Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10748
• Subject: XM_017014275.1
• Aligned Length: 1892
• Identities: 1615
• Gaps: 271

Alignment

Query    1  ATGTTAGCCTTCGCTGCCAGGACCG--------------TGGTGAAGCCTCTGGGCTTCCTGAAGCCCTTCTCC  60
            |||...|           |||||.|              .||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGG-----------AGGACGGGCAGCAGAGAGAGAAGGTGAAGCCTCTGGGCTTCCTGAAGCCCTTCTCC  63

Query   61  TTGATGAAGGCTTCCAGCCGCTTCAAGGCACACCAGGATGCACTGCCACGGCTGCCCGTGCCCCCTCTCCAGCA  134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   64  TTGATGAAGGCTTCCAGCCGCTTCAAGGCACACCAGGATGCACTGCCACGGCTGCCCGTGCCCCCTCTCCAGCA  137

Query  135  GTCCCTGGACCACTACCTGAAGGCGCTGCAGCCCATCGTGAGTGAGGAGGAGTGGGCCCACACCAAGCAGCTGG  208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  138  GTCCCTGGACCACTACCTGAAGGCGCTGCAGCCCATCGTGAGTGAGGAGGAGTGGGCCCACACCAAGCAGCTGG  211

Query  209  TGGATGAGTTTCAGGCCTCAGGAGGTGTAGGGGAGCGCCTGCAGAAGGGGCTGGAGCGTCGGGCCAGGAAGACG  282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  212  TGGATGAGTTTCAGGCCTCAGGAGGTGTAGGGGAGCGCCTGCAGAAGGGGCTGGAGCGTCGGGCCAGGAAGACG  285

Query  283  GAGAACTGGCTGTCTGAGTGGTGGCTCAAGACCGCCTACCTCCAGTACCGCCAGCCTGTGGTCATCTACTCGAG  356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  286  GAGAACTGGCTGTCTGAGTGGTGGCTCAAGACCGCCTACCTCCAGTACCGCCAGCCTGTGGTCATCTACTCGAG  359

Query  357  CCCAGGCGTGATGCTACCCAAGCAGGACTTCGTGGACCTGCAGGGTCAGCTCCGATTTGCTGCCAAACTCATTG  430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  360  CCCAGGCGTGATGCTACCCAAGCAGGACTTCGTGGACCTGCAGGGTCAGCTCCGATTTGCTGCCAAACTCATTG  433

Query  431  AGGGTGTGTTGGATTTCAAGGTCATGATTGACAACGAGACCCTGCCCGTGGAGTACCTGGGGGGGAAGCCACTG  504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  434  AGGGTGTGTTGGATTTCAAGGTCATGATTGACAACGAGACCCTGCCCGTGGAGTACCTGGGGGGGAAGCCACTG  507

Query  505  TGCATGAACCAGTACTATCAGATCTTGTCCTCCTGCCGAGTGCCGGGCCCCAAGCAGGACACAGTCAGCAACTT  578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  508  TGCATGAACCAGTACTATCAGATCTTGTCCTCCTGCCGAGTGCCGGGCCCCAAGCAGGACACAGTCAGCAACTT  581

Query  579  CAGCAAGACCAAGAAGCCTCCCACGCACATCACCGTGGTACACAACTACCAGTTTTTTGAGCTGGATGTGTACC  652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  582  CAGCAAGACCAAGAAGCCTCCCACGCACATCACCGTGGTACACAACTACCAGTTTTTTGAGCTGGATGTGTACC  655

Query  653  ACAGTGACGGGACACCCCTCACTGCGGATCAGATCTTTGTGCAGCTGGAGAAGATCTGGAACTCATCCCTACAG  726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  656  ACAGTGACGGGACACCCCTCACTGCGGATCAGATCTTTGTGCAGCTGGAGAAGATCTGGAACTCATCCCTACAG  729

Query  727  ACCAACAAGGAGCCTGTGGGCATCCTCACCTCCAACCACCGCAACTCCTGGGCCAAGGCATACAACACCCTCAT  800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  730  ACCAACAAGGAGCCTGTGGGCATCCTCACCTCCAACCACCGCAACTCCTGGGCCAAGGCATACAACACCCTCAT  803

Query  801  CAAAGACAAGGTGAACCGGGATTCCGTGCGCTCCATCCA-----------------------------------  839
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                   
Sbjct  804  CAAAGACAAGGTGAACCGGGATTCCGTGCGCTCCATCCAGAAGAGCATCTTCACCGTGTGCCTAGATGCAACCA  877

Query  840  --------------------------------------------------------------------------  839
                                                                                      
Sbjct  878  TGCCCAGGGTCTCAGAAGACGTGTACCGCAGCCACGTGGCAGGCCAGATGCTGCATGGGGGCGGCAGCAGGCTC  951

Query  840  --------------------------------------------------------------------------  839
                                                                                      
Sbjct  952  AACAGCGGCAACCGCTGGTTCGACAAGACGCTGCAGTTCATCGTGGCAGAAGATGGCTCCTGTGGGCTTGTGTA  1025

Query  840  ---------------------------------------------------------------GAAGAAACCCG  850
                                                                           |||||||||||
Sbjct 1026  CGAGCATGCTGCAGCGGAGGGGCCCCCTATTGTCACCCTTCTGGACTATGTCATCGAGTACACGAAGAAACCCG  1099

Query  851  AGCTTGTGCGGTCTCCCATGGTGCCCCTGCCCATGCCCAAGAAGCTGCGGTTCAACATCACCCCCGAGATCAAG  924
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1100  AGCTTGTGCGGTCTCCCCTGGTGCCCCTGCCCATGCCCAAGAAGCTGCGGTTCAACATCACCCCCGAGATCAAG  1173

Query  925  AGCGACATCGAGAAGGCCAAGCAGAACCTCAGCATCATGATCCAGGACCTGGATATCACCGTGATGGTGTTCCA  998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1174  AGCGACATCGAGAAGGCCAAGCAGAACCTCAGCATCATGATCCAGGACCTGGATATCACCGTGATGGTGTTCCA  1247

Query  999  CCATTTTGGAAAAGACTTCCCCAAGTCGGAGAAGCTAAGCCCAGATGCCTTCATCCAGATGGCTTTGCAGCTGG  1072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1248  CCATTTTGGAAAAGACTTCCCCAAGTCGGAGAAGCTAAGCCCAGATGCCTTCATCCAGATGGCTTTGCAGCTGG  1321

Query 1073  CCTACTACAGGATCTACGGACAGGCATGTGCCACCTATGAAAGTGCCTCCCTGCGCATGTTTCACCTGGGCCGC  1146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322  CCTACTACAGGATCTACGGACAGGCATGTGCCACCTATGAAAGTGCCTCCCTGCGCATGTTTCACCTGGGCCGC  1395

Query 1147  ACCGACACCATCCGCTCGGCTTCCATGGACTCACTCACCTTTGTCAAGGCCATGGATGACTCCAGCGTCACGGA  1220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1396  ACCGACACCATCCGCTCGGCTTCCATGGACTCACTCACCTTTGTCAAGGCCATGGATGACTCCAGCGTCACGGA  1469

Query 1221  GCACCAGAAGGTGGAGCTGCTGCGGAAGGCCGTGCAGGCCCACCGAGGCTACACCGACCGGGCCATCCGCGGGG  1294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1470  GCACCAGAAGGTGGAGCTGCTGCGGAAGGCCGTGCAGGCCCACCGAGGCTACACCGACCGGGCCATCCGCGGGG  1543

Query 1295  AGGCCTTTGATCGACACCTGCTGGGCCTGAAGCTGCAGGCCATCGAGGACCTGGTGAGCATGCCCGACATCTTC  1368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1544  AGGCCTTTGATCGACACCTGCTGGGCCTGAAGCTGCAGGCCATCGAGGACCTGGTGAGCATGCCCGACATCTTC  1617

Query 1369  ATGGACACCTCCTACGCCATCGCCATGCACTTCCACCTCTCCACCAGCCAGGTCCCTGCCAAGACAGACTGTGT  1442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618  ATGGACACCTCCTACGCCATCGCCATGCACTTCCACCTCTCCACCAGCCAGGTCCCTGCCAAGACAGACTGTGT  1691

Query 1443  CATGTTCTTCGGGCCCGTGGTCCCCGACGGCTACGGTGTCTGCTATAACCCCATGGAGGCCCACATCAACTTCT  1516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1692  CATGTTCTTCGGGCCCGTGGTCCCCGACGGCTACGGTGTCTGCTATAACCCCATGGAGGCCCACATCAACTTCT  1765

Query 1517  CCCTGTCGGCCTACAACAGCTGCGCGGAGACCAACGCCGCCCGCCTGGCGCATTACCTGGAGAAGGCGCTCCTG  1590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1766  CCCTGTCGGCCTACAACAGCTGCGCGGAGACCAACGCCGCCCGCCTGGCGCATTACCTGGAGAAGGCGCTCCTG  1839

Query 1591  GACATGCGTGCCCTGCTGCAGAGCCACCCCCGGGCCAAGCTC  1632
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1840  GACATGCGTGCCCTGCTGCAGAGCCACCCCCGGGCCAAGCTC  1881