Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10476
• Subject: NM_001286808.2
• Aligned Length: 1399
• Identities: 1314
• Gaps: 80

Alignment

Query    1  ---ATGGAAGAGAGTGGAATAGAGACAACACCACCTGGGACTCCTCCACCAAATCCTGCAGGGCTGGCTGCTAC  71
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGGAAGAGAGTGGAATAGAGACAACACCACCTGGGACTCCTCCACCAAATCCTGCAGGGCTGGCTGCTAC  74

Query   72  TGCTATGTCTTCTACCCCTGTTCCATTAGCGGCAACCAGTTCTTTTTCTTCTCCAAATGTATCCTCCATGGAGT  145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCTATGTCTTCTACCCCTGTTCCATTAGCGGCAACCAGTTCTTTTTCTTCTCCAAATGTATCCTCCATGGAGT  148

Query  146  CCTTCCCACCACTCGCATACTCTACTCCTCAGCCGCCCCTTCCTCCTGTGAGGCCTTCAGCACCATTACCTTTT  219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTTCCCACCACTCGCATACTCTACTCCTCAGCCGCCCCTTCCTCCTGTGAGGCCTTCAGCACCATTACCTTTT  222

Query  220  GTGCCTCCTCCTGCAGTTCCTTCTGTCCCACCACTTGTTACTTCTATGCCACCTCCTGTTTCTCCATCAACTGC  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTGCCTCCTCCTGCAGTTCCTTCTGTCCCACCACTTGTTACTTCTATGCCACCTCCTGTTTCTCCATCAACTGC  296

Query  294  TGCTGCCTTCGGTAATCCTCCTGTATCTCACTTCCCACCTTCAACTTCTGCCCCAAACACTCTTTTACCTGCAC  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCTGCCTTCGGTAATCCTCCTGTATCTCACTTCCCACCTTCAACTTCTGCCCCAAACACTCTTTTACCTGCAC  370

Query  368  CCCCTTCGGGTCCTCCTATATCAGGATTTTCTGTTGGTTCAACTTATGACATTACAAGGGGACATGCTGGGAGA  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCCTTCGGGTCCTCCTATATCAGGATTTTCTGTTGGTTCAACTTATGACATTACAAGGGGACATGCTGGGAGA  444

Query  442  GCTCCCCAGACACCCCTGATGCCATCATTTTCTGCACCTTCAGGAACAGGTCTTTTGCCAACTCCTATTACTCA  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCTCCCCAGACACCCCTGATGCCATCATTTTCTGCACCTTCAGGAACAGGTCTTTTGCCAACTCCTATTACTCA  518

Query  516  GCAAGCCAGTTTGACATCTCTGGCACAGGGAACTGGAACCACATCAGCCATTACTTTCCCAGAGGAGCAAGAAG  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCAAGCCAGTTTGACATCTCTGGCACAGGGAACTGGAACCACATCAGCCATTACTTTCCCAGAGGAGCAAGAAG  592

Query  590  ACCCTAGAATTACTAGAGGTCAGGATGAAGCATCTGCTGGTGGAATCTGGGGTTTTATTAAGGGTGTGGCTGGG  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCCTAGAATTACTAGAGGTCAGGATGAAGCATCTGCTGGTGGAATCTGGGGTTTTATTAAGGGTGTGGCTGGG  666

Query  664  AATCCTATGGTGAAGTCTGTGCTTGATAAGACAAAACATTCAGTAGAAAGCATGATTACAACGCTGGACCCTGG  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATCCTATGGTGAAGTCTGTGCTTGATAAGACAAAACATTCAGTAGAAAGCATGATTACAACGCTGGACCCTGG  740

Query  738  CATGGCTCCCTATATCAAATCTGGAGGTGAACTGGATATTGTAGTGACCTCAAATAAAGAAGTAAAAGTTGCTG  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATGGCTCCCTATATCAAATCTGGAGGTGAACTGGATATTGTAGTGACCTCAAATAAAGAAGTAAAAGTTGCTG  814

Query  812  CTGTCCGAGATGCCTTCCAGGAGGTCTTTGGCTTAGCTGTGGTTGTAGGGGAAGCTGGACAGTCCAATATTGCC  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGTCCGAGATGCCTTCCAGGAGGTCTTTGGCTTAGCTGTGGTTGTAGGGGAAGCTGGACAGTCCAATATTGCC  888

Query  886  CCACAACCAGTGGGCTATGCAGCTGGATTAAAAGGTGCTCAGGAACGGATAGATAGCTTGCGTCGAACTGGGGT  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCACAACCAGTGGGCTATGCAGCTGGATTAAAAGGTGCTCAGGAACGGATAGATAGCTTGCGTCGAACTGGGGT  962

Query  960  GATCCATGAAAAACAGACAGCTGTGTCAGTAGAAAACTTCATTGCAGAATTGCTGCCTGACAAATGGTTTGACA  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GATCCATGAAAAACAGACAGCTGTGTCAGTAGAAAACTTCATTGCAGAATTGCTGCCTGACAAATGGTTTGACA  1036

Query 1034  TTGGTTGTTTGGTGGTTGAAGATCCTGTCCATGGCATTCATCTAGAAACATTTACACAAGCCACACCAGTGCCT  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGGTTGTTTGGTGGTTGAAGATCCTGTCCATGGCATTCATCTAGAAACATTTACACAAGCCACACCAGTGCCT  1110

Query 1108  TTGGAATTTGTACAGCAGGCTCAAAGTCTAACTCCCCAGGACTATAATCTGAGGTGGTCAGGCCTTTTGGTGAC  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTGGAATTTGTACAGCAGGCTCAAAGTCTAACTCCCCAGGACTATAATCTGAGGTGGTCAGGCCTTTTGGTGAC  1184

Query 1182  AGTGGGTGAAGTCCTGGAAAAGAGTTTACTGAATGTCAGCCGGACTGATTGGCACATGGCATTTACTGGGATGT  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGTGGGTGAAGTCCTGGAAAAGAGTTTACTGAATGTCAGCCGGACTGATTGGCACATGGCATTTACTGGGATGT  1258

Query 1256  CCCGTCGGCAGATGATCTACAGTGCAGCCAGAGCGATAGCAGGCATG----------TATAAACAGCGCCTGCC  1319
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |.|||          ||.||.|          
Sbjct 1259  CCCGTCGGCAGATGATCTACAGTGCAGCCAGAGCGATAGC--GGATGATTATTTTCCTAGAATC----------  1320

Query 1320  ACCC--AGGACAGTG----------------------------------------------------  1332
             |||  ||..|||||                                                    
Sbjct 1321  -CCCAAAGAGCAGTGGCAGTCCATGGCTTGGTTGAAGCTAGAAATTTTCCTGCCCCTGGTGACCTGG  1386