Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_10548
- Subject:
- NM_130768.3
- Aligned Length:
- 1426
- Identities:
- 1174
- Gaps:
- 248
Alignment
Query 1 ATGGCGGCGAGCGCGCTGCGAGGCCTGCCAGTGGCTGGCGGAGGCGAGAGTAGCGAGAGCGAGGATGATGGCTG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGCGAGCGCGCTGCGAGGCCTGCCAGTGGCTGGCGGAGGCGAGAGTAGCGAGAGCGAGGATGATGGCTG 74
Query 75 GGAGATTGGGTATCTCGACCGGACGTCTCAGAAATTGAAAAGGCTATTACCCATTGAAGAAAAGAAAGAAAAAT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGAGATTGGGTATCTCGACCGGACGTCTCAGAAATTGAAAAGGCTATTACCCATTGAAGAAAAGAAAGAAAAAT 148
Query 149 TTAAGAAAGCAATGACCATCGGAGATGTTTCATTGGTCCAGGAGCTCCTAGATTCTGGCATTAGTGTAGATTCC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTAAGAAAGCAATGACCATCGGAGATGTTTCATTGGTCCAGGAGCTCCTAGATTCTGGCATTAGTGTAGATTCC 222
Query 223 AACTTTCAGTATGGATGGACTCCCCTTATGTATGCTGCTAGTGTTGCCAATGCAGAGCTGGTTCGGGTCCTTTT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AACTTTCAGTATGGATGGACTCCCCTTATGTATGCTGCTAGTGTTGCCAATGCAGAGCTGGTTCGGGTCCTTTT 296
Query 297 GGACAGAGGTGCTAATGCAAGCTTTGAGAAGGATAAGCAAAGTATTTTGATAACTGCATGTTCTGCTCATGGCT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGACAGAGGTGCTAATGCAAGCTTTGAGAAGGATAAGCAAAGTATTTTGATAACTGCATGTTCTGCTCATGGCT 370
Query 371 CAGAGGAACAGATCTTGAAGTGTGTAGAACTACTACTTTCAAGAAATGCTGATCCAAATGTTGCTTGTAGGAGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CAGAGGAACAGATCTTGAAGTGTGTAGAACTACTACTTTCAAGAAATGCTGATCCAAATGTTGCTTGTAGGAGA 444
Query 445 CTTATGACCCCAATCATGTATGCTGCTCGAGATGGTCACACCCAGGTTGTTGCTCTCCTTGTTGCTCATGGAGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTTATGACCCCAATCATGTATGCTGCTCGAGATGGTCACACCCAGGTTGTTGCTCTCCTTGTTGCTCATGGAGC 518
Query 519 AGAAGTTAATACCCAGGATGAGAATGGTTACACTGCTTTAACGTGGGCAGCACGTCAGGGTCATAAAAATATAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGAAGTTAATACCCAGGATGAGAATGGTTACACTGCTTTAACGTGGGCAGCACGTCAGGGTCATAAAAATATAG 592
Query 593 TTTTGAAGTTGCTTGAACTTGGAGCTAATAAAATGCTACAAACCAAAGATGGAAAGATGCCAAGTGAGATTGCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTTTGAAGTTGCTTGAACTTGGAGCTAATAAAATGCTACAAACCAAAGATGGAAAGATGCCAAGTGAGATTGCA 666
Query 667 AAAAGAAACAAACATCATGAGATCTTCAACTTACTTTCTTTTACTTTAAATCCATTGGAAGGAAAACTTCAACA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAAAGAAACAAACATCATGAGATCTTCAACTTACTTTCTTTTACTTTAAATCCATTGGAAGGAAAACTTCAACA 740
Query 741 GCTAACTAAAGAAGACACTATTTGTAAAATATTGACAACAGATTCTGATAGAGAAAAAGATCACATTTTTAGTT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCTAACTAAAGAAGACACTATTTGTAAAATATTGACAACAGATTCTGATAGAGAAAAAGATCACATTTTTAGTT 814
Query 815 CATATACAGCATTTGGAGATCTGGAAGTATTTTTACATGGTCTTGGACTTGAACATATGACAGATTTACTAAAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CATATACAGCATTTGGAGATCTGGAAGTATTTTTACATGGTCTTGGACTTGAACATATGACAGATTTACTAAAG 888
Query 889 GAAAGGGATATAACGTTAAGACATCTTTTGACCATGAGGGAAGATGAATTTACAAAGAATGGAATTACCAGTAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAAAGGGATATAACGTTAAGACATCTTTTGACCATGAGGGAAGATGAATTTACAAAGAATGGAATTACCAGTAA 962
Query 963 AGACCAGCAGAAAATTCTGGCTGCTCTTAAAGAACTACAGGTAGAAGAGATACAATTTGGAGAGCTATCTGAAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGACCAGCAGAAAATTCTGGCTGCTCTTAAAGAACTACAGGTAGAAGAGATACAATTTGGAGAGCTATCTGAAG 1036
Query 1037 AGACAAAGTTGGAAATCAGTGGTGATGAGTTCCTCAACTTTCTTCTCAAATTAAATAAACAGTGTGGCCATTTA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGACAAAGTTGGAAATCAGTGGTGATGAGTTCCTCAACTTTCTTCTCAAATTAAATAAACAGTGTGGCCATTTA 1110
Query 1111 ATAACAGCTGTACAGAATGTTATTACTGAGTTACCTGTAAATTCTCAAAAGGTA--------------TTCT-- 1168
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|| ||||
Sbjct 1111 ATAACAGCTGTACAGAATGTTATTACTGAGTTACCTGTAAATTCTCAAAAGATAACACTGGAATGGGCTTCTCC 1184
Query 1169 ACAAAAGTTAT--------------------------------------------------------------- 1179
.||.|| ||.|
Sbjct 1185 CCAGAA-TTTTACTTCAGTTTGTGAAGAATTGGTTAATAATGTTGAAGATTTGAGTGAAAAGGTCTGCAAACTA 1257
Query 1180 -------------------------------------------------------------------------- 1179
Sbjct 1258 AAAGACCTAATTCAAAAGTTGCAAAATGAACGGGAAAATGATCCAACTCATATACAATTAAGGGAAGAAGTATC 1331
Query 1180 -------------------------------------------------------------------------- 1179
Sbjct 1332 TACATGGAATAGTAGAATTTTGAAGAGGACAGCTATTACCATATGCGGATTCGGTTTTCTTCTTTTCATTTGCA 1405
Query 1180 -------------------- 1179
Sbjct 1406 AGCTAACTTTCCAGAGGAAA 1425