Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10432
• Subject: XM_024452831.1
• Aligned Length: 1428
• Identities: 1343
• Gaps: 75

Alignment

Query    1  ATGACTACTATCTTGACTTACCCCTTTAAAAATCTTCCCACTGCATCAAAATGGGCCCTCAGATTTTCCATAAG  74
                                                        ||.|.|.|||         ||         
Sbjct    1  --------------------------------------------ATGACACTGG---------TT---------  12

Query   75  ACCTCTGAGCTGTT-CCTCCCAGCTACGAGCTGCCCCA--GCTGTCCAGACCAAAACGAAGAAGACGTTAGCCA  145
               ||||    ||| .||||.|  ||.| |.||...||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   13  ---TCTG----GTTGGCTCCTA--TATG-GATGGATCATTGCTGTCCAGACCAAAACGAAGAAGACGTTAGCCA  76

Query  146  AACCCAATATAAGGAATGTTGTGGTGGTGGATGGTGTTCGCACTCCATTTTTGCTGTCTGGCACTTCATATAAA  219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   77  AACCCAATATAAGGAATGTTGTGGTGGTGGATGGTGTTCGCACTCCATTTTTGCTGTCTGGCACTTCATATAAA  150

Query  220  GACCTGATGCCACATGATTTGGCTAGAGCAGCGCTTACGGGTTTGTTGCATCGGACCAGTGTCCCTAAGGAAGT  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  151  GACCTGATGCCACATGATTTGGCTAGAGCAGCGCTTACGGGTTTGTTGCATCGGACCAGTGTCCCTAAGGAAGT  224

Query  294  AGTTGATTATATCATCTTTGGTACAGTTATTCAGGAAGTGAAAACAAGCAATGTGGCTAGAGAGGCTGCCCTTG  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  225  AGTTGATTATATCATCTTTGGTACAGTTATTCAGGAAGTGAAAACAAGCAATGTGGCTAGAGAGGCTGCCCTTG  298

Query  368  GAGCTGGCTTCTCTGACAAGACTCCTGCTCACACTGTCACCATGGCTTGTATCTCTGCCAACCAAGCCATGACC  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  299  GAGCTGGCTTCTCTGACAAGACTCCTGCTCACACTGTCACCATGGCTTGTATCTCTGCCAACCAAGCCATGACC  372

Query  442  ACAGGTGTTGGCTTGATTGCTTCTGGCCAGTGTGATGTGATCGTGGCAGGTGGTGTTGAGTTGATGTCCGATGT  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  373  ACAGGTGTTGGCTTGATTGCTTCTGGCCAGTGTGATGTGATCGTGGCAGGTGGTGTTGAGTTGATGTCCGATGT  446

Query  516  CCCTATTCGTCACTCAAGGAAAATGAGAAAACTGATGCTTGATCTCAATAAGGCCAAATCTATGGGCCAGCGAC  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  447  CCCTATTCGTCACTCAAGGAAAATGAGAAAACTGATGCTTGATCTCAATAAGGCCAAATCTATGGGCCAGCGAC  520

Query  590  TGTCTTTAATCTCTAAATTCCGATTTAATTTCCTAGCACCTGAGCTCCCTGCGGTTTCTGAGTTCTCCACCAGT  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  521  TGTCTTTAATCTCTAAATTCCGATTTAATTTCCTAGCACCTGAGCTCCCTGCGGTTTCTGAGTTCTCCACCAGT  594

Query  664  GAGACCATGGGCCACTCTGCAGACCGACTGGCCGCTGCCTTTGCTGTTTCTCGGCTGGAACAGGATGAATATGC  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  595  GAGACCATGGGCCACTCTGCAGACCGACTGGCCGCTGCCTTTGCTGTTTCTCGGCTGGAACAGGATGAATATGC  668

Query  738  ACTGCGCTCTCACAGTCTAGCCAAGAAGGCACAGGATGAAGGACTCCTTTCTGATGTGGTACCCTTCAAAGTAC  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  669  ACTGCGCTCTCACAGTCTAGCCAAGAAGGCACAGGATGAAGGACTCCTTTCTGATGTGGTACCCTTCAAAGTAC  742

Query  812  CAGGAAAAGATACAGTTACCAAAGATAATGGCATCCGTCCTTCCTCACTGGAGCAGATGGCCAAACTAAAACCT  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  743  CAGGAAAAGATACAGTTACCAAAGATAATGGCATCCGTCCTTCCTCACTGGAGCAGATGGCCAAACTAAAACCT  816

Query  886  GCATTCATCAAGCCCTACGGCACAGTGACAGCTGCAAATTCTTCTTTCTTGACTGATGGTGCATCTGCAATGTT  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  817  GCATTCATCAAGCCCTACGGCACAGTGACAGCTGCAAATTCTTCTTTCTTGACTGATGGTGCATCTGCAATGTT  890

Query  960  AATCATGGCGGAGGAAAAGGCTCTGGCCATGGGTTATAAGCCGAAGGCATATTTGAGGGATTTTATGTATGTGT  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  891  AATCATGGCGGAGGAAAAGGCTCTGGCCATGGGTTATAAGCCGAAGGCATATTTGAGGGATTTTATGTATGTGT  964

Query 1034  CTCAGGATCCAAAAGATCAACTATTACTTGGACCAACATATGCTACTCCAAAAGTTCTAGAAAAGGCAGGATTG  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  965  CTCAGGATCCAAAAGATCAACTATTACTTGGACCAACATATGCTACTCCAAAAGTTCTAGAAAAGGCAGGATTG  1038

Query 1108  ACCATGAATGATATTGATGCTTTTGAATTTCATGAAGCTTTCTCGGGTCAGATTTTGGCAAATTTTAAAGCCAT  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1039  ACCATGAATGATATTGATGCTTTTGAATTTCATGAAGCTTTCTCGGGTCAGATTTTGGCAAATTTTAAAGCCAT  1112

Query 1182  GGATTCTGATTGGTTTGCAGAAAACTACATGGGTAGAAAAACCAAGGTTGGATTGCCTCCTTTGGAGAAGTTTA  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1113  GGATTCTGATTGGTTTGCAGAAAACTACATGGGTAGAAAAACCAAGGTTGGATTGCCTCCTTTGGAGAAGTTTA  1186

Query 1256  ATAACTGGGGTGGATCTCTGTCCCTGGGACACCCATTTGGAGCCACTGGCTGCAGGTTGGTCATGGCTGCTGCC  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1187  ATAACTGGGGTGGATCTCTGTCCCTGGGACACCCATTTGGAGCCACTGGCTGCAGGTTGGTCATGGCTGCTGCC  1260

Query 1330  AACAGATTACGGAAAGAAGGAGGCCAGTATGGCTTAGTGGCTGCGTGTGCAGCTGGAGGGCAGGGCCATGCTAT  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261  AACAGATTACGGAAAGAAGGAGGCCAGTATGGCTTAGTGGCTGCGTGTGCAGCTGGAGGGCAGGGCCATGCTAT  1334

Query 1404  GATAGTGGAAGCTTATCCAAAA  1425
            ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1335  GATAGTGGAAGCTTATCCAAAA  1356