Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10463
• Subject: NR_047674.1
• Aligned Length: 3074
• Identities: 1907
• Gaps: 1166

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GGAGTTTGGAGGGGAGAGGGGAAGGTGGCTGGCCGGGTGGCTGAAATCAAAAATTCAATTGCGCACTGGGTTGT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GATGAGAAATCTAATCAGATCTTTGGCGAAGGGGCCGGCCGGAAGGATGGAGAGTGGGGGGGAAGTTGCTCCCC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AAATTCTTCGAAGGGGAGGCTGGGGAGAGGAATTGACCATGTAAAAGGAGACTTTTTTTTTTGGTGGTGGTGGC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  TGTTGGGTGCCTTGCAAAAATGAAGGATGCAGGACGCAGCTTTCTCCTGGAACCGAACGCAATGGATAAACTGA  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  TTGTGCAAGAGAGAAGGAAGAACGAAGCTTTTTCTTGTGAGCCCTGGATCTTAACACAAATGTGTATATGTGCA  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  CACAGGGAGCATTCAAGAATGAAATAAACCAGAGTTAGACCCGCGGGGGTTGGTGTGTTCTGACATAAATAAAT  444

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  445  AATCTTAAAGCAGCTGTTCCCCTCCCCCCCCCCAAAAAAAAGGATGATTGGAAATGAAGAACCGAGGATTCACA  518

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  519  AAGAAAAAAGTATGTTCATTTTTCTCTATAAAGGAGAAAGTGAGCCAAGGAGATATTTTTGGAATGAAAAGTTT  592

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  593  GGGGCTTTTTTAGTAAAGTAAAGAACTGGTGTGGTGGTGTTTTCTTTTCTTTTTGAATTTCCCACAAGAGGAGA  666

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  667  GGAAATTAATAATACATCTGCAAAGAAATTTCAGAGAAGAAAAGTTGACCGCGGCAGATTGAGGCATTGATTGG  740

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  741  GGGAGAGAAACCAGCAGAGCACAGTTGGATTTGTGCCTATGTTGACTAAAATTGACGGATAATTGCAGTTGGAT  814

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  815  TTTTCTTCATCAACCTCCTTTTTTTTTAATTTTTATTCCTTTTGGTATCAAGATCATGCGTTTTCTCTTGTTCT  888

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  889  TAACCACCTGGATTTCCATCTGGATGTTGCTGTGATCAGTCTGAAATACAACTGTTTGAATTCCAGAAGGACCA  962

Query    1  ------------------------------ATGACCTTACATCCACAGCAGATAATGATAGGTCCTAGGTTTAA  44
                                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACACCAGATAAATTATGAATGTTGAACAAGATGACCTTACATCCACAGCAGATAATGATAGGTCCTAGGTTTAA  1036

Query   45  CAGGGCCCTATTTGACCCCCTGCTTGTGGTGCTGCTGGCTCTTCAACTTCTTGTGGTGGCTGGTCTGGTGCGGG  118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGGGCCCTATTTGACCCCCTGCTTGTGGTGCTGCTGGCTCTTCAACTTCTTGTGGTGGCTGGTCTGGTGCGGG  1110

Query  119  CTCAGACCTGCCCTTCTGTGTGCTCCTGCAGCAACCAGTTCAGCAAGGTGATTTGTGTTCGGAAAAACCTGCGT  192
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTCAGACCTGCCCTTCTGTGTGCTCCTGCAGCAACCAGTTCAGCAAGGTGATTTGTGTTCGGAAAAACCTGCGT  1184

Query  193  GAGGTTCCGGATGGCATCTCCACCAACACACGGCTGCTGAACCTCCATGAGAACCAAATCCAGATCATCAAAGT  266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAGGTTCCGGATGGCATCTCCACCAACACACGGCTGCTGAACCTCCATGAGAACCAAATCCAGATCATCAAAGT  1258

Query  267  GAACAGCTTCAAGCACTTGAGACACTTGGAAATCCTACAGTTGAGTAGGAACCATATCAGAACCATTGAAATTG  340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GAACAGCTTCAAGCACTTGAGACACTTGGAAATCCTACAGTTGAGTAGGAACCATATCAGAACCATTGAAATTG  1332

Query  341  GGGCTTTCAATGGTCTGGCGAACCTCAACACTCTGGAACTCTTTGACAATCGTCTTACTACCATCCCGAATGGA  414
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGGCTTTCAATGGTCTGGCGAACCTCAACACTCTGGAACTCTTTGACAATCGTCTTACTACCATCCCGAATGGA  1406

Query  415  GCTTTTGTATACTTGTCTAAACTGAAGGAGCTCTGGTTGCGAAACAACCCCATTGAAAGCATCCCTTCTTATGC  488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCTTTTGTATACTTGTCTAAACTGAAGGAGCTCTGGTTGCGAAACAACCCCATTGAAAGCATCCCTTCTTATGC  1480

Query  489  TTTTAACAGAATTCCTTCTTTGCGCCGACTAGACTTAGGGGAATTGAAAAGACTTTCATACATCTCAGAAGGTG  562
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTTTAACAGAATTCCTTCTTTGCGCCGACTAGACTTAGGGGAATTGAAAAGACTTTCATACATCTCAGAAGGTG  1554

Query  563  CCTTTGAAGGTCTGTCCAACTTGAGGTATTTGAACCTTGCCATGTGCAACCTTCGGGAAATCCCTAACCTCACA  636
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCTTTGAAGGTCTGTCCAACTTGAGGTATTTGAACCTTGCCATGTGCAACCTTCGGGAAATCCCTAACCTCACA  1628

Query  637  CCGCTCATAAAACTAGATGAGCTGGATCTTTCTGGGAATCATTTATCTGCCATCAGGCCTGGCTCTTTCCAGGG  710
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCGCTCATAAAACTAGATGAGCTGGATCTTTCTGGGAATCATTTATCTGCCATCAGGCCTGGCTCTTTCCAGGG  1702

Query  711  TTTGATGCACCTTCAAAAACTGTGGATGATACAGTCCCAGATTCAAGTGATTGAACGGAATGCCTTTGACAACC  784
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TTTGATGCACCTTCAAAAACTGTGGATGATACAGTCCCAGATTCAAGTGATTGAACGGAATGCCTTTGACAACC  1776

Query  785  TTCAGTCACTAGTGGAGATCAACCTGGCACACAATAATCTAACATTACTGCCTCATGACCTCTTCACTCCCTTG  858
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTCAGTCACTAGTGGAGATCAACCTGGCACACAATAATCTAACATTACTGCCTCATGACCTCTTCACTCCCTTG  1850

Query  859  CATCATCTAGAGCGGATACATTTACATCACAACCCTTGGAACTGTAACTGTGACATACTGTGGCTCAGCTGGTG  932
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CATCATCTAGAGCGGATACATTTACATCACAACCCTTGGAACTGTAACTGTGACATACTGTGGCTCAGCTGGTG  1924

Query  933  GATAAAAGACATGGCCCCGTCGAACACAGCTTGTTGTGCCCGGTGTAACACTCCTCCCAATCTAAAGGGGAGGT  1006
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GATAAAAGACATGGCCCCCTCGAACACAGCTTGTTGTGCCCGGTGTAACACTCCTCCCAATCTAAAGGGGAGGT  1998

Query 1007  ACATTGGAGAGCTCGACCAGAATTACTTCACATGCTATGCTCCGGTGATTGTGGAGCCCCCTGCAGACCTCAAT  1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ACATTGGAGAGCTCGACCAGAATTACTTCACATGCTATGCTCCGGTGATTGTGGAGCCCCCTGCAGACCTCAAT  2072

Query 1081  GTCACTGAAGGCATGGCAGCTGAGCTGAAATGTCGGGCCTCCACATCCCTGACATCTGTATCTTGGATTACTCC  1154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GTCACTGAAGGCATGGCAGCTGAGCTGAAATGTCGGGCCTCCACATCCCTGACATCTGTATCTTGGATTACTCC  2146

Query 1155  AAATGGAACAGTCATGACACATGGGGCGTACAAAGTGCGGATAGCTGTGCTCAGTGATGGTACGTTAAATTTCA  1228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AAATGGAACAGTCATGACACATGGGGCGTACAAAGTGCGGATAGCTGTGCTCAGTGATGGTACGTTAAATTTCA  2220

Query 1229  CAAATGTAACTGTGCAAGATACAGGCATGTACACATGTATGGTGAGTAATTCCGTTGGGAATACTACTGCTTCA  1302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CAAATGTAACTGTGCAAGATACAGGCATGTACACATGTATGGTGAGTAATTCCGTTGGGAATACTACTGCTTCA  2294

Query 1303  GCCACCCTGAATGTTACTGCAGCAACCACTACTCCTTTCTCTTACTTTTCAACCGTCACAGTAGAGACTATGGA  1376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GCCACCCTGAATGTTACTGCAGCAACCACTACTCCTTTCTCTTACTTTTCAACCGTCACAGTAGAGACTATGGA  2368

Query 1377  ACCGTCTCAGGATGAGGCACGGACCACAGATAACAATGTGGGTCCCACTCCAGTGGTCGACTGGGAGACCACCA  1450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  ACCGTCTCAGGATGAGGCACGGACCACAGATAACAATGTGGGTCCCACTCCAGTGGTCGACTGGGAGACCACCA  2442

Query 1451  ATGTGACCACCTCTCTCACACCACAGAGCACAAGGTCGACAGAGAAAACCTTCACCATCCCAGTGACTGATATA  1524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  ATGTGACCACCTCTCTCACACCACAGAGCACAAGGTCGACAGAGAAAACCTTCACCATCCCAGTGACTGATATA  2516

Query 1525  AACAGTGGGATCCCAGGAATTGATGAGGTCATGAAGACTACCAAAATCATCATTGGGTGTTTTGTGGCCATCAC  1598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  AACAGTGGGATCCCAGGAATTGATGAGGTCATGAAGACTACCAAAATCATCATTGGGTGTTTTGTGGCCATCAC  2590

Query 1599  ACTCATGGCTGCAGTGATGCTGGTCATTTTCTACAAGATGAGGAAGCAGCACCATCGGCAAAACCATCACGCCC  1672
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  ACTCATGGCTGCAGTGATGCTGGTCATTTTCTACAAGATGAGGAAGCAGCACCATCGGCAAAACCATCACGCCC  2664

Query 1673  CAACAAGGACTGTTGAAATTATTAATGTGGATGATGAGATTACGGGAGACACACCCATGGAAAGCCACCTGCCC  1746
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CAACAAGGACTGTTGAAATTATTAATGTGGATGATGAGATTACGGGAGACACACCCATGGAAAGCCACCTGCCC  2738

Query 1747  ATGCCTGCTATCGAGCATGAGCACCTAAATCACTATAACTCATACAAATCTCCCTTCAACCACACAACAACAGT  1820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  ATGCCTGCTATCGAGCATGAGCACCTAAATCACTATAACTCATACAAATCTCCCTTCAACCACACAACAACAGT  2812

Query 1821  TAACACAATAAATTCAATACACAGTTCAGTGCATGAACCGTTATTGATCCGAATGAACTCTAAAGACAATGTAC  1894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  TAACACAATAAATTCAATACACAGTTCAGTGCATGAACCGTTATTGATCCGAATGAACTCTAAAGACAATGTAC  2886

Query 1895  AAGAGACTCAAATC------------------------------------------------------------  1908
            ||||||||||||||                                                            
Sbjct 2887  AAGAGACTCAAATCTAAAACATTTACAGAGTTACAAAAAACAAACAATCAAAAAAAAAGACAGTTTATTAAAAA  2960

Query 1909  --------------------------------------------------------------------------  1908
                                                                                      
Sbjct 2961  TGACACAAATGACTGGGCTAAATCTACTGTTTCAAAAAAGTGTCTTTACAAAAAAACAAAAAAGAAAAGAAATT  3034

Query 1909  ----------------------------------------  1908
                                                    
Sbjct 3035  TATTTATTAAAAATTCTATTGTGATCTAAAGCAGACAAAA  3074