Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10748
• Subject: NM_001346547.2
• Aligned Length: 1878
• Identities: 1559
• Gaps: 318

Alignment

Query    1  ATGTTAGCCTTCGCTGCCAGGACCGTGGTGAAGCCTCTGGGCTTCCTGAAGCCCTTCTCCTTGATGAAGGCTTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTAGCCTTCGCTGCCAGGACCGTGGTGAAGCCTCTGGGCTTCCTGAAGCCCTTCTCCTTGATGAAGGCTTC  74

Query   75  CAGCCGCTTCAAGGCACACCAGGATGCACTGCCACGGCTGCCCGTGCCCCCTCTCCAGCAGTCCCTGGACCACT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGCCGCTTCAAGGCACACCAGGATGCACTGCCACGGCTGCCCGTGCCCCCTCTCCAGCAGTCCCTGGACCACT  148

Query  149  ACCTGAAGGCGCTGCAGCCCATCGTGAGTGAGGAGGAGTGGGCCCACACCAAGCAGCTGGTGGATGAGTTTCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCTGAAGGCGCTGCAGCCCATCGTGAGTGAGGAGGAGTGGGCCCACACCAAGCAGCTGGTGGATGAGTTTCAG  222

Query  223  GCCTCAGGAGGTGTAGGGGAGCGCCTGCAGAAGGGGCTGGAGCGTCGGGCCAGGAAGACGGAGAACTGGCTGTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCTCAGGAGGTGTAGGGGAGCGCCTGCAGAAGGGGCTGGAGCGTCGGGCCAGGAAGACGGAGAACTGGCTGTC  296

Query  297  TGAGTGGTGGCTCAAGACCGCCTACCTCCAGTACCGCCAGCCTGTGGTCATCTACTCGAGCCCAGGCGTGATGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAGTGGTGGCTCAAGACCGCCTACCTCCAGTACCGCCAGCCTGTGGTCATCTACTCGAGCCCAGGCGTGATGC  370

Query  371  TACCCAAGCAGGACTTCGTGGACCTGCAGGGTCAGCTCCGATTTGCTGCCAAACTCATTGAGGGTGTGTTGGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TACCCAAGCAGGACTTCGTGGACCTGCAGGGTCAGCTCCGATTTGCTGCCAAACTCATTGAGGGTGTGTTGGAT  444

Query  445  TTCAAGGTCATGATTGACAACGAGACCCTGCCCGTGGAGTACCTGGGGGGGAAGCCACTGTGCATGAACCAGTA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTCAAGGTCATGATTGACAACGAGACCCTGCCCGTGGAGTACCTGGGGGGGAAGCCACTGTGCATGAACCAGTA  518

Query  519  CTATCAGATCTTGTCCTCCTGCCGAGTGCCGGGCCCCAAGCAGGACACAGTCAGCAACTTCAGCAAGACCAAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTATCAGATCTTGTCCTCCTGCCGAGTGCCGGGCCCCAAGCAGGACACAGTCAGCAACTTCAGCAAGACCAAGA  592

Query  593  AGCCTCCCACGCACATCACCGTGGTACACAACTACCAGTTTTTTGAGCTGGATGTGTACCACAGTGACGGGACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCCTCCCACGCACATCACCGTGGTACACAACTACCAGTTTTTTGAGCTGGATGTGTACCACAGTGACGGGACA  666

Query  667  CCCCTCACTGCGGATCAGATCTTTGTGCAGCTGGAGAAGATCTGGAACTCATCCCTACAGACCAACAAGGAGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCCTCACTGCGGATCAGATCTTTGTGCAGCTGGAGAAGATCTGGAACTCATCCCTACAGACCAACAAGGAGCC  740

Query  741  TGTGGGCATCCTCACCTCCAACCACCGCAACTCCTGGGCCAAGGCATACAACACCCTCATCAAAGACAAGGTGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTGGGCATCCTCACCTCCAACCACCGCAACTCCTGGGCCAAGGCATACAACACCCTCATCAAAGACAAGGTGA  814

Query  815  ACCGGGATTCCGTGCGCTCCATCCA-------------------------------------------------  839
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct  815  ACCGGGATTCCGTGCGCTCCATCCAGAAGAGCATCTTCACCGTGTGCCTAGATGCAACCATGCCCAGGGTCTCA  888

Query  840  --------------------------------------------------------------------------  839
                                                                                      
Sbjct  889  GAAGACGTGTACCGCAGCCACGTGGCAGGCCAGATGCTGCATGGGGGCGGCAGCAGGCTCAACAGCGGCAACCG  962

Query  840  --------------------------------------------------------------------------  839
                                                                                      
Sbjct  963  CTGGTTCGACAAGACGCTGCAGTTCATCGTGGCAGAAGATGGCTCCTGTGGGCTTGTGTACGAGCATGCTGCAG  1036

Query  840  -------------------------------------------------GAAGAAACCCGAGCTTGTGCGGTCT  864
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CGGAGGGGCCCCCTATTGTCACCCTTCTGGACTATGTCATCGAGTACACGAAGAAACCCGAGCTTGTGCGGTCT  1110

Query  865  CCCATGGTGCCCCTGCCCATGCCCAAGAAGCTGCGGTTCAACATCACCCCCGAGATCAAGAGCGACATCGAGAA  938
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCCCTGGTGCCCCTGCCCATGCCCAAGAAGCTGCGGTTCAACATCACCCCCGAGATCAAGAGCGACATCGAGAA  1184

Query  939  GGCCAAGCAGAACCTCAGCATCATGATCCAGGACCTGGATATCACCGTGATGGTGTTCCACCATTTTGGAAAAG  1012
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCCAAGCAGAACCTCAGCATCATGATCCAGGACCTGGATATCACCGTGATGGTGTTCCACCATTTTGGAAAAG  1258

Query 1013  ACTTCCCCAAGTCGGAGAAGCTAAGCCCAGATGCCTTCATCCAGATGGCTTTGCAGCTGGCCTACTACAGGATC  1086
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACTTCCCCAAGTCGGAGAAGCTAAGCCCAGATGCCTTCATCCAGATGGCTTTGCAGCTGGCCTACTACAGGATC  1332

Query 1087  TACGGACAGGCATGTGCCACCTATGAAAGTGCCTCCCTGCGCATGTTTCACCTGGGCCGCACCGACACCATCCG  1160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TACGGACAGGCATGTGCCACCTATGAAAGTGCCTCCCTGCGCATGTTTCACCTGGGCCGCACCGACACCATCCG  1406

Query 1161  CTCGGCTTCCATGGACTCACTCACCTTTGTCAAGGCCATGGATGACTCCAGCGTCACGGAGCACCAGAAGGTGG  1234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTCGGCTTCCATGGACTCACTCACCTTTGTCAAGGCCATGGATGACTCCAGCGTCACGGAGCACCAGAAGGTGG  1480

Query 1235  AGCTGCTGCGGAAGGCCGTGCAGGCCCACCGAGGCTACACCGACCGGGCCATCCGCGGGGAGGCCTTTGATCGA  1308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGCTGCTGCGGAAGGCCGTGCAGGCCCACCGAGGCTACACCGACCGGGCCATCCGCGGGGAGGCCTTTGATCGA  1554

Query 1309  CACCTGCTGGGCCTGAAGCTGCAGGCCATCGAGGACCTGGTGAGCATGCCCGACATCTTCATGGACACCTCCTA  1382
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                    
Sbjct 1555  CACCTGCTGGGCCTGAAGCTGCAGGCCATCGAGGACCT------------------------------------  1592

Query 1383  CGCCATCGCCATGCACTTCCACCTCTCCACCAGCCAGGTCCCTGCCAAGACAGACTGTGTCATGTTCTTCGGGC  1456
                                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1593  ------------------------------------GGTCCCTGCCAAGACAGACTGTGTCATGTTCTTCGGGC  1630

Query 1457  CCGTGGTCCCCGACGGCTACGGTGTCTGCTATAACCCCATGGAGGCCCACATCAACTTCTCCCTGTCGGCCTAC  1530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1631  CCGTGGTCCCCGACGGCTACGGTGTCTGCTATAACCCCATGGAGGCCCACATCAACTTCTCCCTGTCGGCCTAC  1704

Query 1531  AACAGCTGCGCGGAGACCAACGCCGCCCGCCTGGCGCATTACCTGGAGAAGGCGCTCCTGGACATGCGTGCCCT  1604
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1705  AACAGCTGCGCGGAGACCAACGCCGCCCGCCTGGCGCATTACCTGGAGAAGGCGCTCCTGGACATGCGTGCCCT  1778

Query 1605  GCTGCAGAGCCACCCCCGGGCCAAGCTC  1632
            ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1779  GCTGCAGAGCCACCCCCGGGCCAAGCTC  1806