Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_10835
- Subject:
- XM_011535713.2
- Aligned Length:
- 1416
- Identities:
- 1233
- Gaps:
- 174
Alignment
Query 1 ATGCCTTATTTTACAAGACTCATTTTGTTCTTGTTTTGCTTGATGGTTCTCGTGGAGAGCAGAAAACCCAAGAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GAAGCGATGGA---------CAG---GG--CAGG--TGGAAATGCCCAAGCCAAGTCACTTATATAAGAAGAAC 132
||||| ||| || |||| ||| ||| ||||
Sbjct 1 ------ATGGATTACACATTCAGCCTGGCCCAGGGATGG-----------------CAC----ATAA------- 40
Query 133 CTTGATGTGACCAAGATCCGGAAGGGAAAGCCTCAGCAGCTTCTCAGA----GTGGA-CGAGCACGACTTCAGC 201
||.|||.|.|| ||.|.|| ||||| .|||| |||
Sbjct 41 -------------------GGCAGGCACAG-----------TCCCTGACGTTGTGGAGAGAGC------TCA-- 76
Query 202 ATGAGACCCGCCTTCGGAGGCCCTGCCATCCCGGTGGGCGTGGACGTACAGGTGGAGAGCCTGGACAGCATCTC 275
||.||||..| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 77 --GACACCCAAC-----AGGCCCTGCCATCCCGGTGGGCGTGGACGTACAGGTGGAGAGCCTGGACAGCATCTC 143
Query 276 CGAGGTGGACATGGACTTCACTATGACCCTGTACCTGCGGCATTACTGGAAGGATGAGAGGCTAGCTTTCTCCA 349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 144 CGAGGTGGACATGGACTTCACTATGACCCTGTACCTGCGGCATTACTGGAAGGATGAGAGGCTAGCTTTCTCCA 217
Query 350 GCGCCAGCAACAAGAGCATGACCTTCGATGGCCGGCTGGTGAAGAAGATCTGGGTCCCTGATGTCTTCTTTGTT 423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 218 GCGCCAGCAACAAGAGCATGACCTTCGATGGCCGGCTGGTGAAGAAGATCTGGGTCCCTGATGTCTTCTTTGTT 291
Query 424 CACTCCAAAAGATCGTTCACTCATGACACCACCACTGACAACATCATGCTGAGGGTGTTCCCAGATGGACACGT 497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 292 CACTCCAAAAGATCGTTCACTCATGACACCACCACTGACAACATCATGCTGAGGGTGTTCCCAGATGGACACGT 365
Query 498 GCTGTACAGCATGAGGATTACGGTCACTGCCATGTGCAACATGGACTTCAGCCACTTTCCCCTGGACTCCCAGA 571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 366 GCTGTACAGCATGAGGATTACGGTCACTGCCATGTGCAACATGGACTTCAGCCACTTTCCCCTGGACTCCCAGA 439
Query 572 CCTGTTCTTTGGAGCTGGAGAGCTATGCCTATACAGATGAAGATCTAATGCTGTACTGGAAGAATGGGGATGAA 645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 440 CCTGTTCTTTGGAGCTGGAGAGCTATGCCTATACAGATGAAGATCTAATGCTGTACTGGAAGAATGGGGATGAA 513
Query 646 TCCCTAAAAACAGATGAGAAGATCTCCTTGTCTCAGTTTCTGATTCAGAAATTTCACACAACTTCCAGGCTGGC 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 514 TCCCTAAAAACAGATGAGAAGATCTCCTTGTCTCAGTTTCTGATTCAGAAATTTCACACAACTTCCAGGCTGGC 587
Query 720 CTTCTACAGCAGCACTGGCTGGTACAACCGTCTGTACATTAACTTCACGTTGCGTCGCCACATCTTCTTCTTCT 793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 588 CTTCTACAGCAGCACTGGCTGGTACAACCGTCTGTACATTAACTTCACGTTGCGTCGCCACATCTTCTTCTTCT 661
Query 794 TGCTCCAAACATATTTCCCTGCCACTCTGATGGTCATGCTGTCCTGGGTGTCCTTCTGGATCGACCGCAGAGCT 867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 662 TGCTCCAAACATATTTCCCTGCCACTCTGATGGTCATGCTGTCCTGGGTGTCCTTCTGGATCGACCGCAGAGCT 735
Query 868 GTGCCTGCCAGAGTTTCACTGGGTATCACGACGGTGCTGACCATGACCACCATCATCACGGGCGTGAATGCCTC 941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 736 GTGCCTGCCAGAGTTTCACTGGGTATCACGACGGTGCTGACCATGACCACCATCATCACGGGCGTGAATGCCTC 809
Query 942 CATGCCGCGCGTCTCCTACGTCAAGGCCGTGGACATCTACCTCTGGGTCAGCTTTGTGTTCGTGTTCCTCTCGG 1015
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 810 CATGCCGCGCGTCTCCTACGTCAAGGCCGTGGACATCTACCTCTGGGTCAGCTTTGTGTTCGTGTTCCTCTCGG 883
Query 1016 TGCTGGAGTATGCGGCTGTCAACTACCTGACCACCGTGCAGGAGCGCAAGGAACGGAAGCTGCGGGAGAAGTTC 1089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 884 TGCTGGAGTATGCGGCTGTCAACTACCTGACCACCGTGCAGGAGCGCAAGGAACGGAAGCTGCGGGAGAAGTTC 957
Query 1090 CCGTGCATGTGTGGAATGCTTCATTCAAAAACCATGATGCTGGATGGAAGCTACAGTGAGTCTGAGGCCAACAG 1163
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 CCGTGCATGTGTGGAATGCTTCATTCAAAAACCATGATGCTGGATGGAAGCTACAGTGAGTCTGAGGCCAACAG 1031
Query 1164 CCTGGCTGGGTACCCCAGAAGCCATATCCTGACAGAAGAAGAAAGGCAAGACAAAATAGTGGTCCACCTGGGCC 1237
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032 CCTGGCTGGGTACCCCAGAAGCCATATCCTGACAGAAGAAGAAAGGCAAGACAAAATAGTGGTCCACCTGGGCC 1105
Query 1238 TGAGTGGTGAAGCCAACGCTGCCAGAAAGAAGGGGCTTCTGAAGGGCCAGACGGGTTTTCGTATCTTCCAGAAT 1311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106 TGAGTGGTGAAGCCAACGCTGCCAGAAAGAAGGGGCTTCTGAAGGGCCAGACGGGTTTTCGTATCTTCCAGAAT 1179
Query 1312 ACCCATGCCATTGACAAATACTCTAGGTTGATATTCCCTGCCTCCTACATATTTTTCAACTTAATTTATTGGTC 1385
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180 ACCCATGCCATTGACAAATACTCTAGGTTGATATTCCCTGCCTCCTACATATTTTTCAACTTAATTTATTGGTC 1253
Query 1386 AGTGTTTTCC 1395
||||||||||
Sbjct 1254 AGTGTTTTCC 1263