Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10479
• Subject: XM_006511550.3
• Aligned Length: 1095
• Identities: 955
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGCATCTAAGGCGAGTTAGAACCATGCCCCGACACAGCCAGTCCCTGACAATGGCACCATACTCATCTGTAAG  74
            |||||||||||||||||.|..|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||
Sbjct    1  ATGCATCTAAGGCGAGTGAAGACCATGCCCCGACACAGCCAGTCCCTGACCATGGCGCCGTACTCTTCTGTGAG  74

Query   75  CCTCGTGGAGCAGCTGGAAGACAGGATCCTCTGCCATGAGAAAACCACCGCCGCCCTCGTAGAGCACGCCTTTC  148
            .||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.|
Sbjct   75  TCTGGTGGAGCAGCTGGAAGACAGGATCCTCTGTCATGAGAAAACCACAGCAGCACTGGTGGAGCATGCCTTCC  148

Query  149  GGATTAAAGATGACATTGTCAACAGTTTGCAGAAAATGCAAAACAAAGGGGGAGGTGACCGCTTGGCCAGGCTT  222
            |.||.|||||||||||.||||.||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  149  GCATCAAAGATGACATCGTCAGCAGTTTGCAGAAGATGCAGAATAAAGGGGGAGGTGACCGCTTAGCCAGGCTG  222

Query  223  TTCTTGGAGGAGCATATCAGAAACATAACTGCCATAGTGAAGCAACTTAATCGGGATATCGAGGTACTCCAGGA  296
            ||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  223  TTCTTGGAAGAGCATATCAGAAACATAACCGCCATTGTGAAGCAACTGAATCGGGATATTGAGGTTCTCCAGGA  296

Query  297  GCAGATTCGTGCTCGGGACAACATTAGCTATGGAACTAATTCTGCCTTAAAGACCCTGGAGATGCGCCAGCTCT  370
            ||||||.|||||..||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAGATCCGTGCCAGGGACAACATCAGCTATGGAACTAATTCTGCCTTAAAGACGCTGGAGATGCGCCAGCTCT  370

Query  371  CCGGTTTGGGAGATCTTCGAGGAAGAGTGGCAAGATGTGATGCCAGCATAGCTAGACTTTCTGCAGAGCACAAA  444
            |.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.
Sbjct  371  CTGGCTTGGGAGATCTCCGAGGAAGAGTTGCAAGGTGCGACGCCAGCATAGCCAGGCTCTCTGCCGAGCATAAG  444

Query  445  ACGACCTATGAGGGGCTCCAGCACTTGAACAAAGAACAGCAGGCTGCCAAACTTATCTTGGAAACGAAAATCAA  518
            .|||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.||||||||
Sbjct  445  TCGACCTACGAGGGACTCCAGCACTTGAACAAGGAACAGCAAGCAGCCAAGCTTATCCTGGAAACAAAAATCAA  518

Query  519  AGATGCAGAGGGACAGATTTCTCAGCTTTTGAACAGAGTGGACTTGTCAATATCAGAGCAGAGCACCAAACTGA  592
            |||.|||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGACGCAGAAGGACAGATTTCTCAGCTTTTGAGCAGAGTGGACTTGTCCATCTCAGAGCAGAGCACCAAACTGA  592

Query  593  AGATGTCTCACAGAGACAGTAACCACCAGCTTCAGCTTTTGGACACTAAATTTAAAGGTACAGTTGAGGAACTC  666
            |||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct  593  AGATGTCCCACAGGGACAGCAACCACCAGCTCCAGCTCCTGGACACTAAATTTAAAGGCACCGTTGAAGAGCTC  666

Query  667  AGTAACCAGATATTATCTGCACGGAGTTGGTTGCAACAGGAACAAGAACGGATAGAAAAAGAGCTTTTACAGAA  740
            ||.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||.|.|||||
Sbjct  667  AGCAACCAGATTTTGTCTGCACGGAGTTGGCTGCAACAAGAACAGGAGCGGATAGAGAAAGAACTTCTGCAGAA  740

Query  741  AATTGATCAGCTTTCCTTGATTGTTAAGGAAAACAGTGGAGCCAGTGAAAGGGATATGGAGAAGAAGCTCAGCC  814
            |||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||..|.||||||||.|||||||
Sbjct  741  AATAGACCATCTCTCCTTGATTGTTAAGGAAAACAGTGGAGCCAATGAAAGAGACGTAGAGAAGAAACTCAGCC  814

Query  815  AGATGTCAGCCAGGCTTGACAAAATAGAAGAGGGTCAAAAGAAGACTTTTGATGGTCAGAGAACAAGGCAAGAA  888
            |||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.||||.||.|..|||.||.|||||   ||.||..||.
Sbjct  815  AGATGTCGGCCAGGCTTGACAAAATCGAAGAGAGTCAGAAGAGGAATGCTGAAGGACAGAG---AAAGCCGGAC  885

Query  889  GAGGAGAAGATGCACGGGCGAATCACCAAGCTGGAGTTACAGATGAACCAGAACATCAAGGAAATGAAAGCAGA  962
            |||||||||.||||||||||.||||.||||||||||.|||||||||...||.||||.|||||.||||||||.||
Sbjct  886  GAGGAGAAGGTGCACGGGCGGATCAGCAAGCTGGAGCTACAGATGACGGAGGACATGAAGGAGATGAAAGCGGA  959

Query  963  AGTTAATGCTGGGTTTACAGCCGTCTATGAAAGCATAGGATCCATCAGGCAAGTTCTCGAGGCCAAGATGAAGC  1036
            .||||||||.|||||..|||||.|||||||.||||||||.|||.||||.|||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  960  GGTTAATGCCGGGTTCTCAGCCATCTATGAGAGCATAGGGTCCCTCAGACAAGTGCTGGAGGCCAAGATGAAGC  1033

Query 1037  TGGACAGGGACCAGCTACAGAAGCAAATCCAGCTGATGCAGAAGCCAGAGACCCCCATG  1095
            |||||||||||||.||.||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1034  TGGACAGGGACCAACTTCAGAAGCAGATCCAGCAGATGCAGAAGCCAGAGACCGCCATG  1092