Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_10758
- Subject:
- XM_005269567.3
- Aligned Length:
- 1544
- Identities:
- 1318
- Gaps:
- 214
Alignment
Query 1 ATGAGACCAGGACTTCCAGGCCCCACAGGGTTGTGCGCTCAGACCTCAAGTAGGGGCCAGAAGAGTGTACTGAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACAGAAGGAAT----CTTGTGGAATTTGGCAGTTGTACCATTTTCTTAGCAGAAAACAGGAGCCCAGGTGGGAG 144
|| |||||||| |.||||.|||
Sbjct 1 ---------ATGGCCCTTGTGGA----------------------TAAGCACAAA------------------- 24
Query 145 CCATGTGTGTCGGGTTCCTCGTCAGGTGACGGTGCTGTTGCGGATCTCGCGGATGAGCTGAGGGGGTATCCAG- 217
||||.|.|||.|.|.| .||| |||
Sbjct 25 --------------------GTCAAGAGACAGCGAT----TGGA--------------------------CAGA 48
Query 218 CTTTGTGCTGCACGCTTCCTGTCCACTCATACAGGTCGTGGGCTGGTATCCGCCCCCAGATCATGAACGGCCCC 291
.||||| |..||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 49 ATTTGT-----------------------------------GAAGGTATCCGCCCCCAGATCATGAACGGCCCC 87
Query 292 CTGCACCCCCGCCCCCTGGTGGCGCTGCTGGACGGCCGCGACTGCACTGTGGAGATGCCCATCCTGAAGGACCT 365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 88 CTGCACCCCCGCCCCCTGGTGGCGCTGCTGGACGGCCGCGACTGCACTGTGGAGATGCCCATCCTGAAGGACCT 161
Query 366 GGCCACTGTGGCCTTCTGTGACGCGCAGTCGACGCAGGAAATCCACGAGAAGGTTCTAAACGAAGCCGTGGGCG 439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 162 GGCCACTGTGGCCTTCTGTGACGCGCAGTCGACGCAGGAAATCCACGAGAAGGTTCTAAACGAAGCCGTGGGCG 235
Query 440 CCATGATGTACCACACCATCACCCTCACCAGGGAGGACCTGGAGAAGTTCAAGGCCCTGAGAGTGATCGTGCGG 513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 236 CCATGATGTACCACACCATCACCCTCACCAGGGAGGACCTGGAGAAGTTCAAGGCCCTGAGAGTGATCGTGCGG 309
Query 514 ATAGGCAGTGGCTATGACAACGTGGACATCAAGGCTGCCGGCGAGCTCGGAATTGCCGTGTGCAACATCCCGTC 587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 310 ATAGGCAGTGGCTATGACAACGTGGACATCAAGGCTGCCGGCGAGCTCGGAATTGCCGTGTGCAACATCCCGTC 383
Query 588 TGCAGCCGTGGAAGAGACAGCGGACTCTACCATCTGCCACATCCTCAACCTGTACCGGAGGAACACGTGGCTGT 661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 384 TGCAGCCGTGGAAGAGACAGCGGACTCTACCATCTGCCACATCCTCAACCTGTACCGGAGGAACACGTGGCTGT 457
Query 662 ACCAGGCACTGCGGGAAGGCACGCGGGTTCAGAGCGTGGAGCAGATCCGCGAGGTGGCCTCGGGAGCGGCCCGC 735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 458 ACCAGGCACTGCGGGAAGGCACGCGGGTTCAGAGCGTGGAGCAGATCCGCGAGGTGGCCTCGGGAGCGGCCCGC 531
Query 736 ATCCGTGGGGAGACGCTGGGCCTCATTGGCTTTGGTCGCACGGGGCAGGCGGTTGCAGTTCGAGCCAAGGCCTT 809
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 532 ATCCGTGGGGAGACGCTGGGCCTCATTGGCTTTGGTCGCACGGGGCAGGCGGTTGCAGTTCGAGCCAAGGCCTT 605
Query 810 TGGATTCAGCGTCATATTTTATGACCCCTACTTGCAGGATGGGATCGAGCGGTCCCTGGGCGTGCAGAGGGTCT 883
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 606 TGGATTCAGCGTCATATTTTATGACCCCTACTTGCAGGATGGGATCGAGCGGTCCCTGGGCGTGCAGAGGGTCT 679
Query 884 ACACCCTGCAGGATTTGCTGTATCAGAGCGACTGCGTCTCCTTGCACTGCAATCTCAACGAACATAACCACCAC 957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 680 ACACCCTGCAGGATTTGCTGTATCAGAGCGACTGCGTCTCCTTGCACTGCAATCTCAACGAACATAACCACCAC 753
Query 958 CTCATCAATGACTTTACCATAAAGCAGATGAGGCAGGGAGCATTCCTTGTGAACGCAGCCCGTGGCGGCCTGGT 1031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 754 CTCATCAATGACTTTACCATAAAGCAGATGAGGCAGGGAGCATTCCTTGTGAACGCAGCCCGTGGCGGCCTGGT 827
Query 1032 GGACGAGAAAGCCTTAGCACAAGCCCTCAAGGAGGGCAGGATACGAAGGGCAGCCCTCGACGTGCATGAGTCAG 1105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 828 GGACGAGAAAGCCTTAGCACAAGCCCTCAAGGAGGGCAGGATACGAGGGGCAGCCCTCGACGTGCATGAGTCAG 901
Query 1106 AGCCCTTCAGCTTTGCTCAGGGTCCGTTGAAAGATGCCCCGAATCTCATCTGCACTCCTCACACTGCCTGGTAC 1179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 902 AGCCCTTCAGCTTTGCTCAGGGTCCGTTGAAAGATGCCCCGAATCTCATCTGCACTCCTCACACTGCCTGGTAC 975
Query 1180 AGTGAGCAGGCGTCACTGGAGATGAGGGAGGCAGCTGCCACCGAGATCCGCCGAGCCATCACAGGTCGCATCCC 1253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 976 AGTGAGCAGGCGTCACTGGAGATGAGGGAGGCAGCTGCCACCGAGATCCGCCGAGCCATCACAGGTCGCATCCC 1049
Query 1254 AGAAAGCTTAAGAAATTGTGTGAACAAGGAATTCTTTGTCACATCAGCGCCTTGGTCAGTAATAGACCAGCAAG 1327
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1050 AGAAAGCTTAAGAAATTGTGTGAACAAGGAATTCTTTGTCACATCAGCGCCTTGGTCAGTAATAGACCAGCAAG 1123
Query 1328 CAATTCATCCTGAGCTCAATGGTGCCACATACAGATATCCGCCAGGCATCGTGGGTGTGGCTCCAGGAGGACTT 1401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1124 CAATTCATCCTGAGCTCAATGGTGCCACATACAGATATCCGCCAGGCATCGTGGGTGTGGCTCCAGGAGGACTT 1197
Query 1402 CCTGCAGCCATGGAAGGGATCATCCCTGGAGGCATCCCAGTGACTCACAACCTCCCGACAGTGGCACATCCTTC 1475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 CCTGCAGCCATGGAAGGGATCATCCCTGGAGGCATCCCAGTGACTCACAACCTCCCGACAGTGGCACATCCTTC 1271
Query 1476 CCAAGCGCCCTCTCCCAACCAGCCCACAAAACACGGGGACAATCGAGAGCACCCCAACGAGCAA 1539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1272 CCAAGCGCCCTCTCCCAACCAGCCCACAAAACACGGGGACAATCGAGAGCACCCCAACGAGCAA 1335