Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10440
• Subject: XM_011247940.2
• Aligned Length: 1416
• Identities: 1012
• Gaps: 294

Alignment

Query    1  ATGAGCAAGATGAAGAACTTTAAGCGCCGTTTCTCCCTGTCAGTGCCCCGCACTGAGACCATTGAAGAATCCTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGCTGAATTCACGGAGCAATTCAACCAGCTCCACAACCGGCGGAATGAGAACTTGCAGCTCGGTCCTCTTGGCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GAGACCCCCCGCAGGAGTGCAGCACCTTCTCCCCAACAGACAGCGGGGAGGAGCCGGGGCAGCTCTCCCCTGGC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GTGCAGTTCCAGCGGCGGCAGAACCAGCGCCGCTTCTCCATGGAGGACGTCAGCAAGAGGCTCTCTCTGCCCAT  296
                                                                                    ||
Sbjct    1  ------------------------------------------------------------------------AT  2

Query  297  GGATATCCGCCTGCCCCAGGAATTCCTACAGAAGCTACAGATGGAGAGCCCAGATCTGCCCAAGCCGCTCAGCC  370
            |||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.||||||.|||||..|||||||||||.||||.||
Sbjct    3  GGACATCCGCCTACCCCAGGAATTCCTGCAGAAGCTACAGCTGGAGAACCCAGGGCTGCCCAAGCCTCTCACCC  76

Query  371  GCATGTCCCGCCGGGCCTCCCTGTCAGACATTGGCTTTGGGAAACTGGAAACATACGTGAAACTGGACAAACTG  444
            |||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct   77  GCATGTCCCGCCGTGCCTCCCTGTCAGATATCGGCTTTGGGAAACTGGAAACATATGTGAAACTGGACAAACTG  150

Query  445  GGAGAGGGCACCTATGCCACAGTCTTCAAAGGGCGCAGCAAACTGATGGAGAACCTTGTGGCCCTGAAAGAGAT  518
            ||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||..||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  151  GGGGAGGGTACCTATGCCACCGTCTTCAAGGGACGCAGCAAGCTGACAGAGAACCTCGTGGCCCTGAAGGAGAT  224

Query  519  CCGGCTGGAGCACGAGGAGGGAGCGCCCTGCACTGCCATCCGAGAGGTGTCTCTGCTGAAGAACCTGAAGCACG  592
            ||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||||
Sbjct  225  CCGGCTGGAGCATGAGGAAGGGGCGCCCTGCACTGCTATTCGAGAGGTGTCTCTGCTGAAGGACCTGAAACACG  298

Query  593  CCAATATTGTGACCCTGCATGACCTCATCCACACAGATCGGTCCCTCACCCTGGTGTTTGAGTACCTGGACAGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  299  CCAATATTGTGACCCTGCATGACCTCATTCACACAGATCGGTCCCTCACCCTGGTGTTTGAGTACCTGGACAGT  372

Query  667  GACCTGAAGCAGTATCTGGACCACTGTGGGAACCTCATGAGCATGCACAACGTCAAGATTTTCATGTTCCAGCT  740
            ||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  373  GACCTGAAACAGTACCTAGACCACTGTGGGAACCTCATGAACATGCACAATGTCAAGATATTCATGTTCCAGCT  446

Query  741  GCTCCGGGGCCTCGCCTACTGTCACCACCGCAAGATCCTGCACCGGGACCTGAAGCCCCAGAACCTGCTCATCA  814
            |||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  447  GCTCCGGGGTCTGGCCTACTGCCACCACCGCAAGATCCTGCACCGGGACCTGAAGCCCCAGAACCTACTCATCA  520

Query  815  ACGAGAGGGGGGAGCTGAAGCTGGCCGACTTTGGACTGGCCAGGGCCAAGTCAGTGCCCACAAAGACTTACTCC  888
            |.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||.||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct  521  ATGAGAGGGGCGAGCTGAAGCTGGCCGACTTTGGCCTGGCCCGGGCCAAATCAGTGCCTACAAAGACCTATTCC  594

Query  889  AATGAGGTGGTGACCCTGTGGTACAGGCCCCCCGATGTGCTGCTGGGATCCACAGAGTACTCCACCCCCATTGA  962
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  595  AATGAGGTGGTGACCCTCTGGTACAGGCCCCCAGATGTGCTGCTGGGATCCACAGAGTACTCCACCCCCATTGA  668

Query  963  TATGTGGGGCGTGGGCTGCATCCACTACGAGATGGCCACAGGGAGGCCCCTCTTCCCGGGCTCCACAGTCAAGG  1036
            .||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||.||.|.||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  669  CATGTGGGGCGTGGGCTGCATCCTCTATGAGATGGCCACCGGCAAGCCCCTCTTCCCGGGCTCTACTGTCAAGG  742

Query 1037  AGGAGCTGCACCTCATCTTTCGCCTCCTCGGGACCCCCACAGAAGAGACGTGGCCCGGCGTGACCGCCTTCTCT  1110
            |||||.|||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||.|||||||.||.|||||..||.|||||
Sbjct  743  AGGAGTTGCACCTCATCTTCCGTCTCCTAGGGACACCTACAGAAGAGTCGTGGCCGGGTGTGACGTCCATCTCT  816

Query 1111  GAGTTCCGCACCTACAGCTTCCCCTGCTACCTCCCGCAGCCGCTCATCAACCACGCGCCCAGGTTGGATACGGA  1184
            |||||.||..||||||.|||||||.|.|||||.||.|||||.||..|||.||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  817  GAGTTTCGAGCCTACAACTTCCCCCGATACCTACCACAGCCACTGCTCAGCCACGCCCCCAGGTTGGATACTGA  890

Query 1185  TGGCATCCACCTCCTGAGCAGCCTGCTCCTGTATGAATCCAAGAGTCGCATGTCAGCAGAGGCTGCCCTGAGTC  1258
            .||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.||
Sbjct  891  AGGCATCAACCTCCTGAGCAGCCTCCTCCTGTATGAATCCAAGAGTCGCATGTCAGCAGAGGCAGCCCTCAATC  964

Query 1259  ACTCCTACTTCCGGTCTCTGGGAGAGCGTGTGCACCAGCTTGAAGACACTGCCTCCATCTTCTCCCTGAAGGAG  1332
            ||.|||||||||.||||||.|||||.||.||.||.|||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  965  ACCCCTACTTCCAGTCTCTCGGAGACCGAGTTCATCAGCTCCATGACACTGCCTCCATCTTCTCCCTGAAGGAG  1038

Query 1333  ATCCAGCTCCAGAAGGACCCAGGCTACCGAGGCTTGGCCTTCCAGCAGCCAGGACGAGGGAAGAACAGGCGGCA  1406
            |||||||||||.||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.|||||.||||||||||.|.|||||||
Sbjct 1039  ATCCAGCTCCAAAAGGACCCAGGCTATCGTGGCCTGGCCTTCCAGCACCCAGGGCGAGGGAAGAGCCGGCGGCA  1112

Query 1407  CAGCATCTTC  1416
            .|||||||||
Sbjct 1113  GAGCATCTTC  1122