Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10748
• Subject: XM_006497648.2
• Aligned Length: 1896
• Identities: 1369
• Gaps: 330

Alignment

Query    1  ATGTTAGCCTTCGCTGCCAGGACCGTGGTGAAGCCTCTGGGCTTCCTGAAGCCCTTCTCCTTGATGAAGGCTTC  74
                                                                           |||||||.|||
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------------ATGAAGGTTTC  11

Query   75  CAGCCGCTTCAAGGCACACCAGGATGCACTGCCACGGCTGCCCGTGCCCCCTCTCCAGCAGTCCCTGGACCACT  148
            ..|.|||||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||.|.|
Sbjct   12  TGGTCGCTTCAAGGCCCACCAAGATGCACTGCCAAGGCTGCCTGTGCCCCCACTTCAGCAATCCCTGGACTATT  85

Query  149  ACCTGAAGGCGCTGCAGCCCATCGTGAGTGAGGAGGAGTGGGCCCACACCAAGCAGCTGGTGGATGAGTTTCAG  222
            ||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct   86  ACCTCAAGGCACTGCAGCCCATCGTGAGTGAGGAAGAATGGGCTCACACCAAGCAACTGGTGGATGAGTTTCAG  159

Query  223  GCCTCAGGAGGTGTAGGGGAGCGCCTGCAGAAGGGGCTGGAGCGTCGGGCCAGGAAGACGGAGAACTGGCTGTC  296
            .|||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||..||||||.|||.|.|||||||||||||||
Sbjct  160  ACCTCAGGGGGCGTAGGGGAACGCCTACAGAAGGGACTGGAGCGCAGGGCCAAGAAAATGGAGAACTGGCTGTC  233

Query  297  TGAGTGGTGGCTCAAGACCGCCTACCTCCAGTACCGCCAGCCTGTGGTCATCTACTCGAGCCCAGGCGTGATGC  370
            .|||||||||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct  234  CGAGTGGTGGCTCAAGACAGCCTATCTCCAGTTCCGCCAGCCTGTGGTCATCTACTCCAGCCCAGGAGTGATCC  307

Query  371  TACCCAAGCAGGACTTCGTGGACCTGCAGGGTCAGCTCCGATTTGCTGCCAAACTCATTGAGGGTGTGTTGGAT  444
            |.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  308  TGCCCAAGCAGGACTTTGTGGATCTACAGGGTCAGCTTCGGTTTGCTGCCAAACTCATCGAGGGTGTATTGGAT  381

Query  445  TTCAAGGTCATGATTGACAACGAGACCCTGCCCGTGGAGTACCTGGGGGGGAAGCCACTGTGCATGAACCAGTA  518
            ||||||..||||||||||||.|||||.|||||.||.||||.||||||.||..||||.|||||||||||||||||
Sbjct  382  TTCAAGTCCATGATTGACAATGAGACGCTGCCAGTTGAGTTCCTGGGAGGACAGCCGCTGTGCATGAACCAGTA  455

Query  519  CTATCAGATCTTGTCCTCCTGCCGAGTGCCGGGCCCCAAGCAGGACACAGTCAGCAACTTCAGCAAGACCAAGA  592
            .|||||||||.||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||.||||....||||||...|||.|.||||
Sbjct  456  TTATCAGATCCTGTCTTCTTGCCGTGTGCCCGGCCCCAAGCAGGACTCAGTGGTGAACTTCTTAAAGTCAAAGA  529

Query  593  AGCCTCCCACGCACATCACCGTGGTACACAACTACCAGTTTTTTGAGCTGGATGTGTACCACAGTGACGGGACA  666
            ..||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  530  GACCACCCACGCATATAACCGTGGTGCATAACTACCAGTTCTTCGAGCTGGATGTGTACCACAGTGACGGAACA  603

Query  667  CCCCTCACTGCGGATCAGATCTTTGTGCAGCTGGAGAAGATCTGGAACTCATCCCTACAGACCAACAAGGAGCC  740
            ||.|||||..|.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||..|||||||.|||||
Sbjct  604  CCGCTCACCTCAGATCAGATCTTTGTGCAGCTAGAGAAAATATGGAATTCCTCACTGCAATCCAACAAAGAGCC  677

Query  741  TGTGGGCATCCTCACCTCCAACCACCGCAACTCCTGGGCCAAGGCATACAACACCCTCATCAAAGACAAGGTGA  814
            |||.||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||.||||||.||||||||.||.|
Sbjct  678  TGTTGGCATCCTAACCTCCAACCACCGAAACACCTGGGCCAAGGCCTACAACAACCTCATTAAAGACAAAGTTA  751

Query  815  ACCGGGATTCCGTGCGCTCCATCCAGAAG---------------------------------------------  843
            ||||.||.||.|||..||||||.||||||                                             
Sbjct  752  ACCGAGAGTCAGTGAACTCCATACAGAAGAGCATCTTCACCGTGTGCCTGGACAAGCAAGTGCCTAGAGTCTCA  825

Query  844  --------------------------------------------------------------------------  843
                                                                                      
Sbjct  826  GATGATGTCTACCGAAACCACGTAGCAGGCCAGATGCTACATGGTGGTGGTAGCAAGTTCAACAGTGGCAACCG  899

Query  844  --------------------------------------------------------------------------  843
                                                                                      
Sbjct  900  CTGGTTTGACAAGACACTGCAGTTCATCGTGGCAGAAGACGGCTCCTGTGGGATGGTGTATGAGCATGCAGCTG  973

Query  844  -----------------------------------------------------AAACCCGAGCTTGTGCGGTCT  864
                                                                 ||.||.|||||||||||||||
Sbjct  974  CAGAAGGGCCCCCCATAGTTGCACTTGTGGACCATGTCATGGAGTATACAAAAAAGCCTGAGCTTGTGCGGTCT  1047

Query  865  CCCATGGTGCCCCTGCCCATGCCCAAGAAGCTGCGGTTCAACATCACCCCCGAGATCAAGAGCGACATCGAGAA  938
            ||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||.||||||.|||||
Sbjct 1048  CCTATGGTGCCCTTGCCAATGCCCAAGAAGCTGCGGTTCAACATCACACCTGAGATCAAGAACGACATAGAGAA  1121

Query  939  GGCCAAGCAGAACCTCAGCATCATGATCCAGGACCTGGATATCACCGTGATGGT---GTTCCACCATTTTGGAA  1009
            .|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||   |||||.|   ||||||.||.|||||||
Sbjct 1122  AGCCAAACAGAACCTCAGCATCATGATCCAGGACCTGGACATCA---TGATGCTGACGTTCCATCACTTTGGAA  1192

Query 1010  AAGACTTCCCCAAGTCGGAGAAGCTAAGCCCAGATGCCTTCATCCAGATGGCTTTGCAGCTGGCCTACTACAGG  1083
            |.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||..||||||||||.|||||||||
Sbjct 1193  AGGACTTCCCCAAGTCCGAGAAGCTAAGCCCTGATGCCTTCATCCAGGTAGCCCTGCAGCTGGCATACTACAGG  1266

Query 1084  ATCTACGGACAGGCATGTGCCACCTATGAAAGTGCCTCCCTGCGCATGTTTCACCTGGGCCGCACCGACACCAT  1157
            |||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1267  ATCTATGGGCAGGCGTGTGCCACGTATGAAAGTGCCTCTCTGCGCATGTTTCACCTGGGCCGCACTGACACCAT  1340

Query 1158  CCGCTCGGCTTCCATGGACTCACTCACCTTTGTCAAGGCCATGGATGACTCCAGCGTCACGGAGCACCAGAAGG  1231
            ||||||.||.|||||.|||||.||..||||||||||.|.|||||.||||||||..||..|||||||.|||||||
Sbjct 1341  CCGCTCAGCCTCCATAGACTCGCTGGCCTTTGTCAAAGGCATGGGTGACTCCACAGTGCCGGAGCAGCAGAAGG  1414

Query 1232  TGGAGCTGCTGCGGAAGGCCGTGCAGGCCCACCGAGGCTACACCGACCG---------------GGCCATCCGC  1290
            ||||||||||.||||||||.||||||||||||||||.||||||.|||||               |||||||||.
Sbjct 1415  TGGAGCTGCTCCGGAAGGCTGTGCAGGCCCACCGAGCCTACACTGACCGGATCTCCCACCCACAGGCCATCCGA  1488

Query 1291  GGGGAGGCCTTTGATCGACACCTGCTGGGCCTGAAGCTGCAGGCCATCGAGGACCTGGTGAGCATGCCCGACAT  1364
            ||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1489  GGGGAGGCCTTTGACCGGCACCTGCTGGGTCTGAAGCTGCAGGCCATCGAGGACCTGGTCAGCATGCCTGACAT  1562

Query 1365  CTTCATGGACACCTCCTACGCCATCGCCATGCACTTCCACCTCTCCACCAGCCAGGTCCCTGCCAAGACAGACT  1438
            |||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1563  CTTCATGGACACCTCTTACGCCATTGCTATGCACTTCAACCTCTCTACCAGCCAGGTCCCTGCCAAGACAGACT  1636

Query 1439  GTGTCATGTTCTTCGGGCCCGTGGTCCCCGACGGCTACGGTGTCTGCTATAACCCCATGGAGGCCCACATCAAC  1512
            ||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||..|||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1637  GTGTCATGTTCTTCGGACCTGTGGTCCCAGATGGTTATGGCATCTGCTACAACCCCATGGAGGCCCATATCAAC  1710

Query 1513  TTCTCCCTGTCGGCCTACAACAGCTGCGCGGAGACCAACGCCGCCCGCCTGGCGCATTACCTGGAGAAGGCGCT  1586
            ||||||.||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.||||.||.|||.|||||||.||.||
Sbjct 1711  TTCTCCGTGTCAGCCTACAACAGCTGTGCTGAGACCAACGCTGCCCGCATGGCTCACTACTTGGAGAAAGCTCT  1784

Query 1587  CCTGGACATGCGTGCCCTGCTGCAGAGCCACCCCCGGGCCAAGCTC  1632
            .|||||||||||..||||.||.||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct 1785  GCTGGACATGCGCACCCTACTCCAGAACCACCCCAGGGCCAAGCTC  1830