCAGCTCTATATCCAGCCAGCTGTTTGAGCTCTTCTCTGGC  666
            .||||||||||||||.|||||.|||.|.|||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCTGAACTTGTTCTACCAGACTTTTTCACTCATCAGCTCTGTATTCGGCCAGCTGTTTGAGCTCTTCTCTGGC  666

Query  667  TTCTTGAAATACTTTCCTGGGGCACACAGGCAAGTTTACAAAAACCTACAGGAAATCAATGCTTACATTGGCCA  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTCTTGAAATACTTTCCTGGGGCACACAGGCAAGTTTACAAAAACCTGCAGGAAATCAATGCTTACATTGGCCA  740

Query  741  CAGTGTGGAGAAGCACCGTGAAACCCTGGACCCCAGCGCCCCCAGGGACCTCATCGACACCTACCTGCTCCACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGTGTGGAGAAGCACCGTGAAACCCTGGACCCCAGCGCCCCCAAGGACCTCATCGACACCTACCTGCTCCACA  814

Query  815  TGGAAAAAGAGAAATCCAACCCACACAGTGAATTCAGCCACCAGAACCTCATCATCAACACGCTCTCGCTCTTC  888
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGAAAAAGAGAAATCCAACGCACACAGTGAATTCAGCCACCAGAACCTCAACCTCAACACGCTCTCGCTCTTC  888

Query  889  TTTGCTGGCACTGAGACCACCAGCACCACTCTCCGCTACGGCTTCCTGCTCATGCTCAAATACCCTCATGTCGC  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  889  TTTGCTGGCACTGAGACCACCAGCACCACTCTCCGCTACGGCTTCCTGCTCATGCTCAAATACCCTCATGTTGC  962

Query  963  AGAGAGAGTCTACAAGGAGATTGAACAGGTGGTTGGCCCACATCGCCCTCCAGCGCTTGATGACCGAGCCAAAA  1036
            ||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||
Sbjct  963  AGAGAGAGTCTACAGGGAGATTGAACAGGTGATTGGCCCACATCGCCCTCCAGAGCTTCATGACCGAGCCAAAA  1036

Query 1037  TGCCATACACAGAGGCAGTCATCCGTGAGATTCAGAGATTTGCTGACCTTCTCCCCATGGGTGTGCCCCACATT  1110
            |||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGCCATACACAGAGGCAGTCATCTATGAGATTCAGAGATTTTCCGACCTTCTCCCCATGGGTGTGCCCCACATT  1110

Query 1111  GTCACCCAACACACCAGCTTC-----------------------------------------------------  1131
            |||||||||||||||||||||                                                     
Sbjct 1111  GTCACCCAACACACCAGCTTCCGAGGGTACATCATCCCCAAGGACACAGAAGTATTTCTCATCCTGAGCACTGC  1184

Query 1132  --------------------------------------------------------------------------  1131
                                                                                      
Sbjct 1185  TCTCCATGACCCACACTACTTTGAAAAACCAGACGCCTTCAATCCTGACCACTTTCTGGATGCCAATGGGGCAC  1258

Query 1132  --------------------------------------------------------------------------  1131
                                                                                      
Sbjct 1259  TGAAAAAGACTGAAGCTTTTATCCCCTTCTCCTTAGGGAAGCGGATTTGTCTTGGTGAAGGCATCGCCCGTGCG  1332

Query 1132  --------------------------------------------------------------------------  1131
                                                                                      
Sbjct 1333  GAATTGTTCCTCTTCTTCACCACCATCCTCCAGAACTTCTCCATGGCCAGCCCCGTGGCCCCAGAAGACATCGA  1406

Query 1132  -------------------------------------------------------------------  1131
                                                                               
Sbjct 1407  TCTGACACCCCAGGAGTGTGGTGTGGGCAAAATACCCCCAACATACCAGATCCGCTTCCTGCCCCGC  1473