Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10795
• Subject: NM_001351397.2
• Aligned Length: 1092
• Identities: 1038
• Gaps: 54

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------ATGAATGAACCACAGTGCTT  20
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGCCATCTCTACTTCCATCCCTGTAATTTCACAGCCCCAGTTCACAGCCATGAATGAACCACAGTGCTT  74

Query   21  CTACAACGAGTCCATTGCCTTCTTTTATAACCGAAGTGGAAAGCATCTTGCCACAGAATGGAACACAGTCAGCA  94
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTACAACGAGTCCATTGCCTTCTTTTATAACCGAAGTGGAAAGCATCTTGCCACAGAATGGAACACAGTCAGCA  148

Query   95  AGCTGGTGATGGGACTTGGAATCACTGTTTGTATCTTCATCATGTTGGCCAACCTATTGGTCATGGTGGCAATC  168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCTGGTGATGGGACTTGGAATCACTGTTTGTATCTTCATCATGTTGGCCAACCTATTGGTCATGGTGGCAATC  222

Query  169  TATGTCAACCGCCGCTTCCATTTTCCTATTTATTACCTAATGGCTAATCTGGCTGCTGCAGACTTCTTTGCTGG  242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TATGTCAACCGCCGCTTCCATTTTCCTATTTATTACCTAATGGCTAATCTGGCTGCTGCAGACTTCTTTGCTGG  296

Query  243  GTTGGCCTACTTCTATCTCATGTTCAACACAGGACCCAATACTCGGAGACTGACTGTTAGCACATGGCTCCTTC  316
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTTGGCCTACTTCTATCTCATGTTCAACACAGGACCCAATACTCGGAGACTGACTGTTAGCACATGGCTCCTTC  370

Query  317  GTCAGGGCCTCATTGACACCAGCCTGACGGCATCTGTGGCCAACTTACTGGCTATTGCAATCGAGAGGCACATT  390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTCAGGGCCTCATTGACACCAGCCTGACGGCATCTGTGGCCAACTTACTGGCTATTGCAATCGAGAGGCACATT  444

Query  391  ACGGTTTTCCGCATGCAGCTCCACACACGGATGAGCAACCGGCGGGTAGTGGTGGTCATTGTGGTCATCTGGAC  464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACGGTTTTCCGCATGCAGCTCCACACACGGATGAGCAACCGGCGGGTAGTGGTGGTCATTGTGGTCATCTGGAC  518

Query  465  TATGGCCATCGTTATGGGTGCTATACCCAGTGTGGGCTGGAACTGTATCTGTGATATTGAAAATTGTTCCAACA  538
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TATGGCCATCGTTATGGGTGCTATACCCAGTGTGGGCTGGAACTGTATCTGTGATATTGAAAATTGTTCCAACA  592

Query  539  TGGCACCCCTCTACAGTGACTCTTACTTAGTCTTCTGGGCCATTTTCAACTTGGTGACCTTTGTGGTAATGGTG  612
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGCACCCCTCTACAGTGACTCTTACTTAGTCTTCTGGGCCATTTTCAACTTGGTGACCTTTGTGGTAATGGTG  666

Query  613  GTTCTCTATGCTCACATCTTTGGCTATGTTCGCCAGAGGACTATGAGAATGTCTCGGCATAGTTCTGGACCCCG  686
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTTCTCTATGCTCACATCTTTGGCTATGTTCGCCAGAGGACTATGAGAATGTCTCGGCATAGTTCTGGACCCCG  740

Query  687  GCGGAATCGGGATACCATGATGAGTCTTCTGAAGACTGTGGTCATTGTGCTTGGGGCCTTTATCATCTGCTGGA  760
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCGGAATCGGGATACCATGATGAGTCTTCTGAAGACTGTGGTCATTGTGCTTGGGGCCTTTATCATCTGCTGGA  814

Query  761  CTCCTGGATTGGTTTTGTTACTTCTAGACGTGTGCTGTCCACAGTGCGACGTGCTGGCCTATGAGAAATTCTTC  834
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTCCTGGATTGGTTTTGTTACTTCTAGACGTGTGCTGTCCACAGTGCGACGTGCTGGCCTATGAGAAATTCTTC  888

Query  835  CTTCTCCTTGCTGAATTCAACTCTGCCATGAACCCCATCATTTACTCCTACCGCGACAAAGAAATGAGCGCCAC  908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTCTCCTTGCTGAATTCAACTCTGCCATGAACCCCATCATTTACTCCTACCGCGACAAAGAAATGAGCGCCAC  962

Query  909  CTTTAGGCAGATCCTCTGCTGCCAGCGCAGTGAGAACCCCACCGGCCCCACAGAAGGCTCAGACCGCTCGGCTT  982
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTTAGGCAGATCCTCTGCTGCCAGCGCAGTGAGAACCCCACCGGCCCCACAGAAGGCTCAGACCGCTCGGCTT  1036

Query  983  CCTCCCTCAACCACACCATCTTGGCTGGAGTTCACAGCAATGACCACTCTGTGGTT  1038
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCTCCCTCAACCACACCATCTTGGCTGGAGTTCACAGCAATGACCACTCTGTGGTT  1092