Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10748
• Subject: NM_001346549.2
• Aligned Length: 1878
• Identities: 1511
• Gaps: 366

Alignment

Query    1  ATGTTAGCCTTCGCTGCCAGGACCGTGGTGAAGCCTCTGGGCTTCCTGAAGCCCTTCTCCTTGATGAAGGCTTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTAGCCTTCGCTGCCAGGACCGTGGTGAAGCCTCTGGGCTTCCTGAAGCCCTTCTCCTTGATGAAGGCTTC  74

Query   75  CAGCCGCTTCAAGGCACACCAGGATGCACTGCCACGGCTGCCCGTGCCCCCTCTCCAGCAGTCCCTGGACCACT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGCCGCTTCAAGGCACACCAGGATGCACTGCCACGGCTGCCCGTGCCCCCTCTCCAGCAGTCCCTGGACCACT  148

Query  149  ACCTGAAGGCGCTGCAGCCCATCGTGAGTGAGGAGGAGTGGGCCCACACCAAGCAGCTGGTGGATGAGTTTCAG  222
            |||||||||||||||||||||||                                                   
Sbjct  149  ACCTGAAGGCGCTGCAGCCCATC---------------------------------------------------  171

Query  223  GCCTCAGGAGGTGTAGGGGAGCGCCTGCAGAAGGGGCTGGAGCGTCGGGCCAGGAAGACGGAGAACTGGCTGTC  296
                                                                                 |||||
Sbjct  172  ---------------------------------------------------------------------CTGTC  176

Query  297  TGAGTGGTGGCTCAAGACCGCCTACCTCCAGTACCGCCAGCCTGTGGTCATCTACTCGAGCCCAGGCGTGATGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  177  TGAGTGGTGGCTCAAGACCGCCTACCTCCAGTACCGCCAGCCTGTGGTCATCTACTCGAGCCCAGGCGTGATGC  250

Query  371  TACCCAAGCAGGACTTCGTGGACCTGCAGGGTCAGCTCCGATTTGCTGCCAAACTCATTGAGGGTGTGTTGGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  251  TACCCAAGCAGGACTTCGTGGACCTGCAGGGTCAGCTCCGATTTGCTGCCAAACTCATTGAGGGTGTGTTGGAT  324

Query  445  TTCAAGGTCATGATTGACAACGAGACCCTGCCCGTGGAGTACCTGGGGGGGAAGCCACTGTGCATGAACCAGTA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  325  TTCAAGGTCATGATTGACAACGAGACCCTGCCCGTGGAGTACCTGGGGGGGAAGCCACTGTGCATGAACCAGTA  398

Query  519  CTATCAGATCTTGTCCTCCTGCCGAGTGCCGGGCCCCAAGCAGGACACAGTCAGCAACTTCAGCAAGACCAAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  399  CTATCAGATCTTGTCCTCCTGCCGAGTGCCGGGCCCCAAGCAGGACACAGTCAGCAACTTCAGCAAGACCAAGA  472

Query  593  AGCCTCCCACGCACATCACCGTGGTACACAACTACCAGTTTTTTGAGCTGGATGTGTACCACAGTGACGGGACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  473  AGCCTCCCACGCACATCACCGTGGTACACAACTACCAGTTTTTTGAGCTGGATGTGTACCACAGTGACGGGACA  546

Query  667  CCCCTCACTGCGGATCAGATCTTTGTGCAGCTGGAGAAGATCTGGAACTCATCCCTACAGACCAACAAGGAGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  547  CCCCTCACTGCGGATCAGATCTTTGTGCAGCTGGAGAAGATCTGGAACTCATCCCTACAGACCAACAAGGAGCC  620

Query  741  TGTGGGCATCCTCACCTCCAACCACCGCAACTCCTGGGCCAAGGCATACAACACCCTCATCAAAGACAAGGTGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  621  TGTGGGCATCCTCACCTCCAACCACCGCAACTCCTGGGCCAAGGCATACAACACCCTCATCAAAGACAAGGTGA  694

Query  815  ACCGGGATTCCGTGCGCTCCATCCA-------------------------------------------------  839
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct  695  ACCGGGATTCCGTGCGCTCCATCCAGAAGAGCATCTTCACCGTGTGCCTAGATGCAACCATGCCCAGGGTCTCA  768

Query  840  --------------------------------------------------------------------------  839
                                                                                      
Sbjct  769  GAAGACGTGTACCGCAGCCACGTGGCAGGCCAGATGCTGCATGGGGGCGGCAGCAGGCTCAACAGCGGCAACCG  842

Query  840  --------------------------------------------------------------------------  839
                                                                                      
Sbjct  843  CTGGTTCGACAAGACGCTGCAGTTCATCGTGGCAGAAGATGGCTCCTGTGGGCTTGTGTACGAGCATGCTGCAG  916

Query  840  -------------------------------------------------GAAGAAACCCGAGCTTGTGCGGTCT  864
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  917  CGGAGGGGCCCCCTATTGTCACCCTTCTGGACTATGTCATCGAGTACACGAAGAAACCCGAGCTTGTGCGGTCT  990

Query  865  CCCATGGTGCCCCTGCCCATGCCCAAGAAGCTGCGGTTCAACATCACCCCCGAGATCAAGAGCGACATCGAGAA  938
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  991  CCCCTGGTGCCCCTGCCCATGCCCAAGAAGCTGCGGTTCAACATCACCCCCGAGATCAAGAGCGACATCGAGAA  1064

Query  939  GGCCAAGCAGAACCTCAGCATCATGATCCAGGACCTGGATATCACCGTGATGGTGTTCCACCATTTTGGAAAAG  1012
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1065  GGCCAAGCAGAACCTCAGCATCATGATCCAGGACCTGGATATCACCGTGATGGTGTTCCACCATTTTGGAAAAG  1138

Query 1013  ACTTCCCCAAGTCGGAGAAGCTAAGCCCAGATGCCTTCATCCAGATGGCTTTGCAGCTGGCCTACTACAGGATC  1086
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139  ACTTCCCCAAGTCGGAGAAGCTAAGCCCAGATGCCTTCATCCAGATGGCTTTGCAGCTGGCCTACTACAGGATC  1212

Query 1087  TACGGACAGGCATGTGCCACCTATGAAAGTGCCTCCCTGCGCATGTTTCACCTGGGCCGCACCGACACCATCCG  1160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213  TACGGACAGGCATGTGCCACCTATGAAAGTGCCTCCCTGCGCATGTTTCACCTGGGCCGCACCGACACCATCCG  1286

Query 1161  CTCGGCTTCCATGGACTCACTCACCTTTGTCAAGGCCATGGATGACTCCAGCGTCACGGAGCACCAGAAGGTGG  1234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1287  CTCGGCTTCCATGGACTCACTCACCTTTGTCAAGGCCATGGATGACTCCAGCGTCACGGAGCACCAGAAGGTGG  1360

Query 1235  AGCTGCTGCGGAAGGCCGTGCAGGCCCACCGAGGCTACACCGACCGGGCCATCCGCGGGGAGGCCTTTGATCGA  1308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1361  AGCTGCTGCGGAAGGCCGTGCAGGCCCACCGAGGCTACACCGACCGGGCCATCCGCGGGGAGGCCTTTGATCGA  1434

Query 1309  CACCTGCTGGGCCTGAAGCTGCAGGCCATCGAGGACCTGGTGAGCATGCCCGACATCTTCATGGACACCTCCTA  1382
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435  CACCTGCTGGGCCTGAAGCTGCAGGCCATCGAGGACCTGGTGAGCATGCCCGACATCTTCATGGACACCTCCTA  1508

Query 1383  CGCCATCGCCATGCACTTCCACCTCTCCACCAGCCAGGTCCCTGCCAAGACAGACTGTGTCATGTTCTTCGGGC  1456
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1509  CGCCATCGCCATGCACTTCCACCTCTCCACCAGCCAGGTCCCTGCCAAGACAGACTGTGTCATGTTCTTCGGGC  1582

Query 1457  CCGTGGTCCCCGACGGCTACGGTGTCTGCTATAACCCCATGGAGGCCCACATCAACTTCTCCCTGTCGGCCTAC  1530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1583  CCGTGGTCCCCGACGGCTACGGTGTCTGCTATAACCCCATGGAGGCCCACATCAACTTCTCCCTGTCGGCCTAC  1656

Query 1531  AACAGCTGCGCGGAGACCAACGCCGCCCGCCTGGCGCATTACCTGGAGAAGGCGCTCCTGGACATGCGTGCCCT  1604
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1657  AACAGCTGCGCGGAGACCAACGCCGCCCGCCTGGCGCATTACCTGGAGAAGGCGCTCCTGGACATGCGTGCCCT  1730

Query 1605  GCTGCAGAGCCACCCCCGGGCCAAGCTC  1632
            ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1731  GCTGCAGAGCCACCCCCGGGCCAAGCTC  1758