Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10748
• Subject: NM_007760.3
• Aligned Length: 1881
• Identities: 1424
• Gaps: 252

Alignment

Query    1  ATGTTAGCCTTCGCTGCCAGGACCGTGGTGAAGCCTCTGGGCTTCCTGAAGCCCTTCTCCTTGATGAAGGCTTC  74
            |||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||.||||.|||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct    1  ATGTTAGCCTTTGCTGCCAGAACCGTGGTAAAACCCCTGGGCCTCCTCAAGCCCTCCTCCTTGATGAAGGTTTC  74

Query   75  CAGCCGCTTCAAGGCACACCAGGATGCACTGCCACGGCTGCCCGTGCCCCCTCTCCAGCAGTCCCTGGACCACT  148
            ..|.|||||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||.|.|
Sbjct   75  TGGTCGCTTCAAGGCCCACCAAGATGCACTGCCAAGGCTGCCTGTGCCCCCACTTCAGCAATCCCTGGACTATT  148

Query  149  ACCTGAAGGCGCTGCAGCCCATCGTGAGTGAGGAGGAGTGGGCCCACACCAAGCAGCTGGTGGATGAGTTTCAG  222
            ||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCTCAAGGCACTGCAGCCCATCGTGAGTGAGGAAGAATGGGCTCACACCAAGCAACTGGTGGATGAGTTTCAG  222

Query  223  GCCTCAGGAGGTGTAGGGGAGCGCCTGCAGAAGGGGCTGGAGCGTCGGGCCAGGAAGACGGAGAACTGGCTGTC  296
            .|||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||..||||||.|||.|.|||||||||||||||
Sbjct  223  ACCTCAGGGGGCGTAGGGGAACGCCTACAGAAGGGACTGGAGCGCAGGGCCAAGAAAATGGAGAACTGGCTGTC  296

Query  297  TGAGTGGTGGCTCAAGACCGCCTACCTCCAGTACCGCCAGCCTGTGGTCATCTACTCGAGCCCAGGCGTGATGC  370
            .|||||||||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct  297  CGAGTGGTGGCTCAAGACAGCCTATCTCCAGTTCCGCCAGCCTGTGGTCATCTACTCCAGCCCAGGAGTGATCC  370

Query  371  TACCCAAGCAGGACTTCGTGGACCTGCAGGGTCAGCTCCGATTTGCTGCCAAACTCATTGAGGGTGTGTTGGAT  444
            |.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  371  TGCCCAAGCAGGACTTTGTGGATCTACAGGGTCAGCTTCGGTTTGCTGCCAAACTCATCGAGGGTGTATTGGAT  444

Query  445  TTCAAGGTCATGATTGACAACGAGACCCTGCCCGTGGAGTACCTGGGGGGGAAGCCACTGTGCATGAACCAGTA  518
            ||||||..||||||||||||.|||||.|||||.||.||||.||||||.||..||||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  TTCAAGTCCATGATTGACAATGAGACGCTGCCAGTTGAGTTCCTGGGAGGACAGCCGCTGTGCATGAACCAGTA  518

Query  519  CTATCAGATCTTGTCCTCCTGCCGAGTGCCGGGCCCCAAGCAGGACACAGTCAGCAACTTCAGCAAGACCAAGA  592
            .|||||||||.||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||.||||....||||||...|||.|.||||
Sbjct  519  TTATCAGATCCTGTCTTCTTGCCGTGTGCCCGGCCCCAAGCAGGACTCAGTGGTGAACTTCTTAAAGTCAAAGA  592

Query  593  AGCCTCCCACGCACATCACCGTGGTACACAACTACCAGTTTTTTGAGCTGGATGTGTACCACAGTGACGGGACA  666
            ..||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  593  GACCACCCACGCATATAACCGTGGTGCATAACTACCAGTTCTTCGAGCTGGATGTGTACCACAGTGACGGAACA  666

Query  667  CCCCTCACTGCGGATCAGATCTTTGTGCAGCTGGAGAAGATCTGGAACTCATCCCTACAGACCAACAAGGAGCC  740
            ||.|||||..|.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||..|||||||.|||||
Sbjct  667  CCGCTCACCTCAGATCAGATCTTTGTGCAGCTAGAGAAAATATGGAATTCCTCACTGCAATCCAACAAAGAGCC  740

Query  741  TGTGGGCATCCTCACCTCCAACCACCGCAACTCCTGGGCCAAGGCATACAACACCCTCATCAAAGACAAGGTGA  814
            |||.||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||.||||||.||||||||.||.|
Sbjct  741  TGTTGGCATCCTAACCTCCAACCACCGAAACACCTGGGCCAAGGCCTACAACAACCTCATTAAAGACAAAGTTA  814

Query  815  ACCGGGATTCCGTGCGCTCCATCCAGAAG---------------------------------------------  843
            ||||.||.||.|||..||||||.||||||                                             
Sbjct  815  ACCGAGAGTCAGTGAACTCCATACAGAAGAGCATCTTCACCGTGTGCCTGGACAAGCAAGTGCCTAGAGTCTCA  888

Query  844  --------------------------------------------------------------------------  843
                                                                                      
Sbjct  889  GATGATGTCTACCGAAACCACGTAGCAGGCCAGATGCTACATGGTGGTGGTAGCAAGTTCAACAGTGGCAACCG  962

Query  844  --------------------------------------------------------------------------  843
                                                                                      
Sbjct  963  CTGGTTTGACAAGACACTGCAGTTCATCGTGGCAGAAGACGGCTCCTGTGGGATGGTGTATGAGCATGCAGCTG  1036

Query  844  -----------------------------------------------------AAACCCGAGCTTGTGCGGTCT  864
                                                                 ||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGAAGGGCCCCCCATAGTTGCACTTGTGGACCATGTCATGGAGTATACAAAAAAGCCTGAGCTTGTGCGGTCT  1110

Query  865  CCCATGGTGCCCCTGCCCATGCCCAAGAAGCTGCGGTTCAACATCACCCCCGAGATCAAGAGCGACATCGAGAA  938
            ||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||.||||||.|||||
Sbjct 1111  CCTATGGTGCCCTTGCCAATGCCCAAGAAGCTGCGGTTCAACATCACACCTGAGATCAAGAACGACATAGAGAA  1184

Query  939  GGCCAAGCAGAACCTCAGCATCATGATCCAGGACCTGGATATCACCGTGATGGT---GTTCCACCATTTTGGAA  1009
            .|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||   |||||.|   ||||||.||.|||||||
Sbjct 1185  AGCCAAACAGAACCTCAGCATCATGATCCAGGACCTGGACATCA---TGATGCTGACGTTCCATCACTTTGGAA  1255

Query 1010  AAGACTTCCCCAAGTCGGAGAAGCTAAGCCCAGATGCCTTCATCCAGATGGCTTTGCAGCTGGCCTACTACAGG  1083
            |.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||..||||||||||.|||||||||
Sbjct 1256  AGGACTTCCCCAAGTCCGAGAAGCTAAGCCCTGATGCCTTCATCCAGGTAGCCCTGCAGCTGGCATACTACAGG  1329

Query 1084  ATCTACGGACAGGCATGTGCCACCTATGAAAGTGCCTCCCTGCGCATGTTTCACCTGGGCCGCACCGACACCAT  1157
            |||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1330  ATCTATGGGCAGGCGTGTGCCACGTATGAAAGTGCCTCTCTGCGCATGTTTCACCTGGGCCGCACTGACACCAT  1403

Query 1158  CCGCTCGGCTTCCATGGACTCACTCACCTTTGTCAAGGCCATGGATGACTCCAGCGTCACGGAGCACCAGAAGG  1231
            ||||||.||.|||||.|||||.||..||||||||||.|.|||||.||||||||..||..|||||||.|||||||
Sbjct 1404  CCGCTCAGCCTCCATAGACTCGCTGGCCTTTGTCAAAGGCATGGGTGACTCCACAGTGCCGGAGCAGCAGAAGG  1477

Query 1232  TGGAGCTGCTGCGGAAGGCCGTGCAGGCCCACCGAGGCTACACCGACCGGGCCATCCGCGGGGAGGCCTTTGAT  1305
            ||||||||||.||||||||.||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1478  TGGAGCTGCTCCGGAAGGCTGTGCAGGCCCACCGAGCCTACACTGACCGGGCCATCCGAGGGGAGGCCTTTGAC  1551

Query 1306  CGACACCTGCTGGGCCTGAAGCTGCAGGCCATCGAGGACCTGGTGAGCATGCCCGACATCTTCATGGACACCTC  1379
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1552  CGGCACCTGCTGGGTCTGAAGCTGCAGGCCATCGAGGACCTGGTCAGCATGCCTGACATCTTCATGGACACCTC  1625

Query 1380  CTACGCCATCGCCATGCACTTCCACCTCTCCACCAGCCAGGTCCCTGCCAAGACAGACTGTGTCATGTTCTTCG  1453
            .||||||||.||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  TTACGCCATTGCTATGCACTTCAACCTCTCTACCAGCCAGGTCCCTGCCAAGACAGACTGTGTCATGTTCTTCG  1699

Query 1454  GGCCCGTGGTCCCCGACGGCTACGGTGTCTGCTATAACCCCATGGAGGCCCACATCAACTTCTCCCTGTCGGCC  1527
            |.||.||||||||.||.||.||.||..|||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.||||.|||
Sbjct 1700  GACCTGTGGTCCCAGATGGTTATGGCATCTGCTACAACCCCATGGAGGCCCATATCAACTTCTCCGTGTCAGCC  1773

Query 1528  TACAACAGCTGCGCGGAGACCAACGCCGCCCGCCTGGCGCATTACCTGGAGAAGGCGCTCCTGGACATGCGTGC  1601
            |||||||||||.||.|||||||||||.||||||.||||.||.|||.|||||||.||.||.|||||||||||..|
Sbjct 1774  TACAACAGCTGTGCTGAGACCAACGCTGCCCGCATGGCTCACTACTTGGAGAAAGCTCTGCTGGACATGCGCAC  1847

Query 1602  CCTGCTGCAGAGCCACCCCCGGGCCAAGCTC  1632
            |||.||.||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct 1848  CCTACTCCAGAACCACCCCAGGGCCAAGCTC  1878