Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10748
• Subject: XM_006497646.3
• Aligned Length: 1911
• Identities: 1409
• Gaps: 297

Alignment

Query    1  ATGTTAGCCTTCGCTGCCAGGACCG---------------TGGTGAAGCCTCTGGGCTTCCTGAAGCCCTTCTC  59
            |||              .|||| ||               .|||.||.||.||||||.||||.|||||||.|||
Sbjct    1  ATG--------------GAGGA-CGAGCAGCAGAGAGAGAAGGTAAAACCCCTGGGCCTCCTCAAGCCCTCCTC  59

Query   60  CTTGATGAAGGCTTCCAGCCGCTTCAAGGCACACCAGGATGCACTGCCACGGCTGCCCGTGCCCCCTCTCCAGC  133
            |||||||||||.|||..|.|||||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.||||||||.||.||||
Sbjct   60  CTTGATGAAGGTTTCTGGTCGCTTCAAGGCCCACCAAGATGCACTGCCAAGGCTGCCTGTGCCCCCACTTCAGC  133

Query  134  AGTCCCTGGACCACTACCTGAAGGCGCTGCAGCCCATCGTGAGTGAGGAGGAGTGGGCCCACACCAAGCAGCTG  207
            |.|||||||||.|.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||
Sbjct  134  AATCCCTGGACTATTACCTCAAGGCACTGCAGCCCATCGTGAGTGAGGAAGAATGGGCTCACACCAAGCAACTG  207

Query  208  GTGGATGAGTTTCAGGCCTCAGGAGGTGTAGGGGAGCGCCTGCAGAAGGGGCTGGAGCGTCGGGCCAGGAAGAC  281
            |||||||||||||||.|||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||..||||||.|||.|.
Sbjct  208  GTGGATGAGTTTCAGACCTCAGGGGGCGTAGGGGAACGCCTACAGAAGGGACTGGAGCGCAGGGCCAAGAAAAT  281

Query  282  GGAGAACTGGCTGTCTGAGTGGTGGCTCAAGACCGCCTACCTCCAGTACCGCCAGCCTGTGGTCATCTACTCGA  355
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  282  GGAGAACTGGCTGTCCGAGTGGTGGCTCAAGACAGCCTATCTCCAGTTCCGCCAGCCTGTGGTCATCTACTCCA  355

Query  356  GCCCAGGCGTGATGCTACCCAAGCAGGACTTCGTGGACCTGCAGGGTCAGCTCCGATTTGCTGCCAAACTCATT  429
            |||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct  356  GCCCAGGAGTGATCCTGCCCAAGCAGGACTTTGTGGATCTACAGGGTCAGCTTCGGTTTGCTGCCAAACTCATC  429

Query  430  GAGGGTGTGTTGGATTTCAAGGTCATGATTGACAACGAGACCCTGCCCGTGGAGTACCTGGGGGGGAAGCCACT  503
            ||||||||.||||||||||||..||||||||||||.|||||.|||||.||.||||.||||||.||..||||.||
Sbjct  430  GAGGGTGTATTGGATTTCAAGTCCATGATTGACAATGAGACGCTGCCAGTTGAGTTCCTGGGAGGACAGCCGCT  503

Query  504  GTGCATGAACCAGTACTATCAGATCTTGTCCTCCTGCCGAGTGCCGGGCCCCAAGCAGGACACAGTCAGCAACT  577
            |||||||||||||||.|||||||||.||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||.||||....||||
Sbjct  504  GTGCATGAACCAGTATTATCAGATCCTGTCTTCTTGCCGTGTGCCCGGCCCCAAGCAGGACTCAGTGGTGAACT  577

Query  578  TCAGCAAGACCAAGAAGCCTCCCACGCACATCACCGTGGTACACAACTACCAGTTTTTTGAGCTGGATGTGTAC  651
            ||...|||.|.||||..||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  578  TCTTAAAGTCAAAGAGACCACCCACGCATATAACCGTGGTGCATAACTACCAGTTCTTCGAGCTGGATGTGTAC  651

Query  652  CACAGTGACGGGACACCCCTCACTGCGGATCAGATCTTTGTGCAGCTGGAGAAGATCTGGAACTCATCCCTACA  725
            |||||||||||.|||||.|||||..|.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||
Sbjct  652  CACAGTGACGGAACACCGCTCACCTCAGATCAGATCTTTGTGCAGCTAGAGAAAATATGGAATTCCTCACTGCA  725

Query  726  GACCAACAAGGAGCCTGTGGGCATCCTCACCTCCAACCACCGCAACTCCTGGGCCAAGGCATACAACACCCTCA  799
            ..|||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||.|||||
Sbjct  726  ATCCAACAAAGAGCCTGTTGGCATCCTAACCTCCAACCACCGAAACACCTGGGCCAAGGCCTACAACAACCTCA  799

Query  800  TCAAAGACAAGGTGAACCGGGATTCCGTGCGCTCCATCCAGAAG------------------------------  843
            |.||||||||.||.|||||.||.||.|||..||||||.||||||                              
Sbjct  800  TTAAAGACAAAGTTAACCGAGAGTCAGTGAACTCCATACAGAAGAGCATCTTCACCGTGTGCCTGGACAAGCAA  873

Query  844  --------------------------------------------------------------------------  843
                                                                                      
Sbjct  874  GTGCCTAGAGTCTCAGATGATGTCTACCGAAACCACGTAGCAGGCCAGATGCTACATGGTGGTGGTAGCAAGTT  947

Query  844  --------------------------------------------------------------------------  843
                                                                                      
Sbjct  948  CAACAGTGGCAACCGCTGGTTTGACAAGACACTGCAGTTCATCGTGGCAGAAGACGGCTCCTGTGGGATGGTGT  1021

Query  844  --------------------------------------------------------------------AAACCC  849
                                                                                ||.||.
Sbjct 1022  ATGAGCATGCAGCTGCAGAAGGGCCCCCCATAGTTGCACTTGTGGACCATGTCATGGAGTATACAAAAAAGCCT  1095

Query  850  GAGCTTGTGCGGTCTCCCATGGTGCCCCTGCCCATGCCCAAGAAGCTGCGGTTCAACATCACCCCCGAGATCAA  923
            |||||||||||||||||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1096  GAGCTTGTGCGGTCTCCTATGGTGCCCTTGCCAATGCCCAAGAAGCTGCGGTTCAACATCACACCTGAGATCAA  1169

Query  924  GAGCGACATCGAGAAGGCCAAGCAGAACCTCAGCATCATGATCCAGGACCTGGATATCACCGTGATGGT---GT  994
            ||.||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||   |||||.|   ||
Sbjct 1170  GAACGACATAGAGAAAGCCAAACAGAACCTCAGCATCATGATCCAGGACCTGGACATCA---TGATGCTGACGT  1240

Query  995  TCCACCATTTTGGAAAAGACTTCCCCAAGTCGGAGAAGCTAAGCCCAGATGCCTTCATCCAGATGGCTTTGCAG  1068
            ||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||..|||||
Sbjct 1241  TCCATCACTTTGGAAAGGACTTCCCCAAGTCCGAGAAGCTAAGCCCTGATGCCTTCATCCAGGTAGCCCTGCAG  1314

Query 1069  CTGGCCTACTACAGGATCTACGGACAGGCATGTGCCACCTATGAAAGTGCCTCCCTGCGCATGTTTCACCTGGG  1142
            |||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1315  CTGGCATACTACAGGATCTATGGGCAGGCGTGTGCCACGTATGAAAGTGCCTCTCTGCGCATGTTTCACCTGGG  1388

Query 1143  CCGCACCGACACCATCCGCTCGGCTTCCATGGACTCACTCACCTTTGTCAAGGCCATGGATGACTCCAGCGTCA  1216
            ||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||..||||||||||.|.|||||.||||||||..||..
Sbjct 1389  CCGCACTGACACCATCCGCTCAGCCTCCATAGACTCGCTGGCCTTTGTCAAAGGCATGGGTGACTCCACAGTGC  1462

Query 1217  CGGAGCACCAGAAGGTGGAGCTGCTGCGGAAGGCCGTGCAGGCCCACCGAGGCTACACCGACCG----------  1280
            |||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||.||||||.|||||          
Sbjct 1463  CGGAGCAGCAGAAGGTGGAGCTGCTCCGGAAGGCTGTGCAGGCCCACCGAGCCTACACTGACCGGATCTCCCAC  1536

Query 1281  -----GGCCATCCGCGGGGAGGCCTTTGATCGACACCTGCTGGGCCTGAAGCTGCAGGCCATCGAGGACCTGGT  1349
                 |||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1537  CCACAGGCCATCCGAGGGGAGGCCTTTGACCGGCACCTGCTGGGTCTGAAGCTGCAGGCCATCGAGGACCTGGT  1610

Query 1350  GAGCATGCCCGACATCTTCATGGACACCTCCTACGCCATCGCCATGCACTTCCACCTCTCCACCAGCCAGGTCC  1423
            .||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||
Sbjct 1611  CAGCATGCCTGACATCTTCATGGACACCTCTTACGCCATTGCTATGCACTTCAACCTCTCTACCAGCCAGGTCC  1684

Query 1424  CTGCCAAGACAGACTGTGTCATGTTCTTCGGGCCCGTGGTCCCCGACGGCTACGGTGTCTGCTATAACCCCATG  1497
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||..|||||||.|||||||||
Sbjct 1685  CTGCCAAGACAGACTGTGTCATGTTCTTCGGACCTGTGGTCCCAGATGGTTATGGCATCTGCTACAACCCCATG  1758

Query 1498  GAGGCCCACATCAACTTCTCCCTGTCGGCCTACAACAGCTGCGCGGAGACCAACGCCGCCCGCCTGGCGCATTA  1571
            ||||||||.||||||||||||.||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.||||.||.||
Sbjct 1759  GAGGCCCATATCAACTTCTCCGTGTCAGCCTACAACAGCTGTGCTGAGACCAACGCTGCCCGCATGGCTCACTA  1832

Query 1572  CCTGGAGAAGGCGCTCCTGGACATGCGTGCCCTGCTGCAGAGCCACCCCCGGGCCAAGCTC  1632
            |.|||||||.||.||.|||||||||||..||||.||.||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct 1833  CTTGGAGAAAGCTCTGCTGGACATGCGCACCCTACTCCAGAACCACCCCAGGGCCAAGCTC  1893