Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_10805
- Subject:
- XM_024446675.1
- Aligned Length:
- 3066
- Identities:
- 2088
- Gaps:
- 975
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCTACTGAAGGGGCTGCCCAGTTAGGGAACAGAGTGGCGGGCATGGTGTGTAGCCTATGGGTGCTGCTCCT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGTGTCTTCAGTTCTGGCTCTGGAAGAGGTATTGCTGGACACCACCGGAGAGACATCTGAGATTGGCTGGCTCA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CCTACCCACCAGGGGGGTGGGACGAGGTGAGTGTTCTGGACGACCAGCGACGCCTGACTCGGACCTTTGAGGCA 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TGTCATGTGGCAGGGGCCCCTCCAGGCACCGGGCAGGACAATTGGTTGCAGACACACTTTGTGGAGCGGCGCGG 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 GGCCCAGAGGGCGCACATTCGACTCCACTTCTCTGTGCGGGCATGCTCCAGCCTGGGTGTGAGCGGCGGCACCT 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 GCCGGGAGACCTTCACCCTTTACTACCGTCAGGCTGAGGAGCCCGACAGCCCTGACAGCGTTTCCTCCTGGCAC 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 CTCAAACGCTGGACCAAGGTGGACACAATTGCAGCAGACGAGAGCTTTCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTC 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 CTCTTCTTCCTCTGCAGCGTGGGCTGTGGGACCCCACGGGGCTGGGCAGCGGGCTGGACTGCAACTGAACGTCA 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 AAGAGCGGAGCTTTGGGCCTCTCACCCAACGCGGCTTCTACGTGGCCTTCCAGGACACGGGGGCCTGCCTGGCC 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 CTGGTCGCTGTCAGGCTCTTCTCCTACACCTGCCCTGCCGTGCTCCGATCCTTTGCTTCCTTTCCAGAGACGCA 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 GGCCAGTGGGGCTGGGGGGGCCTCCCTGGTGGCAGCTGTGGGCACCTGTGTGGCTCATGCAGAGCCAGAGGAGG 814
Query 1 -----------------------------------------------------------------ATGGTAGCT 9
|||||||||
Sbjct 815 ATGGAGTAGGGGGCCAGGCAGGAGGCAGCCCCCCCAGGCTGCACTGCAACGGGGAGGGCAAGTGGATGGTAGCT 888
Query 10 GTCGGGGGCTGCCGCTGCCAGCCTGGATACCAACCAGCACGAGGAGACAAGGCCTGCCAAGCCTGCCCACGGGG 83
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTCGGGGGCTGCCGCTGCCAGCCTGGATACCAACCAGCACGAGGAGACAAGGCCTGCCAAGCCTGCCCACGGGG 962
Query 84 GCTCTATAAGTCTTCTGCTGGGAATGCTCCCTGCTCACCATGCCCTGCCCGCAGTCACGCTCCCAACCCAGCAG 157
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCTCTATAAGGCTTCTGCTGGGAATGCTCCCTGCTCACCATGCCCTGCCCGCAGTCACGCTCCCAACCCAGCAG 1036
Query 158 CCCCCGTTTGCCCCTGCCTGGAGGGCTTCTACCGGGCCAGTTCCGACCCACCAGAGGCCCCCTGCACTGGTCCT 231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCCCCGTTTGCCCCTGCCTGGAGGGCTTCTACCGGGCCAGTTCCGACCCACCAGAGGCCCCCTGCACTGGTCCT 1110
Query 232 CCATCGGCTCCCCAGGAGCTTTGGTTTGAGGTGCAAGGCTCAGCACTCATGCTACACTGGCGCCTGCCTCGGGA 305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CCATCGGCTCCCCAGGAGCTTTGGTTTGAGGTGCAAGGCTCAGCACTCATGCTACACTGGCGCCTGCCTCGGGA 1184
Query 306 GCTGGGGGGTCGAGGGGACCTGCTCTTCAATGTCGTGTGCAAGGAGTGTGAAGGCCGCCAGGAACCTGCCAGCG 379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCTGGGGGGTCGAGGGGACCTGCTCTTCAATGTCGTGTGCAAGGAGTGTGAAGGCCGCCAGGAACCTGCCAGCG 1258
Query 380 GTGGTGGGGGCACTTGTCACCGCTGCAGGGATGAGGTCCACTTCGACCCTCGCCAGAGAGGCCTGACTGAGAGC 453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GTGGTGGGGGCACTTGTCACCGCTGCAGGGATGAGGTCCACTTCGACCCTCGCCAGAGAGGCCTGACTGAGAGC 1332
Query 454 CGAGTGTTAGTGGGGGGACTCCGGGCACACGTACCCTACATCTTAGAGGTGCAGGCTGTTAATGGGGTGTCTGA 527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CGAGTGTTAGTGGGGGGACTCCGGGCACACGTACCCTACATCTTAGAGGTGCAGGCTGTTAATGGGGTGTCTGA 1406
Query 528 GCTCAGCCCTGACCCTCCTCAGGCTGCAGCCATCAATGTCAGCACCAGCCATGAAGTGCCCTCTGCTGTCCCTG 601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GCTCAGCCCTGACCCTCCTCAGGCTGCAGCCATCAATGTCAGCACCAGCCATGAAGTGCCCTCTGCTGTCCCTG 1480
Query 602 TGGTGCACCAGGTGAGCCGGGCATCCAACAGCATCACGGTGTCCTGGCCGCAGCCCGACCAGACCAATGGGAAC 675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGGTGCACCAGGTGAGCCGGGCATCCAACAGCATCACGGTGTCCTGGCCGCAGCCCGACCAGACCAATGGGAAC 1554
Query 676 ATCCTGGACTATCAGCTCCGCTACTATGACCAGGCAGAAGACGAATCCCACTCCTTCACCCTGACCAGCGAGAC 749
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ATCCTGGACTATCAGCTCCGCTACTATGA--------------------------------------------- 1583
Query 750 CAACACTGCCACCGTGACACAGCTGAGCCCTGGCCACATCTATGGTTTCCAGGTGCGGGCCCGGACTGCTGCCG 823
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1584 ------------------------------------------------CCAGGTGCGGGCCCGGACTGCTGCCG 1609
Query 824 GCCACGGCCCCTACGGGGGCAAAGTCTATTTCCAGACACTTCCTCAAGGGGAGCTGTCTTCCCAGCTTCCGGAA 897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1610 GCCACGGCCCCTACGGGGGCAAAGTCTATTTCCAGACACTTCCTCAAGGGGAGCTGTCTTCCCAGCTTCCAGAA 1683
Query 898 AGACTCTCCTTGGTGATCGGCTCCATCCTGGGGGCTTTGGCCTTCCTCCTGCTGGCAGCCATCACCGTGCTGGC 971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1684 AGACTCTCCTTGGTGATCGGCTCCATCCTGGGGGCTTTGGCCTTCCTCCTGCTGGCAGCCATCACCGTGCTGGC 1757
Query 972 GGTCGTCTTCCAGCGGAAGCGGCGTGGGACTGGCTACACGGAGCAGCTGCAGCAATACAGCAGCCCAGGACTCG 1045
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1758 GGTCGTCTTCCAGCGGAAGCGGCGTGGGACTGGCTACACAGAGCAGCTGCAGCAATACAGCAGCCCAGGACTCG 1831
Query 1046 GGGTGAAGTATTACATCGACCCCTCCACCTACGAGGACCCCTGTCAGGCCATCCGAGAACTTGCCCGGGAAGTC 1119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1832 GGGTGAAGTATTACATCGACCCCTCCACCTACGAGGACCCCTGTCAGGCCATCCGAGAACTTGCCCGGGAAGTC 1905
Query 1120 GATCCTGCTTATATCAAGATTGAGGAGGTCATTGGGACAGGCTCTTTTGGAGAAGTGCGCCAGGGCCGCCTGCA 1193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1906 GATCCTGCTTATATCAAGATTGAGGAGGTCATTGGGACAGGCTCTTTTGGAGAAGTGCGCCAGGGCCGCCTGCA 1979
Query 1194 GCCACGGGGACGGAGGGAGCAGACTGTGGCCATCCAGGCCCTGTGGGCCGGGGGCGCCGAAAGCCTGCAGATGA 1267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980 GCCACGGGGACGGAGGGAGCAGACTGTGGCCATCCAGGCCCTGTGGGCCGGGGGCGCCGAAAGCCTGCAGATGA 2053
Query 1268 CCTTCCTGGGCCGGGCCGCAGTGCTGGGTCAGTTCCAGCACCCCAACATCCTGCGGCTGGAGGGCGTGGTCACC 1341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2054 CCTTCCTGGGCCGGGCCGCAGTGCTGGGTCAGTTCCAGCACCCCAACATCCTGCGGCTGGAGGGCGTGGTCACC 2127
Query 1342 AAGAGCCGACCCCTCATGGTGCTGACGGAGTTCATGGAGCTTGGCCCCCTGGACAGCTTCCTCAGGCAGCGGGA 1415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2128 AAGAGCCGACCCCTCATGGTGCTGACGGAGTTCATGGAGCTTGGCCCCCTGGACAGCTTCCTCAG---GCGGGA 2198
Query 1416 GGGCCAGTTCAGCAGCCTGCAGCTGGTGGCCATGCAGCGGGGAGTGGCTGCTGCCATGCAGTACCTGTCCAGCT 1489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2199 GGGCCAGTTCAGCAGCCTGCAGCTGGTGGCCATGCAGCGGGGAGTGGCTGCTGCCATGCAGTACCTGTCCAGCT 2272
Query 1490 TTGCCTTCGTCCATCGCTCGCTGTCTGCCCACAGCGTGCTGGTGAATAGCCACTTGGTGTGCAAGGTGGCCCGT 1563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2273 TTGCCTTCGTCCATCGCTCGCTGTCTGCCCACAGCGTGCTGGTGAATAGCCACTTGGTGTGCAAGGTGGCCCGT 2346
Query 1564 CTTGGCCACAGTCCTCAGGGCCCAAGTTGTTTGCTTCGCTGGGCAGCCCCAGAGGTCATTGCACATGGAAAGCA 1637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2347 CTTGGCCACAGTCCTCAGGGCCCAAGTTGTTTGCTTCGCTGGGCAGCCCCAGAGGTCATTGCACATGGAAAGCA 2420
Query 1638 TACAACATCCAGTGATGTCTGGAGCTTTGGGATACTCATGTGGGAAGTGATGAGTTATGGAGAACGGCCTTACT 1711
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2421 TACAACATCCAGTGATGTCTGGAGCTTTGGGATACTCATGTGGGAAGTGATGAGTTATGGAGAACGGCCTTACT 2494
Query 1712 GGGACATGAGTGAGCAGGAGGTACTAAATGCAATAGAGCAGGAGTTCCGGCTGCCCCCGCCTCCAGGCTGTCCT 1785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2495 GGGACATGAGTGAGCAGGAGGTACTAAATGCAATAGAGCAGGAGTTCCGGCTGCCCCCGCCTCCAGGCTGTCCT 2568
Query 1786 CCTGGATTACATCTACTTATGTTGGACACTTGGCAGAAGGACCGTGCCCGGCGGCCTCATTTTGACCAGCTGGT 1859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2569 CCTGGATTACATCTACTTATGTTGGACACTTGGCAGAAGGACCGTGCCCGGCGGCCTCATTTTGACCAGCTGGT 2642
Query 1860 GGCTGCATTTGACAAGATGATCCGCAAGCCAGATACCCTGCAGGCTGGCGGGGACCCAGGGGAAAGGCCTTCCC 1933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2643 GGCTGCATTTGACAAGATGATCCGCAAGCCAGATACCCTGCAGGCTGGCGGGGACCCAGGGGAAAGGCCTTCCC 2716
Query 1934 AGGCCCTTCTGACCCCTGTGGCCCTGGACTTTCCTTGTCTGGACTCACCCCAGGCCTGGCTTTCAGCCATTGGA 2007
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2717 AGGCCCTTCTGACCCCTGTGGCCCTGGACTTTCCTTGTCTGGACTCACCCCAGGCCTGGCTTTCAGCCATTGGA 2790
Query 2008 CTGGAGTGCTACCAGGACAACTTCTCCAAGTTTGGCCTCTGTACCTTCAGTGATGTGGCTCAGCTCAGCCTAGA 2081
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2791 CTGGAGTGCTACCAGGACAACTTCTCCAAGTTTGGCCTCTGTACCTTCAGTGATGTGGCTCAGCTCAGCCTAGA 2864
Query 2082 AGACCTGCCTGCCCTGGGCATCACCCTGGCTGGCCACCAGAAGAAGCTGCTGCACCACATCCAGCTCCTTCAGC 2155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2865 AGACCTGCCTGCCCTGGGCATCACCCTGGCTGGCCACCAGAAGAAGCTGCTGCACCACATCCAGCTCCTTCAGC 2938
Query 2156 AACACCTGAGGCAGCAGGGCTCAGTGGAGGTC 2187
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2939 AACACCTGAGGCAGCAGGGCTCAGTGGAGGTC 2970